[发明专利]一种与鸡屠体性状相关的分子标记及其获取方法和应用

说明书

技术领域

本发明涉及基因工程和遗传育种领域，具体涉及一种与鸡屠体性状相关的分子标记及其获取方法和应用。

背景技术

屠体性状是动物生产中重要的经济性状，直接反映动物的产肉性能，如屠体重、半净膛中、全净膛重、胸肌腿肌重及翅重等，因此一直都是动物育种生产中研究的热点。在肉质品质的基础上，进一步提高肉鸡的屠体重和腿肌率是肉鸡选育的目标。

FTO基因（Fat Mass and Obesity Associated）是近年来通过全基因组关联分析与体重指数、肥胖及糖尿病密切相关的一个新基因。人类医学研究发现，FTO的变异导致肥胖症发生的关键因素之一，尤其是位于内含子1的rs9939609变异位点，每增加一个A突变等位基因拷贝，体重增加约1.4 kg（P=3×10-35）( TM Frayling，Genome-wide association studies provide new insights into type 2 diabetes aetiology. Nat Rev Genet 2007; 8: 657-662.; G Thorleifsson, GB Walters, DF Gudbjartsson, et al. Genome-wide association yields new sequence variants at seven loci that associate with measures of obesity. Nat Genet 2009; 41: 18-24.）。随后研究人员在遍布世界各大国的人群中对该基因变异位点进行关联分析，证实了FTO基因是影响体重和肥胖症的关键候选基因。但是对于FTO基因的功能仍然不是很清楚。FTO基因广泛表达于动物的各个组织，高表达于动物个体的脑部组织，特别是下丘脑组织。研究小鼠FTO基因的表达规律，发现FTO基因可能对能量稳态调控起主要作用（R Fredriksson, M Hagglund, PK Olszewski, et al. The obesity gene, FTO, is of ancient origin, up-regulated during food deprivation and expressed in neurons of feeding-related nuclei of the brain. Endocrinology 2008; 149: 2062-2071）。通过基因敲出手段，FTO基因受到抑制的老鼠出生后生长较慢，脂肪组织和瘦肉组织较少，出生6周之内，这些老鼠体重比其它同类轻30％至40％（J Fischer, L Koch, C Emmerling, et al. Inactivation of the Fto gene protects from obesity. Nature 2009; 458: 894-898）。可见，FTO基因对体重的影响极为显著。但是，目前在鸟类研究上，该基因的研究尚未开展。FTO基因在家禽上是否会影响其经济性状，对家禽的生长如肌肉发育、脂肪沉积会起到如何的作用？利用RT-PCR、RACE和PCR-RFLP技术研究克隆FTO基因并筛查有意义的突变位点进行关联分析，研究FTO的分子功能，以期找与重要经济性状相关的分子标记用于家禽分子辅助标记选择育种。

发明内容

本发明的目的在于根据现有技术的不足，提供一种与鸡屠体性状相关的分子标记。

本发明另一目的在于提供上述与鸡屠体性状相关的分子标记的获取方法。

本发明还有一个目的在于提供上述与鸡屠体性状相关的分子标记在鸡选育过程中的应。

本发明上述目的通过以下技术方案予以实现：

申请人克隆得到鸡的FTO基因全序列共2787bp，9个外显子和8个内含子。其中5’UTR序列80bp，编码区1524bp编码508个氨基酸，3’UTR序列1183bp。FTO基因全序列和编码区序列如SEQ ID NO:1~2所示。

依据所获得序列SEQ ID NO:1进行变异位点筛查，由引物F1和R1（如SEQ ID NO:3~4所示）扩增FTO基因的部分DNA序列（见序列表SEQ ID NO:5），测序发现位于Exon9区域的 G+1479A碱基突变，从而导致Ala467Val氨基酸的改变，同时造成内切酶BbvI识别位点的改变，形成酶切多态性。

本发明与鸡屠体性状相关的分子标记可用于筛选鸡屠体性状。

与现有技术相比，本发明具有如下有益效果：