本发明公开了一种筛选高产3‑甲基丁醛的乳酸乳球菌的PCR引物对和PCR方法及应用。本发明的筛选高产3‑甲基丁醛的乳酸乳球菌的PCR引物对包括如SEQ ID NO:2所示的上游引物和如SEQ ID NO:3所示的下游引物。本发明的筛选高产3‑甲基丁醛的乳酸乳球菌的PCR方法包括:以待测菌株的DNA为模板,以设计的PCR引物对为PCR引物,进行PCR扩增,将扩增的PCR产物进行凝胶电泳,根据凝胶电泳所得的条带大小筛选高产菌株本发明的筛选高产3‑甲基丁醛的乳酸乳球菌的PCR方法能够实现对高产3‑甲基丁醛的菌株进行高通量和精确快速的筛选。