本发明涉及分子鉴定技术领域,尤其涉及鉴定黄水仙的DNA特异性位点和鉴定黄水仙的方法和应用,所述鉴定黄水仙的DNA特异性位点的序列如SEQ IDNO.1所示。所述鉴定黄水仙的方法,包括以下步骤:利用PCR扩增待测样品的SEQ ID NO.1序列并进行测序,所述PCR扩增的引物为:SEQ ID NO.2和SEQ IDNO.3;当测出序列碱基符合条件,则判定待测样品为黄水仙本发明的有益效果在于:与传统的形态学鉴定方法和DNA指纹标记相比,本发明利用SEQ IDNO.1序列进行PCR扩增和测序,直接获得鉴定结果,不用依赖相关鉴定人员形态学鉴定经验,检测准确性高、可重复性高,鉴定时间短。