[发明专利]一种与非贲门癌辅助诊断相关的SNP标志物及其应用

说明书

发明领域

本发明属于基因工程及肿瘤医学领域，涉及一种与非贲门癌辅助诊断相关的SNP标志物及其应用。

背景技术

胃癌是全球最常见的恶性肿瘤之一。据世界卫生组织估计，2008年全球范围内大约100万胃癌新发病例，占全部肿瘤发病的7.8％，仅次于肺癌、乳腺癌和结直肠癌。超过70％的胃癌病例发生在发展中国家，其中50％发生在中国。在我国，胃癌年龄标化发病率男性为41.3/10万，女性为18.5/10万，仅次于肺癌。大约90％-95％的胃癌为腺癌，起源于胃部上皮组织。从解剖学上可分为贲门癌和非贲门癌。贲门癌是发生在胃贲门部食管胃交界线下2cm范围内的腺癌。非贲门癌主要包括发生在胃底、胃角、胃窦和幽门部恶性肿瘤。根据国内以往的统计，贲门癌约占全部胃癌的20％，而非贲门癌占据了80％。尽管在全球范围内胃癌的发病率及死亡率均处于下降趋势，而我国仍处于较高发病的及死亡水平。随着人口基数的不断增大和胃癌期望寿命的延长，庞大的胃癌，特别是非贲门癌患病和死亡人数，将在未来相当长一段时期内给我国带来严重的负担，仍然是肿瘤预防及控制的重点。

目前，胃癌的初步诊断方法主要为病史询问、体格检查、实验室检查、胃肠X线检查、纤维内窥镜检查、脱落细胞学检查、B超以及CT检查、肿瘤标记物检测等。鉴别诊断主要依靠X线钡餐造影、胃镜和活组织病理检查。但是现在临床常用的X线钡餐造影和纤维内窥镜检查也存在一些弊端。X线钡餐造影对局部粘膜上较小的肿瘤难以发现，或难以肯定；检查有一定的盲区，可能漏掉小病变，不能确定病变的性质，可能有假阳性或假阴性。纤维内窥镜检查对胃壁整体蠕动情况及胃的形态观察欠完整；对肿瘤的浸润深度、有无转移了解不清；对外压性肿物还是胃壁内肿物难以区别。目前临床所用胃癌标志物特异性不强。血清癌胚抗原(CEA)对诊断意义不大，虽半数患者的胃液中CEA有明显升高，超过100ng/ml，但也与慢性萎缩性胃炎的胃液中含量有重叠。病理活组织检查作为胃癌诊断的金标准，在临床胃癌确诊中居于重要地位，但由于需要做胃镜取尾部组织，不适合作为临床健康筛查。

胃癌的形成是一个复杂的多因素、多阶段的过程，从慢性萎缩性胃炎、肠化生、不典型增生等癌前病变最终进展为胃癌。不过目前其确切发病机制还不是很清楚。宏观流行病学及遗传流行病学研究表明，胃癌的发生是环境因素和个体遗传因素共同作用的结果。其中，幽门螺杆菌(H.pylori)感染已经在1993年被世界卫生组织(WHO)确认为一级致癌物，是胃癌的明确危险因素。然而，相同的环境危险因素暴露下仅有少数个体最终发生胃癌，这说明不同个体对环境暴露的反应存在不同的易感性，这种易感性目前被认为是由个体的遗传因素所决定。例如，全球人群的H.pylori感染率大约在40％-80％，但其中只有1％的H.pylori感染患者进展为胃癌，这说明遗传因素在胃癌的发生发展中起了重要的作用。单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism，SNP)是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。它是人类可遗传的变异中最常见的一种。SNP的存在被认为赋予了个体不同的表型性状，以及对于环境暴露、药物治疗等因素的不同反应性，因此SNP可能是导致个体对常见疾病发病和预后易感性差异的重要遗传基础。利用疾病易感的SNP谱预测疾病的发生，不仅灵敏、准确和快速，具有广阔的应用前景，而且通过SNP预测谱的构建，还可以实现中国古语中“上医治未病”的理想，对疾病作出前瞻性的“基因诊断”。近年来，利用SNP预测疾病的发生发展已经成为临床和科研工作者的研究热点，在肿瘤和心脑血管疾病等常见重大疾病预测上的应用价值已初见端倪。

然而，目前还没有将SNP应用于非贲门癌诊断的报道，若能筛选出非贲门癌易感的SNP作为生物标志物，并研制相应的诊断试剂盒，对我国非贲门癌诊断现状必将是一次有力的推动，也为其药物筛选、药效评价及靶向治疗开辟了新的途径。

发明内容

本发明的目的是针对上述技术问题，提出一种与非贲门癌辅助诊断相关的SNP标志物及其应用。

本发明的第二个目的是提供上述SNP标志物的特异性引物。

本发明的第三个目的是提供上述SNP标志物的特异性荧光探针对。

本发明的第四个目的是提供上述SNP标志物及其特异性引物和特异性荧光探针在制备非贲门癌辅助诊断试剂盒中的应用。

本发明第五个目的是提供非贲门癌辅助诊断试剂盒。