[发明专利]一种使用N-硫代化合物用于寡核苷酸合成的新方法无效
申请号: | 201180037035.7 | 申请日: | 2011-06-30 |
公开(公告)号: | CN103298823A | 公开(公告)日: | 2013-09-11 |
发明(设计)人: | 何义刚;维克托·索罗金;维斯瓦夫·亚当·马祖尔 | 申请(专利权)人: | 集润德斯股份公司 |
主分类号: | C07H1/00 | 分类号: | C07H1/00;C07H21/00 |
代理公司: | 北京集佳知识产权代理有限公司 11227 | 代理人: | 彭鲲鹏;卢蓓 |
地址: | 美国俄*** | 国省代码: | 美国;US |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 使用 化合物 用于 寡核苷酸 合成 新方法 | ||
1.一种用于合成寡核苷酸的方法,该方法包括使用具有通式(I)的硫化剂:
其中
R是选自由通过环形碳原子而结合到S原子上的芳基基团和杂芳基基团组成的组;
R1和R2独立地是有机残基,优选是C1.C20烃残基,任选是不饱和的或芳香族的;
用于硫化所述寡核苷酸的前体的至少一个磷核苷酸间连键。
2.根据权利要求1所述的方法,其中R是卤苯基或烷基苯基,优选是4.卤苯基,尤其优选是4.氯苯基。
3.根据权利要求1和2中任一项所述的方法,其中R1和R2选自低级烷基或环烷基(C1.C7)、苯基包括取代的苯基、和萘基基团,更优选是甲基基团。
4.根据权利要求1至3中任一项所述的方法,其中将该硫化剂溶解在有机溶剂中,该有机溶剂优选是卤代烃溶剂。
5.根据权利要求1至4中任一项所述的方法,其中硫化剂与待硫化的磷核苷酸间连键的摩尔比是从1.0到2.0。
6.根据权利要求1至5中任一项所述的方法,其中所述寡核苷酸的前体包含选自以下项的核苷:核糖核苷类、2’.脱氧核糖核苷类、2’.取代的核糖核苷类、2’-4’-锁-核糖核苷类、3’-氨基-核糖核苷类、3’-氨基-2’-脱氧核糖核苷类。
7.根据权利要求1至6中任一项所述的方法,其中该磷核苷酸间连键是H-膦酸酯二酯键。
8.根据权利要求7所述的方法,其中该偶联是在溶液相中进行的。
9.根据权利要求1至8中任一项所述的方法,该方法进一步包括将根据权利要求1至8中任一项获得的寡核苷酸进行纯化的步骤。
10.根据权利要求9所述的方法,该方法包括至少沉淀该寡核苷酸。
11.根据权利要求9或10所述的方法,进一步包括用溶剂提取该寡核苷酸。
12.根据权利要求10或11所述的方法,该方法包括将该寡核苷酸溶解在极性有机溶剂中,该极性有机溶剂优选选自二氯甲烷、氯仿、乙腈、丙酮和吡啶。
13.根据权利要求12所述的方法,其中使用范围从约0.5(n+1)mL到约2.0(n+1)mL、优选是约1.0(n+1)mL的溶剂体积,其中n是硫代磷酸酯三酯连键的毫摩尔数。
14.根据权利要求12或13所述的方法,其中用非极性有机溶剂处理该寡核苷酸的溶液直到该溶液变浑浊,该非极性有机溶剂优选选自:烃类、醚溶剂以及它们的混合物。
15.根据权利要求14所述的方法,其中使用范围从约1(n+1)mL到约4(n+1)mL、优选是约2.0(n+1)mL的溶剂体积,其中n是硫代磷酸酯三酯连键的毫摩尔数。
16.根据权利要求14或15所述的方法,其中用沉淀助剂来处理该浑浊溶液。
17.根据权利要求16所述的方法,其中该沉淀助剂选自惰性的多孔固体,这些多孔固体优选选自硅藻土、炭、木质纤维素、以及色谱固定相,例如硅胶或氧化铝。
18.根据权利要求16或17所述的方法,其中该沉淀助剂使用的量值的范围是从约0.25(n+1)g到约1.5(n+1)g、优选是约0.75(n+1)g,其中n是硫代磷酸酯三酯连键的毫摩尔数。
19.根据权利要求16所述的方法,其中在添加该沉淀助剂后,用第二级分的非极性有机溶剂处理该混合物,其中一般来说所述级分的体积范围从约1(n+1)mL到约4(n+1)mL,优选是约2.0(n+1)mL,其中n是硫代磷酸酯三酯连键的毫摩尔数。
20.根据权利要求16到19中任一项所述的方法,其中将在该沉淀步骤中获得的这些固体材料过滤出来并且洗涤。
21.根据权利要求10到20中任一项所述的方法,其中用溶剂从该含寡核苷酸的沉淀中提取该寡核苷酸。
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