[发明专利]一种制备脱氧核糖核苷三磷酸的新方法无效
申请号: | 201110003406.1 | 申请日: | 2011-01-10 |
公开(公告)号: | CN102168123A | 公开(公告)日: | 2011-08-31 |
发明(设计)人: | 吕朝阳;张煜星 | 申请(专利权)人: | 吕朝阳 |
主分类号: | C12P19/32 | 分类号: | C12P19/32;C12P19/30;C07H19/04;C07H1/04 |
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地址: | 832000 新疆维吾尔*** | 国省代码: | 新疆;65 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 制备 脱氧 核糖 核苷 磷酸 新方法 | ||
技术领域:
本发明涉及一种利用化学合成-酶促合成两步法的全新工艺,用料价格低廉,生产成本较低,无环境污染,可大规模制备脱氧核糖核苷三磷酸。
背景技术:
DNA合成的基础物质是脱氧核糖核苷三磷酸(dNTP),根据其结构的不同,dNTP可分为dATP、dCTP、dTTP、dGTP。人工合成的DNA片段已广泛应用于基因工程和分子生物学等生命科学领域。虽然dNTP的制备研究曾有不少报道,如Yoskihawa等用POCl3将脱氧核苷磷酰化得到以脱氧核苷二氯磷酸为主的产物;Ludwig发现脱氧核苷二氯磷酸可以在中性无水DMF溶液中与过量的焦正磷酸三丁胺反应生成核苷三磷酸等等。但所有这些方法均有一定的缺陷,大部分的生产方法的合成量在1mmol以下,化学法合成法的后处理相当困难,且收率极低,产品中存在的焦磷酸盐将影响DNA聚合酶的催化活性,从而影响DNA的合成。
发明内容:
本发明所述脱氧核糖核苷三磷酸的制备方法包括以下步骤:
正磷酸三丁胺的制备:三正丁胺100-150ml,85%磷酸40-60ml,以1000ml乙醇为溶剂,室温下搅拌反应半小时,之后在40℃水浴中旋转蒸发至糖浆状。然后分别用500ml无水乙醇溶解,减压蒸干三次,残留物为微黄色透明糖浆状正磷酸三丁胺。
dNDP的化学合成:dNMP水溶液用盐酸调pH值为4-6,加入5-10倍物质量的DCC、4-8倍物质量的正磷酸三丁胺,以等体积的乙醇作为溶剂,80℃搅拌反应10小时,冰浴100min后过滤除去不溶物,所得液体在40℃条件下旋转蒸发除去乙醇,得到的混合物加入50-60倍体积的水溶解,用氢氧化钠调溶液的pH为6-8,所得混合物为dNMP、dNDP和磷酸盐的水溶液,其中含dNDP70%-90%,经阴离子树脂柱层析分离,以醋酸、醋酸钠的缓冲液为洗脱剂,0.1-0.5mol/L的浓度梯度洗脱,得到纯度为97%-99%的dNDP水溶液,再加入2倍溶液体积的无水乙醇使其沉淀,沉淀在40℃水浴条件下旋转蒸发可得到白色的dNDP固体粉末。
dNTP的酶促反应:dNDP水溶液中加入4-6倍物质量的PEP-Na,用氢氧化钠溶液调节pH为6-8,以ATP-Na为催化剂,根据酶的活性加入丙酮酸激酶和金属离子,如氯化锂、硫酸锂、醋酸锂、七水硫酸镁、氯化钾、硫酸钾等;在50-60℃条件下进行酶促反应48-72小时,即可得到dNDP和dNTP的混合物,dNTP的含量在60%-80%之间,将该混合物用阴离子树脂柱层析分离,以醋酸、醋酸钠的缓冲液为洗脱剂,0.1-0.5mol/L的浓度梯度洗脱,得到纯度为97%-99%的dNDP水溶液,再加入2倍溶液体积的无水乙醇使其沉淀,沉淀在40℃水浴条件下旋转蒸发可得到白色的dNTP固体粉末。
本发明以dNMP为原料,采用化学合成-酶促合成相结合的方法合成dNTP。在dNMP合成dNDP的过程中,dNDP的收率为70%-90%,dNDP再经酶促反应生成dNTP的过程中,dNTP的收率在60%-80%之间,且未反应的dNDP可回收用于下次继续反应,原料没有损耗,适合工业循环生产,且无废气、废物环境污染。
具体实施方式:
实施例1正磷酸三丁胺的制备
取三正丁胺200ml、85%磷酸90ml,以2000ml乙醇为溶剂,室温下搅拌反应半小时,之后在40℃水浴中旋转蒸发至糖浆状。然后分别用1000ml无水乙醇溶解,减压蒸干三次,得残留物为微黄色透明糖浆状正磷酸三丁胺250克左右。
实施例2 dNDP的化学合成
称取dNMP固体100克,溶于500ml去离子水中,用盐酸调溶液pH值为5,加入300克的DCC、250克正磷酸三丁胺,以1000ml的乙醇作为溶剂,80℃搅拌反应10小时,反应之后冰浴100min,过滤除去不溶物,所得液体在40℃水浴条件下旋转蒸发除去乙醇,得到的混合物加入800ml的水溶解,用氢氧化钠调溶液的pH为中性,所得混合物为dNMP、dNDP和磷酸盐的水溶液,用阴离子树脂柱层析分离,以醋酸、醋酸钠的缓冲液为洗脱剂,0.1-0.5mol/L的浓度梯度洗脱,得到纯度为97%-99%的dNDP水溶液,再加入2倍溶液体积的无水乙醇使其沉淀,沉淀在40℃水浴条件下旋转蒸发可得到白色的dNDP固体粉末100克,以dNMP为原料计算,本步收率为83.1%。
实施例3 dNTP的酶促合成
称取dNDP固体100克,溶于500ml去离子水中,加入200克的PEP-Na,溶液用氢氧化钠溶液调pH为中性,加入0.5克ATP-Na、1.5万单位的丙酮酸激酶和50毫克的金属离子,如氯化锂、硫酸锂、醋酸锂、七水硫酸镁、氯化钾、硫酸钾等;在50-60℃条件下进行酶促反应48-72小时,即可得到dNDP和dNTP的混合物,将该混合物用阴离子树脂柱层析分离,以醋酸、醋酸钠的缓冲液为洗脱剂,0.1-0.5mol/L的浓度梯度洗脱,得到纯度为97%-99%的dNDP水溶液,再加入2倍溶液体积的无水乙醇使其沉淀,沉淀在40℃条件下旋转蒸发可得到白色的dNTP固体粉末80克。本步的收率为72.5%,如以dNMP为起始原料计算,总收率为60.4%。
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