[发明专利]亚洲玉米螟不同发育时期表达基因标签库及差异表达基因

权利要求书

1.一种获得亚洲玉米螟(Ostrinia furnacalis Guenée)的基因表达谱的方法，包括：

(S1)获得亚洲玉米螟某一发育时期的数字基因表达谱，其中包括基因表达标签的序列及丰度；

(S2)对(S1)获得的基因表达标签进行生物信息学分析，从而得知该标签对应的基因、其潜在的功能、其表达量或表达模式。

2.如权利要求1所述的方法，其特征在于，所述的发育时期包括：卵期、幼虫期、蛹期、成虫期。

3.如权利要求1所述的方法，其特征在于，步骤(S1)包括：

(a1)提取亚洲玉米螟的总RNA，分离出mRNA，反转录并合成双链cDNA，利用内切酶NlaIII切断双链cDNA，连接带有Mmel酶识别位点的接头，然后用Mmel酶切获得带有CATG位点的长度为21bp的片段；

(b1)利用Illumina平台合成基因表达标签库并进行测序，选择长度为21bp且拷贝数高于1的标签；

(c1)统计(b1)获得的每个基因表达标签的丰度。

4.如权利要求1所述的方法，其特征在于，步骤(S2)中，所述的生物信息学分析包括：

基因注释、标准化；差异基因筛选。

5.如权利要求4所述的方法，其特征在于，所述的差异表达基因筛选包括：表达模式聚类分析，GO功能显著性富集分析，Pathway显著性富集分析。

6.如权利要求4所述的方法，其特征在于，所述的基因注释、标准化之前或其间还包括Tag表达量即分布分析、测序饱和度分析、实验重复性分析，共有、特有、差异Tag分析。

7.如权利要求4所述的方法，其特征在于，所述的差异基因筛选之前或其间还包括基因表达量统计，反义链的转录分析。