[发明专利]黄脂菌素的生物合成基因簇无效
申请号: | 201010251262.7 | 申请日: | 2010-08-11 |
公开(公告)号: | CN102010871A | 公开(公告)日: | 2011-04-13 |
发明(设计)人: | 由德林;张维克;邓子新;褚以文;王辂;赵子翰 | 申请(专利权)人: | 上海交通大学;中国医药集团总公司四川抗菌素工业研究所 |
主分类号: | C12N15/31 | 分类号: | C12N15/31;C12N15/52;C12N15/53;C12N15/54;C12N15/55;C12N15/60 |
代理公司: | 上海交达专利事务所 31201 | 代理人: | 王锡麟;王桂忠 |
地址: | 200240 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 菌素 生物 合成 基因 | ||
1.一种黄脂菌素的生物合成基因簇,其特征在于,包括49个基因的核苷酸序列或由序列1形成的互补序列,其中:负责合成碳骨架及对其进行后修饰共二十九个基因:xanO1、xanO2、xanO3、xanO4、xanO5、xanO6、xanO7、xanO8、xanO9、xanO10、xanM1、xanM2、xanM3、xanZ1、xanZ2、xanZ3、xanZ4、xanS1、xanS2、xanG、xanA、xanH、xanK、xanD、xanE、xanF、xanC1、xanC2、xanC3;负责提供碳骨架延伸单位及后修饰过程中的甲基供体共八个基因:xanB1、xanB2、xanB3、xanY1、xanY2、xanY3、xanY4、xanY5;负责对xantholipin的生物合成进行调控共三个基因:xanR1、xanR2、xanR3;负责为宿主菌提供抗性共三个基因:xanU、xanN、xanQ;在此生物合成过程中还有六个基因:xanJ、xanP、xanL、xanW、xanT、xanV。
2.根据权利要求1所述的黄脂菌素的生物合成基因簇,其特征是,所述的序列1,一个编码腺苷高半胱氨酸水解酶的核苷酸序列由序列2中的氨基酸序列组成,命名为xanY1,其基因核苷酸序列位于序列1中第1419-1碱基处;
一个编码5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶的核苷酸序列由序列3中的氨基酸序列组成,命名为xanY2,其基因核苷酸序列位于序列1中第2299-1397碱基处;
一个编码甲硫氨酸合成酶的核苷酸序列由序列4中的氨基酸序列组成,命名为xanY3,其基因核苷酸序列位于序列1中第5802-2305碱基处;
一个编码糖激酶的核苷酸序列由序列5中的氨基酸序列组成,命名为xanY4,其基因核苷酸序列位于序列1中第6791-5799碱基处。
一个编码S-甲硫腺苷合酶的核苷酸序列由序列6中的氨基酸序列组成,命名为xanY5,其基因核苷酸序列位于序列1中第8037-6817碱基处;
一个编码单加氧酶的核苷酸序列由序列7中的氨基酸序列组成,命名为xanO1,其基因核苷酸序列位于序列1中第8583-8146碱基处;
一个编码脱氢酶的核苷酸序列由序列8中的氨基酸序列组成,命名为xanS1,其基因核苷酸序列位于序列1中第9803-8580碱基处;
一个编码功能未知蛋白的核苷酸序列由序列9中的氨基酸序列组成,命名为xanJ,其基因核苷酸序列位于序列1中第9867-10595碱基处;
一个编码孢子外衣蛋白的核苷酸序列由序列10中的氨基酸序列组成,命名为xanP,其基因核苷酸序列位于序列1中第10592-12211碱基处;
一个编码糖基转移酶的核苷酸序列由序列11中的氨基酸序列组成,命名为xanG,其基因核苷酸序列位于序列1中第12379-13554碱基处;
一个编码天冬酰氨合酶的核苷酸序列由序列12中的氨基酸序列组成,命名为xanA,其基因核苷酸序列位于序列1中第13542-15386碱基处;
一个编码转录调节因子的核苷酸序列由序列13中的氨基酸序列组成,命名为xanR1,其基因核苷酸序列位于序列1中第15392-16075碱基处;
一个编码细胞色素P450羟化酶的核苷酸序列由序列14中的氨基酸序列组成,命名为xanO2,其基因核苷酸序列位于序列1中第16114-17316碱基处;
一个编码3Fe-S还原蛋白的核苷酸序列由序列15中的氨基酸序列组成,命名为xanK,其基因核苷酸序列位于序列1中第17333-17602碱基处;
一个编码抗性转运蛋白的核苷酸序列由序列16中的氨基酸序列组成,命名为xanU,其基因核苷酸序列位于序列1中第17599-19728碱基处;
一个编码黄素单加氧酶的核苷酸序列由序列17中的氨基酸序列组成,命名为xanO3,其基因核苷酸序列位于序列1中第19908-21086碱基处;
一个编码乳酸酰谷胱苷肽裂解酶的核苷酸序列由序列18中的氨基酸序列组成,命名为xanL,其基因核苷酸序列位于序列1中第21707-21147碱基处;
一个编码非血红素卤化酶的核苷酸序列由序列19中的氨基酸序列组成,命名为xanH,其基因核苷酸序列位于序列1中第22057-23472碱基处;
一个编码肽链转移蛋白的核苷酸序列由序列20中的氨基酸序列组成,命名为xanQ,其基因核苷酸序列位于序列1中第23469-25070碱基处;
一个编码氧甲基转移酶的核苷酸序列由序列21中的氨基酸序列组成,命名为xanM1,其基因核苷酸序列位于序列1中第25067-26086碱基处;
一个编码还原酶的核苷酸序列由序列22中的氨基酸序列组成,命名为xanZ1,其基因核苷酸序列位于序列1中第26651-27508碱基处;
一个编码膜离子反向运输蛋白的核苷酸序列由序列23中的氨基酸序列组成,命名为xanN,其基因核苷酸序列位于序列1中第28888-27593碱基处;
一个编码功能未知蛋白的核苷酸序列由序列24中的氨基酸序列组成,命名为xanW,其基因核苷酸序列位于序列1中第29473-28985碱基处;
一个编码转录调节蛋白的核苷酸序列由序列25中的氨基酸序列组成,命名为xanR2,其基因核苷酸序列位于序列1中第29600-30061碱基处;
一个编码氧甲基转移酶的核苷酸序列由序列26中的氨基酸序列组成,命名为xanM2,其基因核苷酸序列位于序列1中第31105-30083碱基处;
一个编码黄素单加氧酶的核苷酸序列由序列27中的氨基酸序列组成,命名为xanO4,其基因核苷酸序列位于序列1中第32742-31120碱基处;
一个编码甲基转移酶的核苷酸序列由序列28中的氨基酸序列组成,命名为xanM3,其基因核苷酸序列位于序列1中第33084-34118碱基处;
一个编码黄素单加氧酶的核苷酸序列由序列29中的氨基酸序列组成,命名为xanO5,其基因核苷酸序列位于序列1中第34203-35798碱基处;
一个编码还原酶的核苷酸序列由序列30中的氨基酸序列组成,命名为xanS2,其基因核苷酸序列位于序列1中第35868-36554碱基处;
一个编码氧化还原酶的核苷酸序列由序列31中的氨基酸序列组成,命名为xanZ2,其基因核苷酸序列位于序列1中第37667-36759碱基处;
一个编码转录调节蛋白的核苷酸序列由序列32中的氨基酸序列组成,命名为xanR3,其基因核苷酸序列位于序列1中第37715-38722碱基处;
一个编码生物素羧化酶的核苷酸序列由序列33中的氨基酸序列组成,命名为xanB1,其基因核苷酸序列位于序列1中第40187-38844碱基处;
一个编码生物素羧基载体蛋白的核苷酸序列由序列34中的氨基酸序列组成,命名为xanB2,其基因核苷酸序列位于序列1中第40714-40190碱基处;
一个编码羧基转移酶的核苷酸序列由序列35中的氨基酸序列组成,命名为xanB3,其基因核苷酸序列位于序列1中第42468-40774碱基处;
一个编码单加氧酶的核苷酸序列由序列36中的氨基酸序列组成,命名为xanO6,其基因核苷酸序列位于序列1中第42857-42546碱基处;
一个编码单加氧酶的核苷酸序列由序列37中的氨基酸序列组成,命名为xanO7,其基因核苷酸序列位于序列1中第43194-42847碱基处;
一个编码3-氧酰-酰基载体蛋白还原酶的核苷酸序列由序列38中的氨基酸序列组成,命名为xanZ3,其基因核苷酸序列位于序列1中第43946-43194碱基处;
一个编码单加氧酶的核苷酸序列由序列39中的氨基酸序列组成,命名为xanO8,其基因核苷酸序列位于序列1中第44431-43970碱基处;
一个编码环化酶的核苷酸序列由序列40中的氨基酸序列组成,命名为xanC1,其基因核苷酸序列位于序列1中第44909-44442碱基处;
一个编码β-酮酰合酶β的核苷酸序列由序列41中的氨基酸序列组成,命名为xanE,其基因核苷酸序列位于序列1中第46303-45017碱基处;
一个编码β-酮酰合酶α的核苷酸序列由序列42中的氨基酸序列组成,命名为xanF,其基因核苷酸序列位于序列1中第47583-46306碱基处;
一个编码环化酶的核苷酸序列由序列43中的氨基酸序列组成,命名为xanC2,其基因核苷酸序列位于序列1中第48014-47580碱基处;
一个编码CurD同源蛋白的核苷酸序列由序列44中的氨基酸序列组成,命名为xanT,其基因核苷酸序列位于序列1中第48198-48584碱基处;
一个编码氧化酶类似蛋白的核苷酸序列由序列45中的氨基酸序列组成,命名为xanO9,其基因核苷酸序列位于序列1中第48596-50014碱基处;
一个编码单加氧酶的核苷酸序列由序列46中的氨基酸序列组成,命名为xanO10,其基因核苷酸序列位于序列1中第50513-50067碱基处;
一个编码功能未知蛋白的核苷酸序列由序列47中的氨基酸序列组成,命名为xanV,其基因核苷酸序列位于序列1中第50908-50528碱基处;
一个编码3-氧酰-酰基载体蛋白还原酶的核苷酸序列由序列48中的氨基酸序列组成,命名为xanZ4,其基因核苷酸序列位于序列1中第51663-50908碱基处;
一个编码酰基载体蛋白的核苷酸序列由序列49中的氨基酸序列组成,命名为xanD,其基因核苷酸序列位于序列1中第51920-51660碱基处;
一个编码环化酶的核苷酸序列由序列50中的氨基酸序列组成,命名为xanC3,其基因核苷酸序列位于序列1中第52255-51917碱基处。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于上海交通大学;中国医药集团总公司四川抗菌素工业研究所,未经上海交通大学;中国医药集团总公司四川抗菌素工业研究所许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服】
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