[发明专利]黄牛WNT10B基因的单核苷酸多态性位点及其检测方法有效
申请号: | 201210114964.X | 申请日: | 2012-04-18 |
公开(公告)号: | CN102649962A | 公开(公告)日: | 2012-08-29 |
发明(设计)人: | 陈宏;赵静;张春雷;房兴堂 | 申请(专利权)人: | 江苏师范大学 |
主分类号: | C12N15/12 | 分类号: | C12N15/12;C12Q1/68 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 221116 江苏*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 黄牛 wnt10b 基因 核苷酸 多态性 及其 检测 方法 | ||
1.黄牛WNT10B基因单核苷酸多态性位点,其特征在于,该基因单核苷酸多态性包括:
黄牛WNT10B基因第220位点为A或G的单核苷酸多态性位点;和
第3980位点为G或T的单核苷酸多态性位点。
2.黄牛WNT10B基因单核苷酸多态性位点的检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)、以包含WNT10B基因的待测黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P1为引物,PCR扩增黄牛WNT10B基因获得第一扩增产物,并用限制性内切酶NaeI酶切第一扩增产物;
(2)、以引物对P3为引物,PCR扩增黄牛WNT10B基因获得第三扩增产物,并用限制性内切酶ApaI酶切第三扩增产物;
(3)、分别对步骤(1)和(2)酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳;根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛WNT10B基因第220和3980位的单核苷酸多态性;
所述的引物对P1为:
上游引物F1:ggggaaactg aggcaaagag a;
下游引物R1:agcgggcaag cacagaact;
所述的引物对P3为:
上游引物F3:tcagacctac ccctatccacac;
下游引物R3:aaacgccagg aagacccag。
3.如权利要求2所述的黄牛WNT10B基因的单核苷酸多态性位点的检测方法,其特征在于,步骤(1)中的PCR扩增反应程序为:95℃预变性5min;94℃变性45s,66.0℃退火45s,72℃延伸45s,30~35个循环;72℃延伸10min;
步骤(2)中PCR扩增反应程序为:95℃预变性5min;94℃变性45s,65.5℃退火45s,72℃延伸45s,30~35个循环;72℃延伸10min。
4.如权利要求2所述的黄牛WNT10B基因的单核苷酸多态性位点的检测方法,其特征在于,所述的琼脂糖凝胶电泳所采用的琼脂糖凝胶的质量浓度为2.5%。
5.如权利要求2所述的黄牛WNT10B基因的单核苷酸多态性位点的检测方法,其特征在于,根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛WNT10B基因的单核苷酸多态性为:
第220位点为A或G的单核苷酸多态性,表现为AA、AG、GC三种基因型;和
第3980位点为G或T的单核苷酸多态性,表现为GG、GT、TT三种基因型。
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