[发明专利]用于评价动脉粥样硬化潜在性的生物标记无效
申请号: | 200980144564.X | 申请日: | 2009-11-11 |
公开(公告)号: | CN102209894A | 公开(公告)日: | 2011-10-05 |
发明(设计)人: | 卡皮尔·加德卡尔;阿南思·卡达姆比;西西利亚·皮尔松;林恩·鲍威尔;斯科特·西勒;杰弗·特里姆尔 | 申请(专利权)人: | 安特鲁斯公司 |
主分类号: | G01N33/48 | 分类号: | G01N33/48;C07H21/00 |
代理公司: | 北京康信知识产权代理有限责任公司 11240 | 代理人: | 李丙林;张英 |
地址: | 美国加利*** | 国省代码: | 美国;US |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 评价 动脉粥样硬化 潜在 生物 标记 | ||
1.一种用于评价受试者中抗糖尿病治疗的动脉粥样硬化潜在性的生物标记,所述生物标记包括多个选自表2中列出的那些基因的每一个的表达的度量。
2.根据权利要求1所述的生物标记,其中,所述多个基因包括至少3个、至少5个或至少8个选自表2的基因。
3.根据权利要求1所述的生物标记,其中,所述多个基因包括苹果酸酶1(登录号M30596)、脂滴包被蛋白(登录号AI406700)、丙酮酸羧化酶(登录号BG376902)、乙酰辅酶A酰基转移酶2(线粒体3-氧代酰基-辅酶A硫解酶)(登录号BI282488)、3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(登录号BM390399)、和载脂蛋白E(登录号J02582)中的至少一种。
4.一种用于测试化合物是否将在测试的受试者中诱导动脉粥样硬化的方法,所述方法包括:
将一剂量的所述化合物给予至少一名测试的受试者;
在所选的时间段后,从所述至少一名测试的受试者获得生物样品;
测量至少多个选自表4中列出的那些基因的所述生物样品中的表达水平;
利用包括测量其表达水平的至少所述多个基因的分类器确定所述样品是否处于用于诱导动脉粥样硬化的阳性类别。
5.根据权利要求4所述的方法,其中,所述生物样品包括肝组织。
6.根据权利要求4所述的方法,其中,给予的剂量在约7天、约14天、或约21天不引起动脉粥样硬化的组织学或临床证据。
7.根据权利要求4所述的方法,其中,将所述表达水平测量为化合物处理的生物样品与化合物未处理的生物样品的log10比。
8.根据权利要求4所述的方法,其中,所述分类器是线性分类器。
9.根据权利要求4所述的方法,其中,所述分类器是非线性分类器。
10.根据权利要求4所述的方法,其中,所选的时间段是约7天或更短。
11.一种试剂组,包括代表多个选自表4中列出的那些基因的多个多核苷酸或多肽。
12.根据权利要求11所述的试剂组,包括多个基因,所述多个基因包括至少4个选自表4中列出的那些基因,所述4个基因对表4中的所有基因具有至少2%的总影响。
13.根据权利要求11所述的试剂组,包括多个基因,所述多个基因包括至少8个选自表4中列出的那些基因,所述8个基因对表4中的所有基因具有至少4%的总影响。
14.根据权利要求11所述的试剂组,其中,所述试剂组是基于随机选自表4的基因的亚组,其中所述亚组包括具有至少1、2、4、8、16、32或64%总影响的至少4个基因。
15.根据权利要求11所述的试剂组,其中,所述多个基因由少于1000个多核苷酸或多肽组成。
16.根据权利要求15所述的试剂组,其中,所述多个基因由少于200个多核苷酸或多肽组成。
17.根据权利要求15所述的试剂组,其中,所述多个基因由少于8个多核苷酸或多肽组成。
18.根据权利要求11所述的试剂组,其中,所述试剂组基本上由选自表4的多核苷酸或多肽组成。
19.一种用于预测化合物是否将在测试的受试者中诱导动脉粥样硬化的装置,包括权利要求11所述的试剂组。
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