[发明专利]筛选家蝇抗菌肽基因的芯片及其制备方法无效
| 申请号: | 200710029080.3 | 申请日: | 2007-07-09 |
| 公开(公告)号: | CN101134982A | 公开(公告)日: | 2008-03-05 |
| 发明(设计)人: | 朱家勇;刘雷山;金小宝;马艳;王艳 | 申请(专利权)人: | 广东药学院 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 广州粤高专利代理有限公司 | 代理人: | 陈卫 |
| 地址: | 510006广东省广州*** | 国省代码: | 广东;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 筛选 家蝇 抗菌 基因 芯片 及其 制备 方法 | ||
1.一种筛选家蝇抗菌肽基因的芯片,包括基片,其特征在于基片上设有长50bp、Tm值为65~70℃、GC含量为40~60%的高度特异性寡核苷酸探针。
2.根据权利要求1所述的筛选家蝇抗菌肽基因的芯片,其特征在于所述探针是在GenBank数据库中获取昆虫抗菌肽基因序列,分析其编码区和保守结构域,用Array Designer 2.0生物学软件据其保守结构域设计。
3.根据权利要求1所述的筛选家蝇抗菌肽基因的芯片,其特征在于所述探针按微阵列排列在基片上。
4.根据权利要求1所述的筛选家蝇抗菌肽基因的芯片,其特征在于所述探针微阵列排列是将探针溶解于磷酸盐缓冲液中,用芯片点样仪III有序地点印在芯片上,每一探针重复点样三次,每一芯片设计12个独立的小矩阵,每个小矩阵由4行16列组成。
5.根据权利要求1所述的筛选家蝇抗菌肽基因的芯片,其特征在于所述基片是玻片。
6.一种权利要求1所述筛选家蝇抗菌肽基因芯片的制备方法,其特征在于包括以下步骤:
(1)设计探针,构建探针微阵列于芯片基片上,芯片经紫外交联处理后放暗盒中保存备用;
(2)芯片预杂交处理;
(3)提取和纯化家蝇脂肪体总RNA,逆转录成cDNA并标记上荧光标记物Cy3,与构建的寡核苷酸探针微阵列芯片杂交;
(4)经洗片、扫描处理后进行数据分析。
7.根据权利要求6所述筛选家蝇抗菌肽基因芯片的制备方法,其特征在于步骤(3)所述杂交是于37℃下杂交16小时。
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