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[发明专利]利用参考基因组信息的半导体测序平台的测序数据校正方法-CN201610265225.9有效
发明人：冯伟兴;薛丁恺;赵森;陈多娇;贺波 -专利权人：哈尔滨工程大学
申请日： 2016-04-26 - 公布日： 2018-04-17 - 主分类号： G06F19/20 文献下载
摘要：1)利用半导体测序平台测序数据中检测碱基的解读长度与参考基因组中对应碱基的长度一致时的测得电压值，计算碱基长度已知时测得电压值的先验概率分布；2)当半导体测序平台测序数据中检测碱基的解读长度与参考基因组中对应碱基的长度不一致时，对测序数据的碱基长度进行校正，利用下式计算测得电压值已知时，假定碱基长度为l时的值Sl；取Sl最大时对应的碱基长度l，即为测得电压值已知时被测碱基的碱基长度，完成测序数据校正。本发明创新性地提出测得电压值解算碱基长度的过程中，在测得电压值基础上，引入参考基因组信息，以实现对测序数据的校正。
利用参考基因组信息半导体平台序数校正方法

[发明专利]MPL基因多态性检测用探针及其用途-CN201080049710.3无效
发明人：平井光春;小森真理子 -专利权人：爱科来株式会社
申请日： 2010-10-29 - 公布日： 2012-10-17 - 主分类号： C12N15/00 文献下载
摘要：(P1)寡核苷酸，其由碱基长度为9～50碱基长度、含有序列编号1中的碱基序号11535～11543的碱基序列构成，并且在3’末端区域具有上述碱基序号11543的碱基；(P1’)寡核苷酸，其由与上述(P1)寡核苷酸互补的碱基序列构成；(P2)寡核苷酸，其由碱基长度为10～50碱基长度、含有序列编号1中的碱基序号11535～11544的碱基序列构成，并且在3’末端区域具有上述碱基序号11544的碱基(P2’)寡核苷酸，其由与上述(P2)寡核苷酸互补的碱基序列构成。
mpl 基因多态性检测探针及其用途

[发明专利]JAK2基因的外显子12中的突变的检测方法、以及用于所述检测方法的核酸探针和试剂盒-CN201110110594.8有效
发明人：小森真理子 -专利权人：爱科来株式会社
申请日： 2011-04-29 - 公布日： 2011-11-09 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：多态性检测用探针，该探针用于检测JAK2外显子12基因的多态性，其特征在于，由下列（ａ）-（ｃ）中至少一种寡核苷酸构成：（ａ）由与包含序列编号１中示出的碱基序列中碱基编号114至132的19～50个碱基长度的碱基序列互补的序列相同的序列构成的寡核苷酸，（ｂ）由与包含序列编号１中示出的碱基序列中碱基编号122至143的22～50个碱基长度的碱基序列互补的序列相同的序列构成的寡核苷酸，和（ｃ）由与包含序列编号11中示出的碱基序列中碱基编号41至50的10～50个碱基长度的碱基序列相同的序列构成的寡核苷酸。
jak2 基因外显子 12 中的突变检测方法以及用于核酸探针试剂盒

[发明专利]一种基因序列比对方法、PE配置控制器及可读存储介质-CN201810581126.0有效
发明人：赵健;崔星辰;尹云峰 -专利权人：郑州云海信息技术有限公司
申请日： 2018-06-07 - 公布日： 2021-10-22 - 主分类号： G16B30/10 文献下载
摘要：其中，方法包括选取PE阵列中数量值与第一碱基序列、第二碱基序列和第三碱基序列的长度值分别相同的目标PE阵列，并根据第一碱基序列的长度值为第二类目标PE阵列和第三类目标PE阵列设置多路选择器的节点位置；依次比较当前种子序列的待扩展长度值和第一碱基序列、第二碱基序列和第三碱基序列之间的长度值大小关系，将当前种子序列发送至满足长度差值条件的目标PE阵列中进行扩展。本申请通过设置可变逻辑长度和物理长度的脉动阵列，根据种子序列的待扩展长度值选择PE数量合适的目标PE阵列进行扩展，提高了FPGA的资源利用率，提升了Smith‑Waterman序列比对算法打分阶段的处理性能
一种基因序列方法 pe 配置控制器可读存储介质

[发明专利]一种IonTorrent测序数据中多聚碱基的长度判定方法-CN201510537025.X有效
发明人：冯伟兴;陈多娇;贺波;李紫薇;王雪莹;徐斯文 -专利权人：哈尔滨工程大学
申请日： 2015-08-28 - 公布日： 2018-04-17 - 主分类号： G06F19/22 文献下载
摘要：本发明属于分子生物信息检测与分析领域，具体涉及一种Ion Torrent测序数据中多聚碱基的长度判定方法。本发明包括(1)Ion Torrent实验数据的获取与多聚碱基信息提取；(2)基因组基本信息的获取及多聚碱基基本信息的提取；(3)多聚碱基长度已知的电压值贝叶斯先验概率计算；(4)判定基因组基本信息和电压值贝叶斯先验概率的多聚碱基长度并对权值参数优化；(5)多聚碱基长度判定。本发明通过所发明的方法可以高精度地依据Ion Torrent测序得到的检测电压值对该电压值对应的多聚碱基的长度进行判定，以生成更加准确的Ion Torrent测序结果，从而为后续更高层次的应用分析提供数据保障
一种 ion torrent 序数据中多聚碱基长度判定方法

[发明专利]疾病相关基因的多态性检测用探针及其用途-CN201080008254.8在审
发明人：细见敏也;小森真理子 -专利权人：爱科来株式会社
申请日： 2010-12-07 - 公布日： 2012-01-11 - 主分类号： C12N15/09 文献下载
摘要：(P1)碱基长度为11～50个碱基，由与包含序列编号1中碱基序号220～230的碱基序列互补的碱基序列构成，且在5’末端区域具有与上述碱基序号230的碱基互补的碱基的寡核苷酸；(P1’)由与上述(P1)的寡核苷酸互补的碱基序列构成的寡核苷酸；(P2)碱基长度为15～50个碱基，由与包含序列编号1中碱基序号220～234的碱基序列互补的碱基序列构成，且在5’末端区域具有与上述碱基序列234的碱基互补的碱基的寡核苷酸；(P2’)由与上述(P2)的寡核苷酸互补的碱基序列构成的寡核苷酸；(P3)碱基长度为17～50个碱基，由与包含序列编号1中碱基序号220～236的碱基序列互补的碱基序列构成，且在5’末端区域具有与上述碱基序列236的碱基互补的碱基的寡核苷酸；(P3’)由与上述(P3)的寡核苷酸互补的碱基序列构成的寡核苷酸。
疾病相关基因多态性检测探针及其用途

[发明专利]EGFR基因多态性检测用探针及其用途-CN201080049734.9有效
发明人：伊集院萌子 -专利权人：爱科来株式会社
申请日： 2010-10-29 - 公布日： 2012-07-18 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：(P1)寡核苷酸，其由碱基长度为22～50碱基长度、与含有序列编号1中的碱基序号334～355的碱基序列互补的碱基序列构成，在3’末端区域具有与上述碱基序号334的碱基互补的碱基，(P2)寡核苷酸，其由与上述(P1)的寡核苷酸互补的碱基序列构成。
egfr 基因多态性检测探针及其用途

[发明专利]一种基因组短序列映射的快速处理方法及系统-CN200910252466.X有效
发明人：李瑞强;朱红梅;王俊;杨焕明;汪建 -专利权人：深圳华大基因研究院
申请日： 2009-12-11 - 公布日： 2010-06-23 - 主分类号： G06F19/00 文献下载
摘要：本发明适用于基因工程技术领域，提供了一种基因组短序列映射的快速处理方法及系统，所述方法包括下述步骤：将测序序列按预设长度短串的碱基值排序；将序列片段重叠群逐个碱基切割成所述预设长度的短串；依次根据所述序列片段重叠群中所切割成的短串的碱基值在排序后的测序序列中查找相应的测序序列在本发明中，通过将测序序列按预设长度短串的碱基值排序，并将序列片段重叠群逐个碱基切割成预设长度的短串，依次根据序列片段重叠群中所切割成的短串的碱基值在排序后的测序序列中查找相应的测序序列，建立映射关系，
一种基因组序列映射快速处理方法系统

[发明专利]一种短序列映射方法及系统-CN200810218337.4无效
发明人：阮珏;朱红梅;李瑞强;王俊;杨焕明;汪建 -专利权人：深圳华大基因研究院
申请日： 2008-12-12 - 公布日： 2009-05-13 - 主分类号： G06F19/00 文献下载
摘要：本发明适用于基因工程技术领域，提供了一种短序列映射方法及系统，所述方法包括下述步骤：将测序序列按预设长度前缀短串的碱基值排序；将序列片段重叠群逐个碱基切割成所述预设长度的短串；依次根据所述序列片段重叠群中所切割成的短串的碱基值在排序后的测序序列中查找相应的测序序列在本发明中，通过将测序序列按预设长度前缀短串的碱基值排序，并将序列片段重叠群逐个碱基切割成预设长度的短串，依次根据序列片段重叠群中所切割成的短串的碱基值在排序后的测序序列中查找相应的测序序列，建立映射关系
一种序列映射方法系统

[发明专利]一种基于双链DNA保护的荧光探针及在制备检测恶性疟原虫乳酸脱氢酶药物中的应用-CN201610356262.0有效
发明人：吴玉清;王威贤;李洪伟 -专利权人：吉林大学
申请日： 2016-05-26 - 公布日： 2018-10-30 - 主分类号： G01N21/64 文献下载
摘要：DNA为双链结构，一条链由互补链DNA和模板链DNA组成，另一条链由互补链DNA和富含G碱基DNA组成；模板链DNA是银纳米簇合成过程中的保护基团，能够与银纳米簇表面配位，阻止银纳米簇的进一步增大；富含G链DNA通过靠近银纳米簇，增强银纳米簇的荧光发射强度；互补链DNA其长度为10～30个碱基，且富含A(腺嘌呤)和T(胸腺嘧啶)碱基；模板链DNA其长度为10～20个碱基，且富含C(胞嘧啶)碱基；富含G碱基DNA其长度为10～25个碱基，且富含G碱基。
一种基于 dna 保护荧光探针制备检测恶性疟原虫乳酸脱氢酶药物中的应用

[发明专利]内包核酸的高分子微囊复合体及其制造方法-CN201480043775.5有效
发明人：片冈一则;长田健介;赛奥弗里斯·阿格里斯·由佳利 -专利权人：国立研究开发法人科学技术振兴机构
申请日： 2014-08-05 - 公布日： 2019-06-11 - 主分类号： A61K9/107 文献下载
摘要：本发明的内包核酸的高分子微囊复合体，其特征在于，其由含有非电荷性亲水性高分子链嵌段及阳离子性高分子链嵌段的嵌段共聚物、与包含1000个碱基长度以上的彼此互补的碱基序列的2条单链DNA、至少双螺旋结构的一部分解离为单链结构的1000个碱基对长度以上的双链DNA、或1000个碱基长度以上的1条单链DNA形成。
核酸高分子复合体及其制造方法

[发明专利]一种改进的ARMS引物结构(Super-ARMS)及其使用方法-CN201611159646.X有效
发明人：江风阁;林清华;陈婷;陈曦;阮力;宋庆涛 -专利权人：厦门艾德生物医药科技股份有限公司
申请日： 2016-12-15 - 公布日： 2019-08-23 - 主分类号： C12Q1/6858 文献下载
摘要：本发明公开了一种改进的ARMS引物结构(Super‑ARMS)及其使用方法，包括：正向特异引物，它包括如下三部分：1)第一序列，其长度为18‑40个碱基，其中3′末端第1位碱基为突变位置，3′末端第2‑4位有一错配碱基，其余碱基和待测序列互补；2)第二序列，其长度为6‑20个碱基，其和第一序列3′端序列互补；3)spacer,其连接第一序列的5′末端和第二序列的3′末端；反向通用引物，其长度为15‑40个碱基，和待测序列的另一条链互补；其中，所述的反向引物的Tm值比正向引物的第一序列的Tm值低3‑8℃。
碱基反向通用引物错配碱基反向引物特异引物突变位置序列互补正向引物位碱基条链正向改进

[发明专利]基于DNA存储的信息编码方法、装置、计算机设备及介质-CN202210432503.0在审
发明人：黄奕翼;戴俊彪 -专利权人：中国科学院深圳先进技术研究院
申请日： 2022-04-23 - 公布日： 2022-08-30 - 主分类号： G16B50/30 文献下载
摘要：存储的信息编码方法、装置、计算机设备及介质，其中，该方法包括：获取以二进制序列的形式存储的文件；基于二进制‑DNA转换映射表，将二进制序列以字节为单位进行分割得到二进制序列片，将每一二进制序列片映射到一个碱基片，再将所有碱基片依次合并后形成DNA信息，每一碱基片满足如下构成条件：长度为五，G碱基和C碱基的数量和为t，满足0.4≤t/5≤0.6，边界不存在重复碱基，中间不存在连续三个重复碱基；将文件以DNA信息的形式进行保存该方法可严格保证编码后的全部DNA信息中的连续重复碱基长度最长只有2、GC含量介于0.4和0.6之间，算法具有线性复杂度，净信息密度为1.60。
基于 dna 存储信息编码方法装置计算机设备介质

[发明专利]与质量标记连接的杂文探针-CN98803287.2无效
发明人： G·施密特;A·H·汤普森;R·A·W·约翰斯通 -专利权人：布拉克斯集团有限公司
申请日： 1998-01-15 - 公布日： 2000-04-12 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：每个探针包含与既定长度的已知碱基序列相连的质量标记,其中阵列的每个质量标记(任选的与已知碱基序列在一起)通过质谱法与该碱基序列关联。
质量标记连接杂文探针

[发明专利]甘蓝型油菜角果长度性状的主效QTL位点、SNP分子标记及应用-CN201810641613.1有效
发明人：向阳;杜才富;唐敏强;刘胜毅 -专利权人：贵州省油菜研究所
申请日： 2018-06-21 - 公布日： 2021-07-02 - 主分类号： C12Q1/6895 文献下载
摘要：本发明提供一种甘蓝型油菜角果长度性状的主效QTL位点，位于甘蓝型油菜的A09染色体的第27633011位碱基～第28268829位碱基之间。较佳地，对甘蓝型油菜角果长度性状的贡献率为53.49％。与第一SNP分子标记紧密连锁，第一SNP分子标记位于第27633011位碱基，为A或G，该突变导致多态性。与第二SNP分子标记紧密连锁，第二SNP分子标记位于第28268829位碱基，为A或C，该突变导致多态性。与峰值SNP分子标记紧密连锁，峰值SNP分子标记位于第28132534位碱基，为T或A，该突变导致多态性。还提供了相关的SNP分子标记及应用。本发明的甘蓝型油菜角果长度性状的主效QTL位点对甘蓝型油菜角果长度性状的贡献率高，对甘蓝型油菜角果长度的调控起着关键作用，可用作图位克隆和分子标记辅助选择，适于大规模推广应用。
甘蓝油菜长度性状 qtl snp 分子标记应用

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