[发明专利]与鸡后期体重相关的分子标记及其应用

说明书

技术领域

本发明涉及家禽分子标记制备领域，具体涉及与鸡后期体重相关的分子标记及其应用。

背景技术

畜禽生长发育是一项极其复杂的生命活动，受到许多基因的控制，如IGFs轴相关基因和垂体-下丘脑生长轴相关基因等。关于鸡的生长发育，科学家们进行了许多卓越的工作。也取得了很大的成果，到目前为止，鸡QTL数据库中与各生产性状相关的QTLs共有1,863个，而其中与鸡生长性状相关的QTLs就达到了1,162个（http://www.animalgenome.org/cgi-bin/QTLdb/GG/summary）。大部分生长性状已经定位到了不同染色体的不同区域，但这些QTLs的跨度通常都很大，有的甚至包括整条染色体，这对揭示生长性状的遗传基础还是远远不够的。虽然已经进行了大量的研究，但畜禽生长发育的分子遗传机理仍然不是很清楚。

近几十年来，检测特定表型性状与基因变异关系的关联研究一直是动物遗传育种研究的重要内容，也取得了丰硕的成果。比较典型的例子就是性连锁矮小鸡（sex-linked dwarf chicken）的矮小表型是由生长激素受体（growth hormone receptor，GHR）基因中的单碱基突变或是3′端1773bp缺失引起，矮小鸡的胫长比正常鸡的短约三分之一，但并不对其生产性能产生不利影响（欧阳建华，2006）。矮小基因已经成功运用于生产实践当中，如中国农业大学成功培育了节粮小型褐壳蛋鸡——“农大褐3号”（宁中华等，1996）。然而，以前的关联研究只能分析少数基因的少数变异对疾病或性状的影响，主要集中于候选基因研究以及用微卫星进行相关性状的数量性状座位（quantitative trait loci，QTLs）定位，只能对某个或少数几个基因进行研究，无法对影响特定表型性状的基因组区域进行综合分析，用微卫星或少量的单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphisms，SNPs）进行QTLs定位，定位结果往往有很大的置信区间，获得的QTLs图谱清晰度很差，不能满足精确定位致因突变或基因（causative mutation & gene）的要求能够检测分布于整个基因组而不是局限于特定基因内的成千上万甚至百万个SNPs与某一性状的关联，该方法比传统方法更适合鉴定引起表型差异的普通SNPs，中等或大的，甚至是小的遗传效应都能被检测到（McCarthy et al，2008；Benyamin et al，2009）。

鸡FOXO1基因的研究很少，但在猪、人和鼠等哺乳动物中的研究很多。FOXO1是一种FOXO 叉头型转录因子，在禁食或严重的糖尿病时表达显著上调，FOXO1基因超表达转基因小鼠与正常小鼠相比较，体重更轻，骨骼肌总量更少，而且肌肉颜色更白（Kamei et al，2004）。对FOXO1基因超表达转基因小鼠肌纤维的分析表明超表达引起I型（红肌）和II型（白肌）肌纤维显著变细，并显著减少骨骼肌中I型肌纤维的数量，FOXO1基因负调控骨骼肌总量和I型肌纤维相关基因的表达（Kamei et al，2004）。最新的研究表明用皮质类固醇（corticosteroid）处理的小鼠与空白对照小鼠相比FOXO1基因随给药时间的增加表达量逐步升高，而体重明显下降，肌肉中胰岛素样生长因子I（Insulin-like growth factor-I，IGF-I）基因mRNA表达也显著降低（Cho et al，2010）。猪FOXO1基因研究表明该基因参与脂肪代谢并是前脂肪细胞分化的负调控因子，而且FOXO1基因表达上调能降低MyoD 基因的表达，进而负调控肌肉的发育和骨骼肌的量（杨燕军等，2008a；Pang et al，2009）。在以Ⅰ型纤维为主的比目鱼肌中表达丰度显著高于以Ⅱb 型纤维为主的趾长伸肌中的表达丰度，表明FOXO1基因与Ⅰ型肌纤维的含量成反比（杨燕军等，2008b），与人类的研究结果相类似。

发明内容

本发明的目的在于根据现有鸡后期体重筛选中存在的困难，提供一种与鸡后期体重相关的分子标记。

本发明另一目的在于提供上述与鸡后期体重相关的分子标记的应用。

本发明上述目的通过以下技术方案予以实现：