[发明专利]用于临床局限性前列腺癌患者的基于基因的PSA复发预测无效
申请号: | 201180017903.5 | 申请日: | 2011-03-31 |
公开(公告)号: | CN102939534A | 公开(公告)日: | 2013-02-20 |
发明(设计)人: | D.塔兰托夫;T.杰特克;Y.张;Y.王;J.F.帕尔马 | 申请(专利权)人: | 维里德克斯有限责任公司 |
主分类号: | G01N33/48 | 分类号: | G01N33/48 |
代理公司: | 中国专利代理(香港)有限公司 72001 | 代理人: | 孔青;梁谋 |
地址: | 美国新*** | 国省代码: | 美国;US |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 临床 局限性 前列腺癌 患者 基于 基因 psa 复发 预测 | ||
1. 一种用于区分在前列腺癌的高复发危险类别中的受试者和在前列腺癌的低复发危险类别中的受试者的分类器,所述分类器包括:
至少两种诊断标记的各自表达水平,每种表达水平相对于两种或更多种对照标记的平均水平进行测量;和
基于Kattan列线图的预测概率,其与所述至少两种诊断标记的表达水平组合,以将受试者指定至前列腺癌的高复发危险类别和前列腺癌的低复发危险类别之一。
2. 根据权利要求1所述的分类器,其中所述Kattan列线图是基于下组中的两个或更多个成员的复合测量:术前(和激素疗法前,如果接受过该疗法的话)PSA值、前列腺切除术时的PSA、手术时的主要格里森、手术时的次要格里森、前列腺切除术格里森总和、前列腺切除术年份、无疾病月数、手术切缘是否是阳性的、癌症是否在精囊中发现、是否存在包膜外延伸、癌症是否在淋巴结中发现(若有被取出)、放射治疗前PSA、辐射剂量(如果适用)、手术切缘是阳性还是阴性的(如果适用)、是否存在精囊牵涉(如果适用)、是否存在淋巴结牵涉(如果适用)、是否存在包膜外牵涉(如果适用)、是否开出新辅助激素处方、是否开出新辅助放射处方。
3. 根据权利要求1所述的分类器,其中所述Kattan列线图是基于下组中的两个或更多个成员的复合测量:治疗前PSA水平、组合的格里森级别、样品格里森总和、临床分期、手术切缘状态、在活组织检查核心中癌症的核心总长度中的前列腺包膜侵袭最大癌症长度、核心阳性水平百分比、前列腺外延伸、前列腺外延伸水平、细胞凋亡指数、一个或多个核心中的癌症百分比、一个或多个核心中的高级别癌症百分比、总肿瘤体积、癌症的定位区、精囊侵袭的存在情况、精囊侵袭的类型、p53、Ki-67、p27、DNA倍性状态、淋巴结状态和淋巴管侵袭。
4. 根据权利要求1所述的分类器,其包括诊断标记MYH11、SSBP1和DPT。
5. 根据权利要求2所述的分类器,其除MYH11、SSBP1和DPT外还包括选自表2的除组蛋白1 H3d外的诊断标记。
6. 根据权利要求1所述的分类器,其中所述对照标记是TUBA、ALAS1和ACTG1。
7. 根据权利要求1所述的分类器,其中所述诊断标记选自表2中呈现的除组蛋白1 H3d外的标记集合。
8. 根据权利要求1所述的分类器,其中对照标记针对如通过RT-PCR检测的相对稳定的表达水平而选择。
9. 一种预测前列腺癌复发的方法,其包括:
测定相对于标准的DPT表达水平;
测定来自表2的至少一种另外标记的表达水平;和
将所述DPT的表达水平和来自表2的除组蛋白1 H3d外的至少一种另外标记的表达水平转化成对应于前列腺癌的复发概率的评分。
10. 根据权利要求9所述的方法,作为转化步骤的备选,其进一步包括将所述DPT的表达水平和来自表2的除组蛋白1 H3d外的至少一种另外标记的表达水平与前列腺癌复发的至少一种另外指示物组合的步骤,以测定复合评分。
11. 根据权利要求10所述的方法,其中所述复合评分反映前列腺癌复发的可能性。
12. 根据权利要求9所述的方法,其中在选自前列腺切除术、激素疗法、单试剂化学疗法、双试剂化学疗法和用法尼基转移酶抑制剂的治疗中的至少一种治疗前,测定所述DPT的表达水平和来自表2的除组蛋白1 H3d外的至少一种另外标记的表达水平。
13. 一种用于检测至少DPT的表达水平的试剂盒,所述试剂盒包括试剂以及第一探针组,其包括特异性识别DPT的第一探针和特异性识别选自表2的除组蛋白1 H3d外的第二标记的第二探针。
14. 根据权利要求13所述的试剂盒,其还包括装置,所述装置用于将所述DPT的表达水平和来自表2的除组蛋白1 H3d外的至少一种另外标记的表达水平转换成前列腺癌复发可能性的指示物。
15. 根据权利要求13所述的试剂盒,其中所述装置是列线图。
16. 根据权利要求15所述的试剂盒,其中所述列线图作为下组中的一个或多个成员实现:机械装置、图示和软件指令,以实现用于提供前列腺癌复发可能性指示物的表示的用户界面。
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