本发明公开了一种与水稻幼芽期耐冷基因CTES11b紧密连锁的InDel标记,该InDel标记的序列为AGGCTACGCACCAATCT;定位于SEQ ID No.2所示核苷酸序列的第203至221碱基之间,当第203至221碱基之间的序列缺失时,具有水稻幼芽期耐冷基因CTES11b,表现为耐冷。本发明鉴定到第11染色体上的幼芽期耐冷基因CTES11b以及可对其进行基因型鉴别的共显性分子标记。通过幼芽期耐冷基因CTES11b标记的辅助筛选,能够获得幼芽期耐冷能力显著提高的水稻品种或材料。
本发明公开了一种水稻孕穗期耐冷基因及其应用,涉及基因工程技术领域。本发明提供一种水稻孕穗期耐冷基因OsLeng8,所述基因具有如下(a)或(b)的核苷酸序列:(a)如SEQ ID No:1所示的核苷酸序列组成;(b)SEQ ID No:1所示的核苷酸序列经过添加、取代或缺失一个或几个碱基而生成的,并编码水稻孕穗期耐冷功能蛋白的核苷酸序列。本发明发现了OsLeng8基因为水稻孕穗期耐冷性相关基因,为水稻育种提供新的基因资源和育种资源,可用于研究水稻孕穗期耐冷机理和发现更多的调控水稻孕穗期耐冷的基因,对于通过遗传育种和基因工程方法利用该基因资源有效地调控水稻孕穗期耐冷具有重要的应用价值