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[发明专利]筛选免疫组库测序生物标志物的方法、设备和存储介质-CN202110766932.7有效
发明人：范文涛;王勇斯;陈辉;李连凤;谢洪涛;温韵洁;李奎 -专利权人：广州华银康医疗集团股份有限公司;广州华银医学检验中心有限公司;广州华银医学研究所有限公司
申请日： 2021-07-07 - 公布日： 2022-07-19 - 主分类号： G16B35/20 文献下载
摘要：本公开涉及一种用于筛选免疫组库测序生物标志物的方法、计算设备和存储介质。该方法包括：确定样本中的每一种克隆的初始绝对丰度；基于样品内克隆基因的初始绝对丰度、样品内所有克隆的绝对丰度的总和，计算样品内克隆基因的第一相对丰度；响应于确定克隆基因的初始绝对丰度大于预定阈值，确定克隆基因的第一绝对丰度为1；基于样品内克隆基因的第一绝对丰度、样品内所有克隆的第一绝对丰度的总和，计算样品内克隆基因的第二相对丰度；针对候选克隆基因进行第一检验和第二检验，以便确定免疫组库测序生物标志物，第二检验不同于第一检验本公开能够显著提高所筛选出的免疫组库的生物标志物的可靠性。
筛选免疫组库测序生物标志方法设备存储介质

[发明专利]用于早产结果的早期风险评估的方法和系统-CN201780018749.0有效
发明人：沙尔米拉·谢卡尔·曼德;穆罕默德·蒙佐尔·哈克;阿尼班·杜塔;尼什尔·库马尔·平纳;米塔利·麦钱特 -专利权人：塔塔咨询服务有限公司
申请日： 2017-02-15 - 公布日： 2021-08-31 - 主分类号： A61K31/702 文献下载
摘要：从来自怀孕受试者的微生物组样本获得微生物组表征数据。根据微生物组表征数据生成的“微生物分类丰度简档”包含微生物组样本中存在的微生物的丰度值。针对“微生物分类丰度简档”计算“分类构成偏度”值和分布特征值，量化来自微生物分类丰度简档的微生物的丰度值的偏差。基于集合DSR的分布特征值或“分类构成偏度”值确定早产的风险，其中集合DSR包括量化了来自微生物组样本的微生物的丰度值中的偏差的值。
用于早产结果早期风险评估方法系统

[发明专利]一种肠道微生态差异菌分类处理方法及肠道健康评估方法-CN202110764854.7有效
发明人：陈晓春;王小军;覃涛 -专利权人：广西爱生生命科技有限公司
申请日： 2021-07-06 - 公布日： 2023-04-07 - 主分类号： G06F18/24 文献下载
摘要：本发明公开了一种肠道微生态差异菌分类处理方法及肠道健康评估方法，包括：步骤S10，采集样本集合A，所述样本集合A包括至少由非健康组样本DG和对照组样本CG组成的n个样本；步骤S11，将每个样本的数字化特征由绝对丰度转换为相对丰度；步骤S12，将样本集合A中的全部样本根据绝对丰度的相似度分成k组肠型，分类后得到的肠型集合记为AB，再将肠型集合AB中的非健康组样本DG和对照组样本CG分开，将非健康组样本集合记为DG*，对照组样本集合记为CG*；步骤S13，计算非健康组样本集合DG*和对照组样本集合CG*的相对丰度差异并排序，得到k组肠型各自对应的差异特征DF。本发明不仅能够对高维且丰度变化范围大的样本特征进行有效提取，而且抗干扰性能更强。
一种肠道生态差异分类处理方法健康评估

[发明专利]监测工具和诊断方法-CN202080022505.1在审
发明人： Z·V·马歇尔·琼斯;R·斯汤顿;R·海多克;C·奥弗林;P·沃森 -专利权人：马斯公司
申请日： 2020-01-20 - 公布日： 2021-11-05 - 主分类号： G16H50/20 文献下载
摘要：提供了评估猫科动物微生物组健康的方法。该方法尤其包括测定猫的微生物组的健康状况，包括对四种或更多种细菌物种进行定量，并通过与对照数据集比较丰度来确定四种或更多种细菌物种的相对丰度，其中丰度的增大或减小能指示不健康的微生物组。
监测工具诊断方法

[发明专利]一种人体肠道健康状态的特征表达方法及其评估方法-CN202110255643.0在审
发明人：陈晓春 -专利权人：广西爱生生命科技有限公司
申请日： 2021-03-09 - 公布日： 2021-06-18 - 主分类号： G16H50/30 文献下载
摘要：本发明提供了一种人体肠道健康状态的特征表达方法及其评估方法，其中人体肠道健康状态的特征表达方法包括：准备A组样本和B组样本；计算各个菌种在A组样本和B组样本的频率和相对丰度，得到A组样本的优势菌集合GA和B组样本的优势菌集合GB；根据输入样本的各个菌种的相对丰度，得到输入样本的alpha多样性参数；通过A组样本的聚类中心点和聚类半径等计算输入样本与A组样本的相似度；通过输入样本中输入样本中优势菌集合GA的集体丰度以及输入样本中优势菌集合GB的集体丰度得到输入样本的健康系数。
一种人体肠道健康状态特征表达方法及其评估

[发明专利]用于改进的质谱分析法定量作用的方法和装置-CN201380015675.7有效
发明人： R·佐巴瑞夫;Y·硫特维斯基 -专利权人：塞莫费雪科学(不来梅)有限公司
申请日： 2013-03-28 - 公布日： 2017-08-11 - 主分类号： H01J49/00 文献下载
摘要：在此披露一种从质谱数据量化一种或多种分析物的方法，该方法包括从自一个色谱柱洗脱的一个第一分析物组获得一个第一质谱数据组；从自一个色谱柱洗脱的一个第二分析物组获得一个第二质谱数据组；其中每个数据组中的大多数分析物是两个数据组所共有的；确定每个数据组中至少一些分析物的表观丰度；选择一种分析物作为一种目标分析物，并且依据多种分析物就保留时间而言与该目标分析物的局部性来为该目标分析物确定多种局部化相邻分析物；基于该第一数据组与该第二数据组之间在这些所确定的局部化相邻分析物的表观丰度方面的差异来确定该目标分析物的一个局部校正后丰度；并且基于该目标分析物的校正后丰度来对其进行量化。这些相邻分析物中的大多数的实际丰度在该第一数据组与该第二数据组之间典型地是大致不变的，并且可以用于比对这些数据组之间的丰度。
用于改进谱分析法定作用方法装置

[发明专利]基于多组学丰度信息的蛋白质二级质谱鉴定方法-CN201610737420.7有效
发明人：谢尚潜;肖传乐;谢志 -专利权人：中山大学中山眼科中心
申请日： 2016-08-26 - 公布日： 2019-03-19 - 主分类号： G01N27/62 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于多组学丰度信息的蛋白质二级质谱鉴定方法。该基于多组学丰度信息的蛋白质二级质谱鉴定方法包括如下步骤：1)利用转录组或翻译组多组学的丰度信息数据和实验图谱数据的初步鉴定结果，构建初步鉴定蛋白和多组学丰度信息的对应关系；2)通过初步关系评估多组学丰度信息的蛋白鉴定能力；3)将多组学丰度信息的蛋白鉴定能力融入到实验图谱和理论图谱的肽段打分中，选择得分最高的肽段作为此实验图谱的最终鉴定结果。基于多组学丰度信息的蛋白质二级质谱鉴定方法的鉴定有效质谱量和蛋白质肽段数均高于目前的算法，同时能多核并行快速运行，鉴定效率大大提高。
基于多组学丰度信息蛋白质二级鉴定方法

[发明专利]一种基于期望最大化算法的宏基因组丰度估计方法及系统-CN202310103910.1在审
发明人：马昀然;刘俊锋;郭昊;李诗濛;任用 -专利权人：江苏先声医学诊断有限公司;北京先声医学检验实验室有限公司;江苏先声诊断技术有限公司
申请日： 2023-02-07 - 公布日： 2023-06-23 - 主分类号： G16B30/10 文献下载
摘要：本申请属于生信分析技术领域，具体涉及一种基于期望最大化算法(EM)的宏基因组丰度估计方法，包括基于宏基因组测序数据的比对信息，引入参考基因组唯一比对位置的比例量化物种参考基因组相似度对比对信息的影响，构建统计模型刻画观测到的唯一比对和多重比对出现的概率；采用EM求解所构建的统计模型，估计宏基因组中的物种丰度。本申请由于量化了物种参考基因组相似度的影响，因此能够在物种水平上提高宏基因组丰度估计的准确性，进而改善宏基因组物种鉴定的灵敏度和特异度。
一种基于期望最大化算法宏基组丰度估计方法系统

[发明专利]一种利用定量PCR技术测定真菌丰度的方法-CN201910009926.X在审
发明人：王雅琼;李军乔 -专利权人：青海民族大学
申请日： 2019-01-05 - 公布日： 2019-04-26 - 主分类号： C12Q1/6851 文献下载
摘要：本发明公开了一种利用定量PCR技术测定真菌丰度的方法，利用18S rRNA基因丰度来估算真菌的丰度。从单细胞酵母菌中提取基因组DNA，用PCR扩增目标基因，该基因作为已知数量的目标模板建立标准曲线。实验表明，本发明方法测定浮游真菌丰度真实可靠，并且高效易行。
丰度真菌技术测定定量PCR 提取基因组DNA 酵母菌分光光度计标准曲线目标基因目标模板基因浮游估算

[发明专利]用作轻度认知障碍标志物的肠道微生物组及其应用、鉴定轻度认知障碍模型-CN202211001560.X在审
发明人：张弓;陈洋;肖艳青 -专利权人：深圳承启生物科技有限公司
申请日： 2022-08-19 - 公布日： 2022-11-04 - 主分类号： C12Q1/6883 文献下载
摘要：本申请涉及认知障碍标志物的技术领域，具体公开了一种用作轻度认知障碍标志物的肠道微生物组及其应用。肠道微生物组包括相对丰度显著增加菌属和相对丰度显著减少菌属，相对丰度显著增加菌属包括假单胞菌属、变形杆菌属、厌氧菌属、互养菌属和水栖菌属等中的一种或多种；所述相对丰度显著减少菌属包括瓦菌属、链球菌属、阪崎肠杆菌属、毛螺菌属和布劳特氏菌属等中的一种或多种；肠道微生物组的应用包括用于制备检测所述肠道微生物组的产品和鉴定轻度认知障碍模型的构建。本申请的肠道微生物组具有实现轻度认知障碍筛查的优点。
用作轻度认知障碍标志肠道微生物及其应用鉴定模型

[发明专利]用于儿童ASD诊断的母源肠道菌群标志物及其应用-CN202210465977.5在审
发明人：徐玉兵;陈禹;孟晓伟;肖玲;董沁 -专利权人：上海金域医学检验所有限公司
申请日： 2022-04-29 - 公布日： 2022-08-12 - 主分类号： C12Q1/689 文献下载
摘要：该标志物选自CAG8、CAG10和CAG16丰度共变化组中的至少一组菌群；所述CAG8丰度共变化组为具有SEQ ID NO.1‑SEQ ID NO.12所示特征序列的菌群；所述CAG10丰度共变化组为具有SEQ ID NO.13‑SEQ ID NO.17所示特征序列的菌群；所述CAG16丰度共变化组为具有SEQ ID NO.18‑SEQ ID NO.22所示特征序列的菌群。该母源肠道菌群标志物能够在早期诊断儿童ASD，且具有高灵敏度及特异性的优势。且基因测序技术客观，不会受到主观影响，粪便样本具有无创、易于运输保存，利于开展大规模人群筛查。
用于儿童 asd 诊断肠道标志及其应用

[发明专利]检测人体肠道宏基因组的细菌群落及丰度的方法-CN201410431106.7在审
发明人：侯涛;刘富;刘云;康冰;张潇 -专利权人：吉林大学
申请日： 2014-08-28 - 公布日： 2015-11-25 - 主分类号： G06F19/24 文献下载
摘要：一种检测人体肠道宏基因组的细菌群落及丰度的方法，属于生物信息鉴定领域。本发明的目的是利用已测序细菌的基因组作为参考基因组，基于支持向量数据描述（SVDD）模型检测肠道宏基因组中未知DNA片段细菌群落的检测人体肠道宏基因组的细菌群落及丰度的方法。本发明利用SVDD模型对已知细菌的DNA序列进行分类训练，然后根据分类训练结果检测肠道宏基因组中包含的DNA片段来自的细菌群落及丰度。
检测人体肠道宏基细菌群落方法

[发明专利]一种基于正交基的高光谱图像丰度估计方法-CN201910075848.3有效
发明人：赵岩;周真 -专利权人：黑龙江科技大学
申请日： 2019-01-25 - 公布日： 2023-03-24 - 主分类号： G06T7/40 文献下载
摘要：一种基于正交基的高光谱图像丰度估计方法，涉及高光谱图像处理技术。以解决现有方法存在运算复杂度的问题。该算法利用Gram‑Schmidt方法计算端元向量组得到对应的正交基组，求解解混方程组，解得每个正交基的特征向量。将待解混光谱向量向特征向量投影，计算该投影向量的长度与正交基的长度比，得到正交基所代表端元的丰度估计。经过不同算法的比较分析，该算法只需进行向量内积运算，减小了运算复杂度，缩短高光谱图像丰度估计时间，提高了高光谱图像丰度估计效率。通过模拟数据和实际图像数据实验，验证了算法的有效性。
一种基于正交光谱图像估计方法

[发明专利]一种健康人群N-糖肽生理丰度范围的构建方法及其应用-CN202110228407.X有效
发明人：秦伟捷;董航言;李圆圆;尚诗婷 -专利权人：北京蛋白质组研究中心;中国人民解放军军事科学院军事医学研究院
申请日： 2021-03-02 - 公布日： 2023-02-07 - 主分类号： G01N30/02 文献下载
摘要：本发明提供了一种构建健康人群N‑糖肽生理丰度范围的方法，并提供了基于构建的健康人群N‑糖肽生理丰度范围筛选疾病异常N‑糖肽潜在标志物的方法。本发明以及尿液N‑糖肽生理丰度范围的构建，为基于尿液糖蛋白质组学的功能与机制研究和临床生物标志物筛选提供了新的方法与思路。
一种健康人群糖肽生理范围构建方法及其应用

[发明专利]微生物组健康指数-CN201880066008.4在审
发明人：肯尼斯·F·布朗特;威廉姆·道格拉斯·香农;埃琳娜·戴池;考特尼·琼斯;格雷戈里·J·弗卢特 -专利权人：雷柏奥提斯有限公司
申请日： 2018-10-12 - 公布日： 2020-06-05 - 主分类号： C12Q1/689 文献下载
摘要：用于评估微生物群的示例方法可以包括从患者获取粪便样品；量化来自粪便样品中的选定的纲类组的细菌的相对丰度；根据来自选定的纲类组的细菌的相对丰度，计算微生物组健康指数，以及将微生物组健康指数与患者的身体状况相关联
微生物健康指数

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