[发明专利]用于乳腺癌风险评估的遗传变型

权利要求书

1.测定人个体中对乳腺癌的易感性的方法，其包括确定至少一个多态型标志的至少一个等位基因是否存在于获自个体的核酸样品中或来源于个体的基因型数据集中，其中所述至少一个多态型标志选自下组：rs999737(SEQ ID NO：6)、rs2005154(SEQ ID NO：1)、rs2184380(SEQ ID NO：2)、rs2224696(SEQ ID NO：3)、rs2242503(SEQ ID NO：4)、rs12291026(SEQ ID NO：5)、rs9956546(SEQ ID NO：7)、rs11912922(SEQ ID NO：8)、rs6001954(SEQ ID NO：9)和与它们处于连锁不平衡中的标志，并且其中至少一个等位基因的存在的确定标示着个体中对乳腺癌的易感性。

2.权利要求1的方法，其中所述至少一个多态型标志选自表4中所示的标志。

3.权利要求1或权利要求2的方法，其中所述至少一个多态型标志选自rs999737(SEQ ID NO：6)、rs2005154(SEQ ID NO：1)、rs2184380(SEQ ID NO：2)、rs2224696(SEQ ID NO：3)、rs2242503(SEQ ID NO：4)、rs12291026(SEQ ID NO：5)、rs9956546(SEQ ID NO：7)、rs11912922(SEQ ID NO：8)、rs6001954(SEQ ID NO：9)。

4.前述权利要求的任一项的方法，其还包括评估个体中至少一个单倍型的频率。

5.前述权利要求的任一项的方法，其中由至少一个等位基因或单倍型的存在赋予的易感性是增加的易感性。

6.权利要求6的方法，其中rs2005154中的等位基因T、rs2184380中的等位基因G、rs2224696中的等位基因T、rs2242503中的等位基因C、rs12291026中的等位基因G、rs999737中的等位基因C、rs9956546中的等位基因A、rs11912922中的等位基因T、rs6001954中的等位基因G的存在标示着个体中增加的对乳腺癌的易感性。

7.权利要求5或6的方法，其中至少一个等位基因或单倍型的存在标示着相对风险度(RR)或比值比(OR)为至少1.08的增加的对乳腺癌的易感性。

8.权利要求5或6的方法，其中至少一个等位基因或单倍型的存在标示着相对风险度(RR)或比值比(OR)为至少1.09，包括至少1.10、至少1.11、至少1.12、至少1.13、至少1.14、至少1.15、至少1.16和至少1.17的增加的易感性。

9.权利要求1至4的任一项的方法，其中由至少一个等位基因或单倍型的存在赋予的易感性是减少的易感性。

10.前述权利要求的任一项的方法，其还包括确定不与表4中所示的标志中的任意一个处于连锁不平衡中的至少一个对于乳腺癌有风险的变体的至少一个有风险的等位基因是否存在于包含源自人个体的基因组DNA的样品中或来源于人个体的基因型数据集中。

11.权利要求1至9的任一项的方法，其包括在包含源自人个体的基因组DNA的样品中或来源于人个体的基因型数据集中确定至少一个等位基因在至少2个多态型标志的每一个标志中是否存在，其中所述至少一个等位基因在至少2个多态型标志中的存在标示着增加的对乳腺癌的易感性。

12.前述权利要求的任一项的方法，其还包括确定至少一个乳腺癌的高外显率遗传因子在获自个体的核酸样品中或来源于个体的基因型数据集中的存在或不存在的步骤。

13.权利要求12的方法，其中所述高外显率遗传因子是BRCA1、BRCA2、TP53和/或PTEN中的突变。

14.前述权利要求的任一项的方法，其还包括分析非遗传信息以进行个体的风险度评估、诊断或预后。

15.权利要求14的方法，其中所述非遗传信息选自受试者的年龄、性别、种族、社会经济地位、以前的疾病诊断、医疗史、乳腺癌的家族史、生物化学测量和临床测量。

16.权利要求11至15的任一项的方法，其还包括计算组合风险度。