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[发明专利]分子靶标蛋白的筛选方法、装置、计算机设备和存储介质-CN202010716290.5在审
发明人：印明柱;曹东升;杨素青;陈翔 -专利权人：中南大学湘雅医院
申请日： 2020-07-23 - 公布日： 2020-12-08 - 主分类号： G16B5/20 文献下载
摘要：本申请涉及一种分子靶标蛋白的筛选方法、装置、计算机设备和存储介质。方法包括：获取目标分子，采用不同靶标预测方式对目标分子进行靶标预测，得到预测靶标蛋白，根据预测靶标蛋白对应的预测方式的数量，对预测靶标蛋白进行筛选，得到目标分子对应的潜在靶标蛋白，获取与潜在靶标蛋白对应的定量构效关系模型，将目标分子输入定量构效关系模型，得到目标分子与潜在靶标蛋白的结合活性概率，根据结合活性概率和预设的概率阈值，从潜在靶标蛋白中筛选出与目标分子匹配的关键靶标蛋白。实现了精准可靠的靶标蛋白的筛选。
分子靶标蛋白筛选方法装置计算机设备存储介质

[发明专利]用于测量配体与靶标蛋白质的结合和细胞接合的方法-CN201680054321.7在审
发明人： D.K.特赖伯;E.梅尼凯利 -专利权人：欧陆迪斯卡沃爱克斯公司
申请日： 2016-01-06 - 公布日： 2018-08-03 - 主分类号： C12Q1/34 文献下载
摘要：公开了用于检测和定量测量化合物与靶标大分子的结合性质的方法，其中所述靶标大分子经受变性并且与诸如酶短片段的标记肽连接。所述方法使用流体混合物，所述流体混合物包含(i)嵌合分子，其包含与所述标记肽连接的靶标大分子的，其中所述靶标大分子可以是由完整活细胞表达并且在完整活细胞内的嵌合蛋白，和(ii)其与所述靶标大分子结合经测量的化合物，其中所述靶标大分子经受变性。在允许化合物(例如所述靶标大分子的小分子抑制剂)结合之后，例如通过酶片段互补检测来自所述标记肽的信号。该信号指示变性和未变性靶标大分子之间的差异，并且由此分别指示未与所述化合物结合的靶标大分子和与所述化合物结合的靶标大分子之间的差异。
靶标大分子变性标记肽化合物结合流体混合物活细胞小分子抑制剂靶标蛋白质测量配体定量测量方法使用结合性质嵌合蛋白嵌合分子细胞接合信号指示酶片段检测短片测量

[发明专利]基于深度学习的靶标预测系统及其方法-CN201910818054.1在审
发明人：邓代国;艾海涛;雷曾荣 -专利权人：广州费米子科技有限责任公司
申请日： 2019-08-30 - 公布日： 2019-12-03 - 主分类号： G16B15/30 文献下载
摘要：本发明是一种基于深度学习的靶标预测系统，其特征在于，该系统包括通过深度学习框架tensorflow进行算法的建模、通过使用RDkit、Numpy、Pandas进行数据处理的靶标预测模块，所述靶标预测模块包括靶标训练阶段和靶标预测阶段，所述靶标训练阶段通过对已知分子及其对应的靶标之间的关系的训练生成训练模型，靶标预测阶段通过将新的分子信息输入到训练模型中进行新的分子靶标概率的预测，通过对预测出的靶标概率的分析对比确定分子的靶标，其中通过将靶标预测模块采用深度学习框架tensorflow进行算法的建模、使用RDkit、Numpy、Pandas进行数据处理的方式使分子与靶标之间的关系的探索更高效准确，增加了分子靶标预测的准确率。
靶标预测模块预测分子靶标训练阶段训练模型数据处理建模算法化学键作用分析对比分子信息预测系统准确率概率卷积拓扑学习探索

[发明专利]基于高性能计算平台的小分子靶标核酸适配体计算机辅助筛选方法及小分子靶标核酸适配体-CN201910514445.4有效
发明人：刘书霞;赵新颖;裴智勇;杨杰;刘满姣;袁寒玉 -专利权人：北京市计算中心
申请日： 2019-06-14 - 公布日： 2021-05-07 - 主分类号： G16B15/00 文献下载
摘要：本发明提供了一种基于高性能计算平台的小分子靶标核酸适配体计算机辅助筛选方法，涉及分子生物学技术领域。首先对小分子靶标进行结构分析，其次在小分子化合物库中进行筛选，如符合匹配原则，则作为目标小分子靶标，与核酸分子进行分子对接，如不符合匹配原则，则可进行分子结构构建，将分子结构构建后的小分子靶标作为目标小分子靶标，与核酸分子进行分子对接，如果对接成功，则核酸分子为初选核酸适配体，解决了小分子靶标与核酸分子的结合位点少、亲和力弱，核酸分子抓靶困难、耗材多，小分子靶标结合核酸形成的复合物与核酸自身的大小、质量、电荷性质等方面差异较小
基于性能计算平台分子靶标核酸适配体计算机辅助筛选方法

[发明专利]基于化学基因组学的小分子靶标预测算法及其应用-CN202010165489.3有效
发明人：曹东升;杨素青 -专利权人：中南大学
申请日： 2020-03-11 - 公布日： 2023-05-12 - 主分类号： G16B15/30 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于化学基因组学的小分子靶标预测算法，该算法建立的模型可用于小分子的靶标预测，其中预测模型的构建方法包括建模数据收集、数据正负集的批分、配体蛋白特征的组合、模型构建等。本发明的小分子靶标预测算法是指给定一个预测分子，通过模型得出靶标的预测排名列表，列表中排名越靠前的靶标成为真实靶标的可能性越大。该小分子靶标预测算法通过将涉及不同方面信息的多个模型合并建立一个共识模型，能够获得稳定矫健的靶标预测性能。将其应用预测小分子靶标，预测准确率高。
基于化学基因组分子靶标预测算法及其应用

[发明专利]一种基于置换型荧光探针检测生物小分子的检测试剂盒及其使用方法-CN202310399629.7在审
发明人：杨成;崔胜楠;王越;孙冰冰;王国峰;李程铭;谷双超 -专利权人：大连理工大学
申请日： 2023-04-14 - 公布日： 2023-07-04 - 主分类号： G01N21/64 文献下载
摘要：本发明提供一种基于置换型荧光探针检测生物小分子的检测试剂盒及其使用方法，属于生化分析技术领域。本发明基于靶标分子可置换与其核酸适配体作用位点相同的荧光探针，通过荧光探针的荧光强度变化，实现靶标分子的高灵敏检测。荧光染料ThT能够与靶标分子适配体结合形成复合物限制分子内扭转，使得荧光显著增强，靶标分子加入后，由于靶标分子与适配体间亲和力强于ThT与适配体之间亲和力，ThT被靶标分子从复合物中置换出来，荧光强度变化与靶标分子浓度相关，能够高选择性、灵敏的检测靶标分子。本发明无需对适配体进行修饰或标记，检测不同生物小分子仅需更换相应适配体序列，操作简便，检测成本低，选择性好，具有广阔的应用前景。
一种基于置换荧光探针检测生物分子试剂盒及其使用方法

[发明专利]用于检测切换事件带有不同捕获分子的系留粒子生物传感器-CN201880005595.6在审
发明人： E·W·A·维瑟;L·J·范伊泽多恩;M·W·J·普林斯 -专利权人：埃因霍温科技大学
申请日： 2018-01-02 - 公布日： 2019-09-13 - 主分类号： G01N33/543 文献下载
摘要：用于生物感应靶标物质[110]的方法使用通过系留分子[102]系至表面[100]的粒子[104]的集合。第一捕获分子[106]附连至粒子[104]或附连至系留分子。第二捕获分子[108]附连至表面[100]或附连至系留分子。选择第一捕获分子[106]以结合靶标物质[110]并具有第一靶标解离速率，并且选择第二捕获分子[108]以结合靶标物质[110]并具有与第一靶标解离速率相差至少三倍的第二靶标解离速率。检测粒子的空间坐标参数的时间系列，并且在检测的时间系列内鉴定靶标物质与捕获分子的个体关联/解离事件的时间序列。每个事件对应于第一捕获分子[106]和第二捕获分子[108]与靶标物质[110]的结合状态之间的变化。从鉴定的个体联合/解离事件的时间序列确定靶标物质的浓度。还描述了竞争性测定配置。
捕获分子靶标物质解离附连粒子靶标时间系列时间序列检测空间坐标参数竞争性测定生物传感器方法使用结合状态生物感应集合关联配置联合

[发明专利]用于鉴别肠球菌属内四个种的特异性分子靶标及其快速检测方法-CN202211671259.X在审
发明人：相欣然;陆佳冉;徐晓炜;刘婷婷;刁恩杰;宋虎卫;钱时权;梁肖娜 -专利权人：淮阴师范学院
申请日： 2022-12-26 - 公布日： 2023-06-23 - 主分类号： C12Q1/689 文献下载
摘要：本发明公开了用于鉴别肠球菌属内四个种的特异性分子靶标及其快速检测方法，分子靶标为：碱基序列SEQ ID NO.1‑7为酪黄肠球菌的分子靶标、碱基序列SEQ ID NO.8‑27为粪肠球菌的分子靶标、碱基序列SEQ ID NO.28‑32为屎肠球菌的分子靶标、碱基序列SEQ IDNO.33‑58为希拉肠球菌的分子靶标。检测方法：根据58个特异性分子靶标中的任一个分子靶标来设计特异性扩增引物对；提取样品DNA，PCR法扩增；凝胶电泳检测扩增产物，如电泳结果出现相应的单一扩增条带，则判断样品中含有目标菌，反之则判断样品中不含目标菌
用于鉴别球菌四个特异性分子靶标及其快速检测方法

[发明专利]一种利用小分子微阵列实现靶标垂钓和表征的方法-CN201510487225.9有效
发明人：朱劲松;王瑞;杨墨;程志强;李少鹏;周文菲 -专利权人：国家纳米科学中心
申请日： 2015-08-10 - 公布日： 2017-02-22 - 主分类号： G01N33/68 文献下载
摘要：本发明提供了一种利用小分子微阵列实现靶标垂钓和表征的方法。本发明所述方法包括以下步骤(1)将小分子微阵列芯片放在表面等离子体共振成像生物传感器上，通入混合蛋白溶液，进行靶标垂钓；(2)通过物理手段和化学手段相结合对步骤(1)靶标垂钓之后的小分子微阵列芯片进行处理；(3)对步骤(2)处理后的小分子微阵列芯片进行原位质谱检测来实现靶标蛋白的表征。本发明方法可以实现对靶标蛋白的靶标垂钓，获取靶标蛋白与微阵列上小分子相互作用的动力学信息，本发明利用原位重生技术，应用质谱实现对靶标蛋白的原位表征，从而更加准确地确定靶标蛋白的种类。
一种利用分子阵列实现靶标垂钓表征方法

[发明专利]微阵列芯片检测中核苷酸序列的颗粒标记方法-CN201310651906.5有效
发明人：李阳;张冠斌;蒋迪;项光新;邢婉丽;程京 -专利权人：博奥生物有限公司;清华大学
申请日： 2013-12-05 - 公布日： 2014-04-30 - 主分类号： G01N33/58 文献下载
摘要：本发明公开的一种在利用微阵列芯片检测靶标分子的方法包括如下步骤：颗粒表面包被上若干个功能基团，记作功能化颗粒；每种靶标分子都标记有修饰基团，记作修饰化靶标分子；所述功能基团与所述修饰基团能够结合；利用功能化颗粒和发光基团使每种修饰化靶标分子都能发光，从而实现对靶标分子的标记。本发明公开的颗粒标记方法可以直接或间接对靶标分子进行荧光标记，这种标记方法不但能够大幅度的降低荧光检测的成本，同时避免了传统的荧光标记方法在利用PCR富集靶标核酸分子过程中的抑制作用。
阵列芯片检测核苷酸序列颗粒标记方法

[发明专利]靶标检测方法、靶标检测用器件、靶标检测装置及靶标检测用试剂盒-CN202180051930.8在审
发明人：宫内祐树;蓼沼崇;田口朋之 -专利权人：横河电机株式会社
申请日： 2021-07-30 - 公布日： 2023-05-26 - 主分类号： C12M1/00 文献下载
摘要：本发明提供靶标检测方法、靶标检测用器件、靶标检测装置以及靶标检测用试剂盒，检测样本中包含的靶标的靶标检测方法，在设置有用荧光分子修饰的由所述靶标与特异性地结合于所述靶标的捕捉分子结合而得到的结合物的基板的固相面与包含吸收激发所述荧光分子的激发光或从所述荧光分子发出的荧光的吸光物质的溶液接触的状态下
靶标检测方法器件装置试剂盒

[发明专利]一种天然药物分子靶标蛋白的冷启动筛选方法-CN202110408770.X有效
发明人：施建宇;赵鹏程;吕诚 -专利权人：西北工业大学
申请日： 2021-04-16 - 公布日： 2022-06-10 - 主分类号： G16B15/30 文献下载
摘要：本发明涉及一种基于局部网络相似性比较的天然药物分子靶标蛋白的冷启动筛选方法，用以完成天然药物分子与靶标相互作用关系的初筛。方法采用冷启动的方法对全新的天然药物分子与靶标之间有无连边的可能性进行预测，即当一个天然药物分子没有已知靶标的连边数据时，可以通过本发明进行与现有靶标的连边可能性预测。核心思想是：“结合于同一靶标的药物分子拥有相似的分子子结构”。本方法相对于传统的方法有较高的便捷性，可以用更少的时间和精力为天然药物分子筛选出置信度较高的靶点，为后续天然药物分子目标靶蛋白的筛选提供方向。
一种天然药物分子靶标蛋白冷启动筛选方法

[发明专利]一种用于快速筛查农药混合污染物靶标分子的LAMP引物组合物及其方法-CN202210016749.X在审
发明人：房彦军;吴瑾;潘志辉;孙景然;席令仪;赵尊全;刘明珠;白家磊 -专利权人：军事科学院军事医学研究院环境医学与作业医学研究所
申请日： 2022-01-07 - 公布日： 2023-07-18 - 主分类号： C12Q1/6888 文献下载
摘要：本发明涉及一种用于快速筛查农药混合污染物靶标分子的LAMP引物组合物及其方法。通过靶标分子实现筛查，靶标分子为农药混合暴露联合肝毒性靶标分子，LAMP引物包括LAMP外引物、LAMP内引物和LAMP环引物；组合物各组分如下：2.5μL 10倍缓冲液、1.5μL硫酸镁、3.5μL 本发明针对农药混合污染暴露所致肝脏毒性效应靶标分子不明确的问题，通过建立毒性效应评价的L02肝细胞暴露模型，利用转录组学测序结合生物信息学分析技术，明确与肝脏毒性作用相关的多元靶标分子，结合等温扩增特异性引物设计，以实现对其所致肝脏毒性靶标分子的高通量筛查。
一种用于快速农药混合污染物靶标分子 lamp 引物组合及其方法

[发明专利]靶标打分函数优化方法及系统-CN202310376045.8在审
发明人：杨合;李红春;陈显翀 -专利权人：中国科学院深圳先进技术研究院
申请日： 2023-03-30 - 公布日： 2023-07-14 - 主分类号： G16C10/00 文献下载
摘要：本发明涉及一种靶标打分函数优化方法，包括：a.选择相应的有机小分子类型及其数量，进行混合溶剂分子动力学模拟；b.根据混合溶剂分子动力学模拟结果，构建对应靶标的靶标‑配体复合物结构与结合自由能数据库；c.使用构建好的数据库对打分函数的权重进行训练，为靶标结合口袋附近的原子分配不同的权重。本发明还涉及一种靶标打分函数优化系统。本发明充分考虑了靶标的个体特征，提升了分子对接的筛选性能。
靶标打分函数优化方法系统

[发明专利]一种荧光成像检测系统及其方法-CN202310898745.3有效
发明人：高阳;韩改净 -专利权人：北京航空航天大学杭州创新研究院;杭州乐为生医科技有限公司
申请日： 2023-07-21 - 公布日： 2023-09-26 - 主分类号： G06T7/00 文献下载
摘要：本申请涉及荧光成像检测技术领域，其具体地公开了一种荧光成像检测系统及其方法，其首先获取靶标分子的荧光检测图像；然后对所述荧光检测图像进行图像分析以得到荧光检测特征；接着，基于所述荧光检测特征，生成优化荧光检测图像；最后，对所述优化荧光检测图像进行图像语义分割以得到靶标分子的数量统计值。这样，其能够有效地对于靶标分子的荧光检测图像进行优化，从而更准确地检测出靶标分子的数量统计值，优化了靶标分子检测的准确性和灵敏度。
一种荧光成像检测系统及其方法

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