本发明公开了花青苷糖基转移酶和酰基转移酶及其编码基因和应用。糖基转移酶LrGT7、LrGT16、LrGT22的氨基酸序列分别如SEQ ID NO.5、SEQ ID NO.6、SEQ ID NO.7所示,酰基转移酶LrAT81的氨基酸序列如SEQ ID NO.8所示本发明从黑果枸杞中克隆获得糖基转移酶基因LrGT71、LrGT16、LrGT22和酰基转移酶基因LrAT81,其编码的蛋白能催化花青苷的糖基化及酰基化生成比具有多个修饰基团的稳定花青苷,在稳定花青苷的体内体外生物合成中具有重要的应用价值,亦或对其他物种来源的糖基转移酶基因和酰基转移酶基因的筛选与鉴定具有参考作用和重要的意义。