[发明专利]预测或诊断胃肠病症或疾病的方法

权利要求书

1.诊断无症状受试者中结直肠癌或胃肠炎性疾病或病症的方法，包括：

(i)从受试者颊部区域收集黏膜上皮细胞；

(ii)测量所收集细胞中包含选自SEQ ID NO：1、3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、37、39、41和43的序列的至少两种多核苷酸的表达水平；

(iii)比较所述至少两种多核苷酸的表达水平与同样的多核苷酸在正常对照中的水平，

其中与正常对照相比表达水平的改变预示着结直肠癌或炎性疾病或病症。

2.诊断无症状受试者的结直肠癌或炎性疾病或病症的方法，包括：

(i)擦拭受试者颊部区域以收集上皮细胞；

(ii)测量所收集细胞中包含选自SEQ ID NO：1、3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、37、39、41和43的序列的至少两种多核苷酸的表达水平；

(iii)比较所述至少两种多核苷酸的表达水平与同样的多核苷酸在正常对照中的水平，

其中与正常对照相比表达水平的改变预示着结直肠癌或炎性疾病或病症。

3.权利要求1或2的方法，其中至少两种多核苷酸包含至少2、3、4、5、6、7、8、9、10或更多种多核苷酸。

4.权利要求3的方法，其中至少两种多核苷酸每一种编码选自CXCR2、OPN、COX1、PPARα、COX2、IL8、P21、c-Myc，CD44和PPARδ的多肽。

5.权利要求3的方法，其中改变是表达水平的增加。

6.权利要求1或2的方法，其中多种探针用于检测至少两种多核苷酸的表达水平。

7.权利要求6的方法，其中多种探针杂交至选自下列的一组多核苷酸：

(a)包含SEQ ID NO：3的第一种多核苷酸和包含SEQ ID NO：5的第二种多核苷酸；

(b)包含SEQ ID NO：3的第一种多核苷酸、包含SEQ ID NO：5的第二种多核苷酸和包含SEQ ID NO：17的第三种多核苷酸；或

(c)包含SEQ ID NO：3的第一种多核苷酸、包含SEQ ID NO：5的第二种多核苷酸、包含SEQ ID NO：9或11的第三种多核苷酸和包含SEQ ID NO：17的第四种多核苷酸。

8.权利要求6的方法，其中多种探针包含选自SEQ ID NO：45-87或88的序列。

9.权利要求6的方法，其中多种探针被可检测性标记。

10.权利要求8的方法，其中多种探针用于扩增至少两种多核苷酸。

11.权利要求1或2的方法，其中炎性疾病或病症选自假膜性结肠炎、出血性结肠炎、溶血尿毒症综合症结肠炎、胶原性结肠炎、缺血性结肠炎、放射性结肠炎、药物和化学诱导的结肠炎、转向性结肠炎、溃疡性结肠炎、肠易激综合症、过敏性结肠综合症、巴雷特病和克罗恩病。

12.权利要求11的方法，其中克罗恩病选自活动型、顽固型和瘘管型克隆病。

13.权利要求1的方法，其中上皮细胞收集通过擦拭受试者颊部区域或直肠区域完成。

14.诊断受试者中结直肠癌或炎性疾病或病症的方法，包括：

(a)将来自受试者的颊或直肠样品与包含SEQ ID NO：1、3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、37、39、41或43的至少8个连续核苷酸的至少两种探针接触；和

(b)定量杂交至所述至少两种探针的多核苷酸分子的数量，

其中多核苷酸数量相对于正常对照增加预示着受试者具有结直肠癌或胃肠疾病或病症，并且

其中受试者不具有胃肠疾病或病症家族病史或自身病史。