[发明专利]多态性检测用探针、多态性检测方法、药效判定方法以及多态性检测用试剂盒有效
申请号: | 201210132135.4 | 申请日: | 2012-04-27 |
公开(公告)号: | CN102766682A | 公开(公告)日: | 2012-11-07 |
发明(设计)人: | 井口亚希 | 申请(专利权)人: | 爱科来株式会社 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 北京东方亿思知识产权代理有限责任公司 11258 | 代理人: | 肖善强 |
地址: | 日本*** | 国省代码: | 日本;JP |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 多态性 检测 探针 方法 药效 判定 以及 试剂盒 | ||
1.一种多态性检测用探针,其为从包括下述P1和P1’的组中选择的一种荧光标记寡核苷酸,用于检测ABCC2基因的多态性:
(P1)荧光标记寡核苷酸,其为含有序列编号1所示的序列中的第207位~第217位的碱基的碱基长为11~60的序列,该序列除了与序列编号1中的第217位的碱基对应的碱基为胞嘧啶之外相对于具有与序列编号1相同的碱基的碱基序列具有至少80%以上的同一性,并且与序列编号1所示的序列中的第217位的碱基对应的碱基用荧光染料标记;以及
(P1’)荧光标记寡核苷酸,其为含有序列编号1所示的序列中的第207位~第217位的碱基的碱基长为11~60的序列,该序列除了与序列编号1中的第217位的碱基对应的碱基为胞嘧啶之外与具有和序列编号1相同的碱基的碱基序列的互补链在严谨条件下杂交,并且与序列编号1所示的序列中的第217位的碱基对应的碱基用荧光染料标记。
2.根据权利要求1所述的多态性检测用探针,其中,所述多态性检测用探针是下述P1或下述P1’的所述荧光标记核苷酸,
(P1-1)荧光标记寡核苷酸,其为含有序列编号1所示的序列中的第207位~第217位的碱基的碱基长为11~60的序列,该序列除了与序列编号1的第217位的碱基对应的碱基为胞嘧啶之外相对于具有与序列编号1相同的碱基的碱基序列具有至少80%以上的同一性,并且与序列编号1所示的序列中的第217位的碱基对应的碱基用荧光染料标记,并且该荧光标记寡核苷酸识别序列编号1的第207位的碱基的多态性;或者
(P1’-1)荧光标记寡核苷酸,其为含有序列编号1所示的序列中的第207位~第217位的碱基的碱基长为11~60的序列,该序列除了与序列编号1中的第217位的碱基对应的碱基为胞嘧啶之外与具有和序列编号1相同的碱基的碱基序列的互补链在严谨条件下杂交,并且与序列编号1所示的序列中的第217位的碱基对应的碱基用荧光染料标记,并且该荧光标记寡核苷酸识别序列编号1的第207位的碱基的多态性。
3.根据权利要求1或2所述的多态性检测用探针,其中,所述荧光标记寡核苷酸在从3’末端起数第1位~第3位具有用荧光染料标记的第217位的碱基。
4.根据权利要求1至3中任一项所述的多态性检测用探针,其中,所述荧光标记寡核苷酸在3’末端具有用荧光染料标记的第217位的碱基。
5.根据权利要求1至4中任一项所述的多态性检测用探针,其中,所述荧光标记寡核苷酸在未与靶标序列杂交时发出荧光,并且在与该靶标序列杂交时荧光强度减少或增加。
6.根据权利要求1至5中任一项所述的多态性检测用探针,其中,所述荧光标记寡核苷酸在未与靶标序列杂交时发出荧光,并且在与该靶标序列杂交时荧光强度减少。
7.根据权利要求1至6中任一项所述的多态性检测用探针,其中,所述荧光标记寡核苷酸的碱基长为12~55。
8.根据权利要求1至7中任一项所述的多态性检测用探针,其中,所述荧光标记寡核苷酸的碱基长为15~45。
9.根据权利要求1至8中任一项所述的多态性检测用探针,其中,所述荧光标记寡核苷酸的碱基长为18~35。
10.根据权利要求1至9中任一项所述的多态性检测用探针,其中,所述多态性检测用探针为用于分析熔解曲线的探针。
11.根据权利要求1至10中任一项所述的多态性检测用探针,其中,所述多态性检测用探针具有序列编号4、序列编号5、序列编号6、序列编号7、序列编号8、序列编号9、序列编号10、序列编号11、序列编号12、序列编号13、序列编号14、序列编号15或序列编号16所示的碱基序列。
12.一种多态性检测方法,其通过使用权利要求1至11中任一项所述的多态性检测用探针来检测ABCC2基因的多态性。
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