[发明专利]用于检测原发性肝癌的癌组织及癌旁组织的基因标志物无效
申请号: | 201110326404.6 | 申请日: | 2011-10-24 |
公开(公告)号: | CN103060351A | 公开(公告)日: | 2013-04-24 |
发明(设计)人: | 何祥火;魏霖;梁琳慧;顾健人 | 申请(专利权)人: | 上海市肿瘤研究所 |
主分类号: | C12N15/60 | 分类号: | C12N15/60;C12N15/54;C12N15/53;C12N15/52;C12N15/12;C12Q1/68;C12N15/11;C40B40/06 |
代理公司: | 上海专利商标事务所有限公司 31100 | 代理人: | 陈静 |
地址: | 200032 上海*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 检测 原发性 肝癌 组织 基因 标志 | ||
技术领域
本发明属于医药学领域;更具体地,本发明涉及用于检测原发性肝癌的癌组织及癌旁组织的基因标志物。
背景技术
任何事物的发生发展都处于内外因共同作用之下,内因为主,外因为辅。基因作为生命的遗传介质,在生物体的生、老、病、死中处于基础内因的地位。绝大部分基因通过转录生成核糖核酸mRNA,再翻译生成蛋白质而发挥生物学功能。基因的功能虽然主要是通过蛋白质的来体现,但仍可以通过基因的转录产物mRNA的含量而部分反映。
全基因组表达谱芯片含2万余个探针,利用DNA双链同源互补的原理在全基因组水平上检测样本中所含各种mRNA的含量,因此可在同一时间对待测样本中全基因组范围内的基因的转录水平进行检测,进而推测基因功能。
原发性肝癌是中国最常见的恶性肿瘤之一,每年新发病例约占全球50%。肝癌的恶性程度高,发展迅速,治疗困难,病死率高。因此,肝癌的尽早诊断就愈发显得迫切。
然而,迄今为止,本领域对于与原发性肝癌密切相关的基因了解甚少,因此本领域迫切需要进一步地分离各种与原发性肝癌密切相关的基因,找到对于诊断肝癌的发生、转移、复发或检测有关的基因标志物。
发明内容
本发明的目的在于提供用于检测、区分原发性肝癌的癌组织及癌旁组织的基因标志物。
在本发明的第一方面,提供一种多核苷酸集,所述的多核苷酸集包括编码以下蛋白的多核苷酸(较佳地,由编码以下蛋白的多核苷酸组成):
纤维胶凝蛋白3,CD209分子,雌激素受体1,CD5类分子,犬尿酸3-羟化酶,N-酰基转移酶,载酯蛋白F,铁调素抗菌肽,糖原合成酶2,类固醇-5-alpha-还原酶2,促肾皮质素激素结合蛋白,乙醇脱氢酶4,细胞色素P450家族2亚家族C多肽19,细胞色素P450家族2亚家族C多肽8,凝结因子9,细胞色素P450家族2亚家族C多肽9,金属硫蛋白1G,磷酸烯醇丙酮酸羧激酶,成胶原结构的巨噬细胞受体,金属硫蛋白1H,Afamin,甘氨酸-N-酰基转移酶,视黄醇脱氢酶16,甘氨酸-N-甲基转移酶,甲铵乙内酯-高半胱氨酸甲基转移酶,酪氨酸氨基转移酶,载脂蛋白A5,丝氨酸脱水酶,分泌型磷蛋白2,丙氨酸-乙醛酸氨基转移酶2样蛋白1,细胞色素P450家族26亚家族A多肽1,17-beta羟甾类脱氢酶6同源蛋白和分泌型磷蛋白1。
在一个优选例中,所述的多核苷酸集中,编码所述的纤维胶凝蛋白3,CD209分子,雌激素受体1,CD5类分子,犬尿酸3-羟化酶,N-酰基转移酶,载酯蛋白F,铁调素抗菌肽,糖原合成酶2,类固醇-5-alpha-还原酶2,促肾皮质素激素结合蛋白,乙醇脱氢酶4,细胞色素P450家族2亚家族C多肽19,细胞色素P450家族2亚家族C多肽8,凝结因子9,细胞色素P450家族2亚家族C多肽9,金属硫蛋白1G,磷酸烯醇丙酮酸羧激酶,成胶原结构的巨噬细胞受体,金属硫蛋白1H,Afamin,甘氨酸-N-酰基转移酶,视黄醇脱氢酶16,甘氨酸-N-甲基转移酶,甲铵乙内酯-高半胱氨酸甲基转移酶,酪氨酸氨基转移酶,载脂蛋白A5,丝氨酸脱水酶,分泌型磷蛋白2,丙氨酸-乙醛酸氨基转移酶2样蛋白1,细胞色素P450家族26亚家族A多肽1,17-beta羟甾类脱氢酶6同源蛋白和分泌型磷蛋白1的多核苷酸分别是:序列如GenBank登录号NM_003665.2,NM_021155.3,NM_021155.3,NM_005894.2,NM_003679.3,NM_000015.2,NM_001638.2,NM_021175.2,NM_021957.3,NM_000348.3,NM_001882.3,NM_000670.3,NM_000769.1,NM_000770.3,NM_000133.3,NM_000771.3,NM_005950.1,NM_002591.3,NM_006770.3,NM_005951.2,NM_001133.2,NM_201648.2,NM_003708.3,NM_018960.4,NM_001713.2,NM_000353.2,NM_052968.3,NM_006843.2,NM_006944.2,NM_031279.2,NM_000783.3,NM_003725.2和NM_001040058.1所示的多核苷酸。
在本发明的另一方面,提供所述的多核苷酸集的用途,用于制备测定(或区分)原发性肝癌的癌组织及癌旁组织的检测试剂或试剂盒。
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