[发明专利]一种构建蔷薇科原始染色体的方法

权利要求书

1.一种构建蔷薇科原始染色体的方法，包括以下步骤：

1)收集蔷薇科已测序物种数据；

2)鉴定同源基因；

3)确定参考物种染色体同源区域；

4)确定比对物种和参考物种在染色体上的同源区域；

5)构建原始染色体。

2.如权利要求1所述的方法，其特征在于，步骤1)所述的物种数据是物种基因CDS序列和基因在染色体上的定位信息。

3.如权利要求1所述的方法，其特征在于，步骤1)所述的已测序物种为苹果、草莓、梅花。

4.如权利要求1所述的方法，其特征在于，步骤2)是将两个基因blast的结果用累加一致性百分比CIP和累加比对长度百分比CALP鉴定同源基因。

5.如权利要求1所述的方法，其特征在于，步骤3)是通过参考物种的自身blastn比对找到的同源区域，得到参考物种基因的染色体复制信息。

6.如权利要求1所述的方法，所述参考物种为苹果，所述比对物种为梅花和/或草莓。

7.如权利要求1所述的方法，其特征在于，步骤4)是通过比对物种和参考物种之间的blastn比对找到在染色体上的同源区域。

8.如权利要求1所述的方法，其特征在于，所述步骤5)是通过参考物种自身比对和比对物种与参考物种的比对得到的在染色体上的区域方法实现的。

9.权利要求1-8任一所述的方法在确定植物物种祖先染色体进化方面的应用。

10.如权利要求9所述的应用，其特征在于所述的植物为蔷薇科植物。