本发明提供了一种与鼻咽癌相关的EB病毒miRNA的应用,主要是所述EB病毒miRNA在制备鼻咽癌诊断、预后判断、治疗效果评估试剂盒的应用。本发明还提供了一种用于鼻咽癌诊断、预后判断、治疗效果评估试剂盒,所述试剂盒包括与鼻咽癌相关的EB病毒miRNA。上述鼻咽癌相关的EB病毒miRNA包括如SEQ ID NO:1-12中的一种或多种序列。利用本发明提供的12种EB病毒miRNA,可通过血清检验EB病毒miRNA的表达水平而应用于鼻咽癌病人的早期诊断、预后判断、治疗效果评估及鼻咽癌高危人群检测和随访。同时,研究这些miRNA的靶基因也能为EB病毒致瘤提供依据。