[发明专利]用于检测和/或分类靶标的捕获剂以及相关方法和系统无效

专利信息
申请号: 200980121611.9 申请日: 2009-04-09
公开(公告)号: CN102112626A 公开(公告)日: 2011-06-29
发明(设计)人: 盖布里埃尔·A·古昂;凯厄斯·G·拉度;安东尼·里巴斯;欧文·威特;詹姆士·赫斯 申请(专利权)人: 加州理工学院;加利福尼亚大学董事会
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;G01N33/53;G01N33/68
代理公司: 北京中安信知识产权代理事务所 11248 代理人: 张小娟
地址: 美国加利*** 国省代码: 美国;US
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摘要:
搜索关键词: 用于 检测 分类 靶标 捕获 以及 相关 方法 系统
【权利要求书】:

1.一种模块化多核苷酸编码捕获剂,其被设置为与靶标特异性结合,该模块化多核苷酸编码捕获剂含有

至少一个被设置为与靶标特异性结合的结合分子,

被设置为与附着于基质的基质多核苷酸特异性结合的编码多核苷酸,和

被设置为以位置可区分的支架结合区域与该至少一个结合分子和该编码多核苷酸结合的支架分子,

该位置可区分的支架结合区域被布置在支架分子上,以在该至少一个结合分子以及该编码多核苷酸附着后,呈现至少一个用于特异性结合靶标的结合分子和呈现用于特异性结合该基质多核苷酸的编码多核苷酸。

2.如权利要求1所述的模块化多核苷酸编码捕获剂,其中

该支架结合域包括用于结合该至少一个结合分子的第一支架结合区域,以及用于结合该编码多核苷酸的第二支架结合区域,和

其中该第一支架结合域和该第二支架结合域通过正交化学过程结合该至少一个结合分子和该编码多核苷酸。

3.如权利要求2所述的模块化多核苷酸编码捕获剂,其中该第一支架结合域和该第二支架结合域被布置在该支架结合分子上,以最小化结合于该支架分子的该至少一个结合分子和结合于该支架分子的该编码多核苷酸之间的相互作用。

4.如权利要求1至3任一项所述的模块化多核苷酸编码捕获剂,其中该支架分子包括多个第一支架结合域和/或多个第二支架结合域。

5.如权利要求4所述的模块化多核苷酸编码捕获剂,其中该支架分子上的每一个多重第一支架结合域结合至该至少一个结合分子,并且该支架分子上的每一个多重第二支架结合域结合至该编码多核苷酸。

6.如权利要求2至5任一项所述的模块化多核苷酸编码捕获剂,其中该第一支架结合域用连结物分子结合至该至少一个结合分子,该连结物分子用至少一个结合分子连接第一支架结合域。

7.如权利要求6所述的模块化多核苷酸编码捕获剂,其中该连结物分子是条件性连结物。

8.如权利要求1至7任一项所述的模块化多核苷酸编码捕获剂,其中该至少一个结合分子包括用于结合靶细胞的多个相同的或者不同的结合分子。

9.如权利要求1至8任一项所述的模块化多核苷酸编码捕获剂,其中该编码多核苷酸包括至少一个布置限制性内切酶位点,其被布置在该编码多核苷酸中,以用于通过相应的限制性内切酶裂解。

10.如权利要求1至9任一项所述的模块化多核苷酸编码捕获剂,其中至少一个该支架分子和该至少一个结合分子是蛋白。

11.如权利要求10所述的模块化多核苷酸编码捕获剂,其中该支架分子是链霉亲和素,SAC,SAC3,抗体或者其优化变体。

12.如权利要求10或11所述的模块化多核苷酸编码捕获剂,其中至少一个结合分子是MHC二聚物,MHC三聚物,或者MHC四聚物,适配体,小分子或者抗体。

13.如权利要求1至12任一项所述的模块化多核苷酸编码捕获剂,其中该模块化多核苷酸编码捕获剂是极性的模块化多核苷酸编码捕获剂。

14.一种在样品中检测靶标的方法,该方法包括

将附着于基质的基质多核苷酸和模块化多核苷酸编码捕获剂结合,该模块化多核苷酸编码捕获剂包括结合至少一个结合分子和编码多核苷酸的支架分子,其中该至少一个结合分子特异性结合至该靶标,并且该编码多核苷酸特异性结合至附着于该基质的该基质多核苷酸;和

检测与附着于该基质的基质多核苷酸结合的模块化多核苷酸编码捕获剂-靶标复合物。

15.如权利要求14所述的方法,其中将附着于基质的基质多核苷酸和模块化多核苷酸编码捕获剂进行结合是通过

提供附着于该基质的基质多核苷酸;

提供包括附着有至少一个结合分子和编码多核苷酸的支架分子的模块化多核苷酸编码捕获剂,其中该至少一个结合分子特异性结合至该靶标,并且该编码多核苷酸特异性结合至该基质多核苷酸;和

将该模块化多核苷酸编码捕获剂和样品并且和基质在允许该结合分子和模块化多核苷酸编码捕获剂-靶标复合物中的靶标结合的条件下接触一段时间;和

将该编码多核苷酸与该基质多核苷酸结合。

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