[发明专利]一种经济的应用大规模平行测序技术检验多目标多基因的方法有效
| 申请号: | 201110299517.1 | 申请日: | 2011-09-30 |
| 公开(公告)号: | CN102344961A | 公开(公告)日: | 2012-02-08 |
| 发明(设计)人: | 侯青 | 申请(专利权)人: | 康旭基因技术(北京)有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
| 地址: | 100083 北京市海*** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 经济 应用 大规模 平行 技术 检验 多目标 多基因 方法 | ||
1.一种应用大规模平行测序技术同时检验多目标相关基因突变的方法其特征在于所述方法包括以下步骤:
a.设计并制备捕获目标区域的探针;
b.将多个待测DNA样品分别连接到设计好的加了特异性标签的接头;
c.将经过步骤b所得的不同样品的DNA片段混合然后使用设计好的通用引物进行扩增;
d.将处理好的待测DNA片段混合物和步骤a所得探针加入反应管中,DNA样本与探针杂交,通过洗脱得到待测的目标片段;;
e.调节反应温度激活DNA聚合酶,用一对通用引物对步骤d所得序列同时进行PCR扩增反应;
f.将步骤e所得PCR扩增反应产物通过大规模基因平行分析平台进行测序。
g.根据标签特征分别对不同来源的基因样本比对进行数据分析。
2.根据权利要求1所述的探针可以是寡聚核糖核酸(RNA),也可以是寡聚脱氧核糖核酸(DNA),但是不仅限于RNA和DNA,可以包括修饰后的DNA或者RNA等。
3.权利要求2所述探针以叠瓦式设计,完整覆盖全部待测基因序列。
4.根据权利要求2所述的探针可以是结合在磁珠上的,也可以结合在载玻片上,但不仅限于这介质。
5.根据权利要求1所述的特异性标签序列其特征在于;标签序列位于接头的最内侧,通过粘性末端与待测片段结合;接头5’和3’端分别进行磷酸化和硫化修饰。
6.这种方法可以广泛应用于多样品的基因测序,适用于遗传性疾病的诊断、食品卫生和公共卫生行业大批量检测的需要。
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