[发明专利]一种检测肝癌相关风险基因的试剂盒无效
申请号: | 201210094755.3 | 申请日: | 2012-03-31 |
公开(公告)号: | CN103361404A | 公开(公告)日: | 2013-10-23 |
发明(设计)人: | 任峻;张华忠 | 申请(专利权)人: | 浙江爱易生物医学科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 316000 浙江省舟*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 肝癌 相关 风险 基因 试剂盒 | ||
技术领域
本发明涉及分子生物学和医学领域,更具体的,本发明涉及一种检测肝癌相关风险基因的试剂盒,通过同时检测与肝癌关联的基因MICA和HLA-DQ的单核苷酸多态性位点基因型来评估个体罹患肝癌的风险性。
背景技术
肝癌是指发生于肝脏的恶性肿瘤,包括原发性肝癌和转移性肝癌两种,人们常说的肝癌指的多是原发性肝癌。原发性肝癌是临床上最常见的恶性肿瘤之一,根据最新统计,全世界每年新发肝癌患者约六十万,居恶性肿瘤的第五位。随着人类在基因方面的不断深入研究,先已发现了两个与肝癌相关的风险基因,分别是MICA和HLA-DQ。
MHC-I类链相关基因(Major histocompatibility complex class I chain-related gene,MIC)定位于人类第6号染色体MHC-I类基因区域,包括MICA、MICB、MICC
、MICD、MICE、MICF和MICG,其中仅MICA、MICB为功能基因,可编码功能蛋白,其它5种均为假基因。
MICA基因编码的蛋白产物属于膜蛋白,分为胞外区、跨膜区和胞浆区。MICA的表达具有组织特异性,研究发现MICA蛋白仅表达于新鲜分离的内皮细胞、成纤维细胞和胃肠道上皮细胞表面。在各种变异细胞,特别是上皮细胞来的肿瘤细胞中MICA分子的表达可发生上调。病毒感染、受热等也会引起MICA表达的变化,因此MICA被认为是一种应激性蛋白。NKG2D(the actiating killer cell lectin-like receptor K ,NKG2D)是MICA的受体,可表达于多种免疫细胞,在NK、γδ+T细胞和CD8+T细胞介导的对肿瘤和感染的免疫反应中起重要作用,参与适应性及固有性免疫应答。
MICA已被发现在多种肿瘤中出现高表达,如乳腺癌、肺癌、消化道肿瘤、前列腺癌等,并且这些肿瘤中会出现高水平的γδ+T细胞浸润,γδ+T细胞通过识别MICA分子对表达MICA的细胞有较强的细胞毒作用,这种肿瘤免疫监视机制在早期对抗肿瘤有一定积极作用。Wagsater等研究了直肠癌中MICAmRNA的表达水平,发现直肠癌中MICA的表达水平增高,提示MICA可能是免疫系统实施免疫监视的效应分子之一。免疫系统通过MICA与NKG2D的结合,激活NK等免疫细胞以清除肿瘤细胞。
人类MHC主要为人白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA),分为Ⅰ类和Ⅱ类。MHCⅡ类分子只在少数细胞表达,如树突状细胞、B淋巴细胞等,其中最具代表性的为HLA-DR和HLA-DQ抗原。HLA-DR,-DQ通过MHCⅡ类分子限制的T细胞对外来抗原的识别,在介导淋巴细胞活化、抗原递呈等机体免疫应答和免疫调节过程中发挥重要的作用。
经过研究,我们认为HLA-DR和-DQ在肝癌组织中的表达机制有一下可能:(1)肝癌细胞中有明显的低甲基化和局部高甲基化,Ⅱ类分子表达主要受Ⅱ类反式激活因子(Class Ⅱ trans – activator,CⅡTA)的调控,CⅡTA启动子由DNA甲基化调控,使用5-aza-CdR处理后或传染CⅡTA基因均可诱导上述瘤细胞MHCⅡ的表达,并使瘤细胞恢复抗原处理和递呈的功能,而达到增强CTL和抗体依赖的特异免疫反应的目的。在人类肿瘤中,如绒癌、白血病、T细胞来源的恶性肿瘤以及视网膜母细胞均缺乏MHCⅡ的表达,其机制也与CⅡTA的高甲基化有关。(2)肿瘤组织刺激机体产生炎症反应,浸润型T细胞释放多种细胞因子,这些细胞因子有诱导肿瘤细胞表达HLA-DR等。IFN-γ等多种细胞因子对血源性或非血源性的组织都能够诱导其表达HLAⅡ类分子,但提前是CⅡTA基因必须是未甲基化的。在我国HCC多数伴有HBV感染,因此在慢性肝炎、肝硬化及肝癌这个发展过程中,CⅡTA基因发生不同程度的低甲基化,在炎症细胞释放的细胞因子的诱导下,肝癌细胞发生不同程度的HLA分子的表达。
总之,正常肝细胞中是不表达或弱表达的,在肝癌细胞中HLAⅡ类分子的表达可能是按照上述两个可能的顺序发生的。首先是要有CⅡTA启动子去甲基化,然后由IFN-γ等细胞因子提供促进HLA表达的信号。
发明内容
基于MICA基因、HLA-DQ基因上的2个SNPs位点多态性可用来评估个体罹患肝癌风险性的基础上,本发明提供一种检测肝癌相关风险基因的试剂盒。
试剂盒包括:
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