[发明专利]一种检测甲型H1N1流感病毒的试剂盒及专用引物和靶序列有效
申请号: | 200910087632.5 | 申请日: | 2009-07-01 |
公开(公告)号: | CN101591715A | 公开(公告)日: | 2009-12-02 |
发明(设计)人: | 徐东刚;李伍举;蔡欣;付文亮;曹源;邹民吉 | 申请(专利权)人: | 中国人民解放军军事医学科学院基础医学研究所 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11;C12R1/93 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 h1n1 流感病毒 试剂盒 专用 引物 序列 | ||
技术领域
本发明涉及一种检测流感病毒的试剂盒,具体涉及一种检测甲型H1N1流感病毒的试剂盒、专用引物和该引物所针对的靶序列。
背景技术
自2009年4月中下旬起,源自北美的甲型H1N1流感疫情开始在全球多个国家蔓延,截至北京时间六月九日十四时,世界卫生组织确认全球七十四个国家和地区共有25288例甲型H1N1流感确诊病例,其中包括死亡病例139例。至此,中国内地共报告101例甲型H1N1流感确诊病例。甲型H1N1流感已对人类健康产生严重威胁,严重危害了人们健康,并造成重大的经济损失。快速、准确地进行流感病毒的检测是防控甲型H1N1流感的关键,一方面为防治提供依据和争取时间,另外可以减轻或消除社会恐慌心理。因此快速、敏感和特意的检测试剂盒的研制具有重大应用价值和社会意义。
2000年,日本学者Notomi等发明了一种新的恒温核酸扩增方法(Notomi T.等,Nucleic Acids Res,2000,28,E63),即环介导等温扩增法(Loop-mediatedisothermal amplification),其特点是针对靶基因的多个区域设计特异引物,利用一种链置换DNA聚合酶在等温条件65℃下进行反应,通过引物独特的反转设计,对自身进行链置换扩增,通常60分钟内即可完成反应。不需要模板的热变性、退火、长时间温度循环等过程。其扩增效率较高,可在60分钟内将靶序列扩增109~1010倍,一般能检测到10拷贝以下的样品。由于其引物分别针对多个不同的区域,任何一个不匹配反应就无法进行,因此出现非特异性扩增的情况极少。相关方法已用于早期SARA疾病的诊断和肺炎结核杆菌等检测(PoonL.L.等,Clin Chem,2004,50(6):1050-1052;Boehme,C.C.等,Clin.Microbiol.,2007,45,1936-1940)。通过逆转录酶环介导等温扩增法(reverse transcriptionloop-mediated isothermal amplification)已运用于HIV-1病毒(Kelly A.等,Journalof Virological Methods,2008,151,264-270),禽流感病毒H5、H5N 1和H9等的快速诊断(Imai M.等,Vaccine,2006,24(44-46):6679-6682;Imai M.等,J VirolMethods,2007,141(2):173-80;Chen HT等,J Virol Methods,2008,151(2):200-3)。该方法对于低浓度的病毒数量或无症状的病毒携带者的检测比RT-PCR好,目前尚未见到利用反转录和等温扩增一体化检测甲型H1N1流感病毒核酸试剂盒的报道。
目前,检测甲型H1N1流感病毒使用的试剂盒主要利用PCR方法和实时定量RT-PCR方法。PCR方法灵敏度和特异性均要低于环介导等温扩增法,且操作步骤繁琐,反应时间长;而实时定量RT-PCR方法检测需要昂贵的实时定量PCR仪,且结果需要计算机分析。
发明内容
本发明的目的在于提供一种检测甲型H1N1流感病毒的专用引物。
本发明的目的也在于提供一种含有上述专用引物的检测甲型H1N1流感病毒的试剂盒。
本发明的目的还在于提供上述专用引物的靶序列。
一种检测甲型H1N1流感病毒的专用引物,由4条特异性引物组成,所述4条特异性引物的序列分别为:引物F1具有序列表中SEQ ID No.2的核苷酸序列,引物B1具有序列表中SEQ ID No.3的核苷酸序列,引物F2具有序列表中SEQ IDNo.4的核苷酸序列,引物B2具有序列表中SEQ ID No.5的核苷酸序列。
一种检测甲型H1N1流感病毒的试剂盒,包括含有上述专用引物的反应预混液。
所述反应预混液为下述成分的混合液且各成分的终浓度分别为:引物F11.76μM;引物B1 1.76μM;引物F2 0.29μM;引物B2 0.29μM;dNTP 2.05mM;1.47×Bst DNA聚合酶缓冲液;MgSO4 11.76mM;甜菜碱1.47M。
所述试剂盒还包括Bacillus stearothermophilus(Bst)DNA聚合酶、RNA酶抑制剂、AMV反转录酶和无RNA酶的ddH2O。
所述试剂盒还包括SYBR Green I。
所述试剂盒还包括阳性模板和阴性模板。
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