[发明专利]一种辅助筛选籼稻和粳稻的方法及其专用引物

说明书

技术领域

本发明涉及一种辅助筛选籼稻和粳稻的方法及其专用引物。

背景技术

栽培稻是世界上最重要的粮食作物之一，在其11,500多年的栽培稻驯化历史中，为适应不同的农业生态环境，栽培稻形成了丰富的遗传多样性和明显的遗传分化，产生了籼稻(indica)和粳稻(japonica)两个不同的生态型(Morishima H，Oka HI.Phylogenetic differentiation of cultivated rice.XXII.Numerableevaluation of the Indica-Japonica differentiation.Japanese Journal ofBreeding，1981，31：402-413；Glaszmann J C.Isozymes and classification ofAsian rice varieties.Theoretical and Applied Genetics，1987，74：21-30；Wang Z Y，Tanksley S D.Restriction fragment length polymorphism in OryzasativaL.Genome，1989，32：1113-1118；Blair M W，Panaud O，McCouch S R.Inter-simple sequence repeat(ISSR)amplification for analysis ofmicrosatellite motif frequency and fingerprinting in rice(Oryza sativa L.).Theoretical and Applied Genetics，1999，98(5)：780-782.))。它们之间在许多形态和生理性状上存在着明显的差异(Morishima H，Oka HI.Phylogeneticdifferentiation of cultivated rice.Numerical evaluations of theindica-japonica differentiation.Jpn.J.Breed，1981，31：402-413.WANGXiang-Kun，CHENG Kan-Sheng，HUAN Nai-Wei，LUO Jun，LU Yi-Xuan，LIUGuang-Rong.Study on two important rice types concerning the origin anddifferentiation of Asian cultivated rice.Acta Genetica Sinica，1987，14(4)：262-270.)。然而，水稻的籼-粳分化是一个缓慢的进化过程，在许多水稻地方种中存在着典型的籼稻或粳稻，但也存在籼粳分化不明显的中间型，对于这些类型很难用传统的方法来鉴定，更难研究水稻的籼粳分化程度。因此，开发新型的Marker基因及其分子标记来准确鉴定籼稻和粳稻，并且用其研究水稻的进化非常必要。

植物细胞色素P450是分子量为40-60KD、结构类似的一类血红素-硫铁蛋白。它以可溶性和膜结合两种形态存在于植物细胞内，可催化多种化学反应，在防御植物免受有害物质侵害方面具有重要作用。水稻中也含有水稻细胞色素P450基因，如基因LOC_Os11g27730。

发明内容

本发明的目的是提供一种辅助筛选籼稻和粳稻的方法。

本发明所提供的辅助筛选籼稻和粳稻的方法，是检测待测水稻中是否缺失AC132003中自5’末端第122836-124566位的核苷酸序列，若缺失，则待测水稻为候选籼稻，若不缺失则待测水稻为候选粳稻。

所述缺失具体可以通过PCR扩增进行检测。

其中，所述PCR扩增检测中所扩增的目的片段包括AC132003中自5’末端第122836-124566位核苷酸中至少1000bp的片段。

上述扩增中得到的PCR产物具体可用琼脂糖凝胶电泳进行检测。

所述PCR扩增检测中，所用到的引物具体可为如下的引物：其中的一条序列如序列表中序列1所示，另一条序列如序列表中序列2所示。