[发明专利]抑制流感病毒复制的宿主相关基因及其筛选方法和应用

说明书

技术领域

本发明属于生物技术领域，特别涉及抑制流感病毒复制的宿主相关基因及其筛选方法和应用。

背景技术

病毒感染宿主后需要利用宿主细胞的代谢过程完成病毒自身的复制，在这一过程病毒必然会调控宿主细胞内基因组的表达，抑制抗病毒基因表达，增强对病毒复制有益的基因表达。因此，病毒感染宿主细胞后，宿主细胞内表达变化的这些基因往往和病毒复制有密切的关系。通过生物学手段筛选宿主细胞内这些基因，具有机体针对病毒免疫和病毒复制机制的研究价值，同时具有潜在预防和治疗流感病毒感染的应用价值。

病毒入侵宿主过程伴随着宿主基因表达变化，最终决定感染细胞和病毒各自的命运。DNA微阵列技术结合生物信息学技术的数据分析方法，为研究细胞基因表达谱变化提供了前所未有的高通量的研究工具。微阵列已广泛的应用于人、小鼠和大鼠基因表达领域的研究，高密度微阵列已越来越多的用来分析病毒感染宿主诱导的宿主细胞基因表达差异，例如，艾滋病病毒(Human immunodeficiency virus，HIV)(Solis et al.(2006)Virology.352(1)：86-99)登革热病毒(Dengue virus，DV)(Fink et al.(2007)PLoS Negl Trop Dis.1(2)：e86)麻疹病毒(Measles virus，MV)(Sato et al.(2008)Virology.375(2)：321-330)、狂犬病病毒(Rabies virus，RV)(Ubol et al.(2005)Microbiol Immunol.49(5)：423-431)和猴免疫缺陷病毒(Simian immunodeficiency virus，SIV)(George et al.(2003)Virology.312(1)：84-94)。

由于动物基因组信息数据库的不完善，应用特异性的动物基因组微阵列研究一直滞后于人或小鼠相关领域的进展。早期曾用人基因组的微阵列(Affymetrix Human)研究牛、猪和犬等的基因表达情况(Ji et al.(2004)Int J Cancer.112(5)：803-814；Shah et al.(2004)Clin Transplant.Suppl 12：76-80)，直到Qiagen公司研制的(Qiagen-NRSP8 array)第一代大规模的猪基因表达谱分析芯片出现，微阵列上固定了13297cDNAs和ESTs数据库中挑选的猪基因组探针(Zhao et al.(2005)Genomics.86(5)：618-625)。现在使用的Affymetrix猪全基因组芯片广泛用来研究猪全基因组转录谱，获得了众多研究成果(Tsai et al.(2004)J Virol.78(20)：11360-11370；Shi et al.2009)J Genvirol.90(Pt 7)：1670-1680)。

流感病毒为正粘病毒科流感病毒属分节段单股负链RNA病毒。病毒粒子刚分离时呈多晶形，在体内传代后变成球形，直径80-120nm(Palese，et al.，2007)。病毒粒子由质量比分别是0.8-1％的RNA、70-75％的蛋白质、20％的脂类和5-8％的糖类组成。