[发明专利]染色体5p15区段SNP检测特异性引物和液相芯片无效
| 申请号: | 201210105865.5 | 申请日: | 2012-04-11 |
| 公开(公告)号: | CN103374601A | 公开(公告)日: | 2013-10-30 |
| 发明(设计)人: | 许嘉森;刘志明 | 申请(专利权)人: | 广州益善生物技术有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11;C40B40/06 |
| 代理公司: | 广州华进联合专利商标代理有限公司 44224 | 代理人: | 万志香 |
| 地址: | 510663 广东省广州市广州科*** | 国省代码: | 广东;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 染色体 p15 区段 snp 检测 特异性 引物 芯片 | ||
1.一种染色体5p15区段SNP检测液相芯片,其特征在于,包括有:(A).针对染色体5p15区段不同SNP位点分别设计的野生型和突变型的ASPE引物:每种ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对目的基因SNP位点的特异性引物序列组成,所述特异性引物序列为:针对C101T位点的SEQ ID NO.9及SEQ IDNO.10,针对C107T位点的SEQ ID NO.11及SEQ ID NO.12,针对C105A位点的SEQID NO.13及SEQ ID NO.14,和/或针对C150T位点的SEQ ID NO.15及SEQ IDNO.16;所述tag序列选自SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.8;
(B).包被有anti-tag序列的、具有不同颜色编码的微球,所述anti-tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列;所述anti-tag序列选自SEQ ID NO.17~SEQID NO.24,且所述anti-tag序列能相应地与(A)中所选的tag序列互补配对;
(C).用于扩增出需要检测的、具有相应SNP位点的目标序列的引物。
2.根据权利要求1所述的染色体5p15区段SNP检测液相芯片,其特征在于,所述扩增引物为:针对C101T位点的SEQ ID NO.25及SEQ ID NO.26,针对C107T位点的SEQ ID NO.27及SEQ ID NO.28,针对C105A位点的SEQ ID NO.29及SEQID NO.30,和/或针对C150T位点的SEQ ID NO.31及SEQ ID NO.32。
3.根据权利要求1所述的染色体5p15区段SNP检测液相芯片,其特征在于,所述ASPE引物为:针对C101T位点的由SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.9组成的序列及由SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.10组成的序列,针对C107T位点的由SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.11组成的序列及由SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.12组成的序列,针对C105A位点的由SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.13组成的序列及由SEQ ID NO.6和SEQ ID NO.14组成的序列,和/或针对C150T位点的由SEQ ID NO.7和SEQ IDNO.15组成的序列及由SEQ ID NO.8和SEQ ID NO.16组成的序列。
4.根据权利要求1所述的染色体5p15区段SNP检测液相芯片,其特征在于,(A).所述ASPE引物为:针对C101T位点的由SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.9组成的序列及由SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.10组成的序列,针对C107T位点的由SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.11组成的序列及由SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.12组成的序列,针对C105A位点的由SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.13组成的序列及由SEQ ID NO.6和SEQ ID NO.14组成的序列,和针对C150T位点的由SEQ ID NO.7和SEQ ID NO.15组成的序列及由SEQ ID NO.8和SEQ ID NO.16组成的序列;(B).包被有anti-tag序列的、具有不同颜色编码的微球,所述anti-tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列;所述anti-tag序列选自SEQ ID NO.17~SEQID NO.24,且所述anti-tag序列能相应地与(A)中所选的tag序列互补配对;(C).所述扩增引物为:针对C101T位点的SEQ ID NO.25及SEQ ID NO.26,针对C107T位点的SEQ ID NO.27及SEQ ID NO.28,针对C105A位点的SEQ ID NO.29及SEQ ID NO.30,和针对C150T位点的SEQ ID NO.31及SEQ ID NO.32。
5.根据权利要求1-4任一项所述的染色体5p15区段SNP检测液相芯片,其特征在于,所述间隔臂为5-10个T。
6.用于染色体5p15区段多态性检测的特异性引物,其特征在于,所述特异性引物序列为:针对C101T位点的SEQ ID NO.9及SEQ ID NO.10,针对C107T位点的SEQ ID NO.11及SEQ ID NO.12,针对C105A位点的SEQ ID NO.13及SEQ IDNO.14,和/或针对C150T位点的SEQ ID NO.15及SEQ ID NO.16。
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