[发明专利]族性化学结构标引系统和标引方法有效
申请号: | 200710303862.1 | 申请日: | 2007-12-26 |
公开(公告)号: | CN101196963A | 公开(公告)日: | 2008-06-11 |
发明(设计)人: | 徐峻;刘延淮;王新毅 | 申请(专利权)人: | 北京时代楷模科技有限公司 |
主分类号: | G06F19/00 | 分类号: | G06F19/00 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 100083北京市海淀区*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 化学 结构 标引 系统 方法 | ||
1.一种族性化学结构标引系统,包括输入设备、显示装置、主存储器、存储设备、处理器和绘图工具,用于完成Markush结构数据的输入、存储、处理和输出,其特征在于:
绘图工具包括一标引操作主模块,一结构格式处理主模块,一分子结构显示主模块;
标引操作主模块用于管理系统的用户界面接口,接收用户由用户界面输入的各种绘图操作指令,并将用户绘制的分子骨架结构及取代基结构形成族性结构;
结构格式处理主模块用于实时的对用户输入的分子结构数据进行分析,并将分析结果转换为计算机可识别的族性结构的mol文件和windows位图(微软公司定义的一种图形文件格式)的图形文件,同时把所述图形文件保存到内存中;
分子结构显示主模块用于对图面上的分子结构数据进行结构处理,并通过用户界面接口显示结构信息;
用户由标引操作主模块完成Markush结构数据的输入,而结构格式处理主模块对用户输入的Markush结构数据进行存储和格式转换,并通过分子结构显示模块显示经过处理的、用户可识别的结构信息。
2.如权利要求1所述的一种族性化学结构标引系统,其特征在于:标引操作主模块包含一图形用户接口管理子模块,一族性结构标引子模块,一模板管理子模块,一配置管理子模块;其中图形用户接口管理子模块用于管理绘图工具与用户的交互界面,接收用户的操作指令;其中族性化学结构标引子模块用于绘制分子骨架结构和取代基结构,形成族性结构,并对输入的数据进行实时分析,将分析结果转换为结构显示状态,同时把图形数据转换为结构数据保存到内存中;模板管理子模块用于管理分子结构模板,通过模板管理操作窗口,把当前绘制的分子结构或存储器中的分子结构mol文件添加到指定的模板中,添加后用户可以直接在模板列表中调用分子结构模板;配置管理子模块用于管理用户对系统进行自定义设置的数据和文件,包括用户对输出SDF文件的自定义信息,以及常用原子列表的自定义信息。
3.如权利要求1所述的一种族性化学结构标引系统,其特征在于:结构格式处理主模块包括一结构图形转换子模块,一分子排列子模块,一分子旋转、放缩功能子模块;其中结构图形转换子模块用于提供一导出功能,可以把当前绘制的分子结构转换成windows位图图形数据;分子排列子模块用于提供纵向排列、横向排列功能;分子旋转、放缩功能子模块用于改变分子结构的显示尺寸和方向。
4.如权利要求1所述的一种族性化学结构标引系统,其特征在于:分子结构显示主模块还包括一错误显示子模块,一RGroup浏览子模块,一RGroup逻辑树子模块,一分子结构预览子模块;错误显示子模块对出现错误的分子结构或原子进行提示出错处理,其能够识别并做出相应处理的错误情况包括但不限于以下几种:
I)当绘制的化学结构中出现了价键错误的原子,则系统用与该原子化学结构图颜色相异的色圈圈中该原子;
II)当用户要把未设置取代点的分子添加到取代分子列表中时系统弹出对话框提示错误设置;
III)当用户要把含有游离分子结构,即包含已设置了连接点但未被添加到任何RGroup的取代基团的族性结构分子保存到文件中时,系统会提示发现非法游离取代基团;
IV)如果当前未定义Rn原子,此时往RGroup中添加取代基时系统提示未找到对应的RGroup定义;
V)如果族性分子结构中至少一个RGroup不含有任何分子结构,则在保存时会提示发现空RGroup。
5.如权利要求1所述的一种族性化学结构标引系统,其特征在于:族性化学结构标引系统主界面分割的区域中同时包含绘图区和浏览区,可分别扩大与缩小所述绘图区和浏览区尺寸。
6.如权利要求2所述的一种族性化学结构标引系统,其特征在于:族性结构标引子模块包含一确定结构标引子子模块,一Rn原子定义子子模块,连接点定义子子模块,一RGroup定义子子模块,一RLogic定义子子模块;其中确定结构标引子子模块用于绘制确定的、无可变基团的分子结构;其中Rn原子定义子子模块用于在分子结构中定义一个能够代表一类取代基的特殊原子;其中连接点定义子子模块用于为取代基团定义取代基与骨架结构的连接位置;Rgroup定义子子模块用于对取代基团进行分组设置;Rlogic定义子子模块用于对RGroup进行范围限定。
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