[发明专利]一种针对疾病个体化用药的基因分型快速试纸条检测方法有效

专利信息
申请号: 201210171346.9 申请日: 2012-05-29
公开(公告)号: CN102776279A 公开(公告)日: 2012-11-14
发明(设计)人: 张秦鲁;魏旭旭;朱娟莉;惠文利;崔亚丽 申请(专利权)人: 西安金磁纳米生物技术有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 西安智邦专利商标代理有限公司 61211 代理人: 陈广民
地址: 710077 陕西省西安市高新区丈*** 国省代码: 陕西;61
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摘要:
搜索关键词: 一种 针对 疾病 个体化 用药 基因 快速 试纸 检测 方法
【权利要求书】:

1.一种针对疾病个体化用药的基因分型快速试纸条检测方法,其特征在于,包括以下步骤:

(1)针对待检测样本基因组DNA的CYP2C19*2(681G>A)、CYP2C19*3(636G>A)、CYP2C19*17(-806C>T)这三个SNP位点,对每一个SNP位点均设计一条野生型特异性引物、一条突变型特异性引物和一条共用引物进行识别与扩增;在野生型特异性引物和突变型特异性引物的5′端均标记地高辛,共用引物的5′端标记生物素;

(2)针对一个SNP位点,平行做两管PCR反应,其中一管加入共用引物与等量的突变型特异性引物,另一管中加入共用引物与等量的野生型特异性引物,两管的PCR反应条件相同并同时置于PCR仪中反应;这样,对于(1)步骤中所述的三个SNP位点,共做六管PCR反应;Taq聚合酶的特异性决定了PCR反应能否顺利进行;

(3)利用链亲和素金磁微粒特有的可目视化特性,采用层析技术并以生物素和链亲和素作用,对步骤(2)得到的扩增产物中SNP基因型完成分型检测;

其中,层析技术采用的试纸条满足:

a、试剂条的免疫层析膜上的质控线处包被有质控用生物素;

b、检测线处包被有捕获用抗地高辛抗体;

c、结合垫上喷涂有链亲和素金磁微粒;

经步骤(2)取出的两管PCR产物分别滴至两支试纸条的样品垫上进行检测,质控线显色表明此次实验有效,即步骤(2)的该管PCR反应顺利,即得到的产物一端标记有生物素,另一端标记有地高辛,滴加至上样垫,一端的生物素与链亲和素磁粒特异性结合之后,通过层析作用上移至检测线处,另一端上的地高辛与检测线上的抗地高辛抗体特异性结合显色,由此判断出其基因型:

滴加含有野生型特异性引物的PCR产物在试纸条的检测线上显色,而含有突变型特异性引物的PCR产物在试纸条的检测线上不显色,则表明基因型为野生型;反之基因型为突变型;若两支试纸条的检测线均显色,则表明基因型为杂合型。

2.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,步骤(1)中设计的引物序列如下:

CYP2C19*2(681G>A)引物序列:

  引物名称  序列  CYP2C19*2F:  5′Biotin-ACAACCAGAGCTTGGCATATTGT-3′  CYP2C19*2R(M):  5′Dig-GGTTTTTAAGTAATTTGTTATGGGTTGCT-3′  CYP2C19*2R(Wt):  5′Dig-TTTTTAAGTAATTTGTTATGGGTTGCC-3′

CYP2C19*3(636G>A)引物序列:

  引物名称  序列  CYP2C19*3F:  5′Biotin-TGTGCTCCCTGCAATGTGAT-3′  CYP2C19*3R(M):  5′Dig-AAAAAACTTGGCCTTACCTGGAAT-3′  CYP2C19*3R(Wt):  5′Dig-AAAAACTTGGCCTTACCTGGAAC-3′

CYP2C19*17(-806C>T)引物序列:

  引物名称  序列  CYP2C19*17F(M):  5’Dig-ATTTGTGTCTTCTGTTCTCAAATT-3’  CYP2C19*17F(Wt):  5’Dig-ATTTGTGTCTTCTGTTCTCAAACC-3’  CYP2C19*17R:  5’Biotin-CTGGGATTTGAGCTGAGGTCTT-3’

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