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[发明专利]虚拟子代画像的分析方法、系统及存储介质-CN201910561115.0在审
发明人：李昌龙 -专利权人：北京颐康源医院管理有限公司
申请日： 2019-06-26 - 公布日： 2020-12-29 - 主分类号： G16B25/10 文献下载
摘要：本发明公开了一种虚拟子代画像的分析方法、系统及存储介质，包括步骤：获取母本基因组和父本基因组；将母本基因组中的基因与父本基因组中的基因进行组合，获得与所述母本基因组和所述父本基因组对应的虚拟子代基因样本；将所述子代基因组分别与预设基因库进行比对；根据与所述预设基因库比对成功的子代基因组的数量，和所述虚拟子代基因样本中所述子代基因组的数量的商，计算与各个预设性状对应的第一预测值；根据与各个预设性状对应的所述第一预测值生成子代画像
虚拟子代画像分析方法系统存储介质

[发明专利]基于亲本基因型与子代表型的全基因组关联分析方法-CN202111037346.5有效
发明人：夏晓勤;石米娟;张婉婷;程莹寅 -专利权人：中国科学院水生生物研究所
申请日： 2021-09-06 - 公布日： 2022-07-26 - 主分类号： G16B20/30 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于亲本基因型与子代表型的全基因组关联分析方法，包括以下步骤：获取待分析群体的亲本基因型、子代表型以及子代父母本信息，根据亲本对的基因型建立子代的组合基因型矩阵，获得每个SNP位点不同子代的可能基因型组合信息，以及对应的子代群体分组表型数据，构建子代组合基因型与对应子代表型的统计模型进行关联分析，获取表型与各SNP位点的关联P值；之后区分SNP位点的关联类型，计算是否符合加性或完全显性效应，对候选位点进行筛选；再根据全基因组SNP标记的LD衰减获得强相关标记的平均距离，用于最终标记集合的筛选。
基于亲本基因型子代表型基因组关联分析方法

[发明专利]一种基于DH系混样建库和基因型填充的基因型分型方法及其应用-CN202310183038.6在审
发明人：李为国;曹明月;雷雨婷;周福洋;肖金华;田冰川;唐顺学 -专利权人：华智生物技术有限公司
申请日： 2023-02-28 - 公布日： 2023-06-02 - 主分类号： C12Q1/6895 文献下载
摘要：本发明涉及基因预测技术领域，尤其是涉及一种基于DH系混样建库和基因型填充的基因型分型方法及其应用，其基因型分型方法具体包括以下步骤：步骤S1、对不同DH群体的亲本进行高密度基因型检测；步骤S2、对所述不同DH群体的子代群体进行混样和低密度基因型检测，获得DH子代混样低密度基因型数据；步骤S3、对所述DH子代混样低密度基因型数据进行拆分，得到DH子代单样低密度基因型数据；步骤S4、利用步骤S1的检测数据，对所述DH子代单样低密度基因型数据进行填充，得到DH子代高密度基因型数据。采用本发明的方法可快速、准确、高效地鉴定大规模DH子代基因型，在育种领域具有广泛的应用价值。
一种基于 dh 系混样建库基因型填充方法及其应用

[发明专利]基于高通量全基因组测序的多亲本作物基因型鉴定-CN202110131330.4在审
发明人：韩斌;朱舟;王阿红 -专利权人：中国科学院分子植物科学卓越创新中心
申请日： 2021-01-30 - 公布日： 2022-08-02 - 主分类号： G16B20/20 文献下载
摘要：本发明提供了基于高通量全基因组测序的多亲本作物基因型鉴定。具体地，包括：(a)对于n个亲本及其子代，提供待鉴定的子代作物的测序数据Df，以及与所述子代作物相应的亲本作物的测序数据Dp，其中n为≥3的正整数；(b)基于所述测序数据Df和所述测序数据Dp，确定亲代和子代的SNP位点信息；(c)基于所述的SNP位点信息，对子代的基因型进行判断，从而获得所述子代的各个SNP的评定结果以及所述子代的全基因组的各染色体上的重组断裂点的分布信息；(d)构建和/或绘制所述子代的基因型图谱，从而获得所述多亲本作物的基因型鉴定结果。本发明的方法可高通量、快速、准确的对多亲本作物基因型进行鉴定。
基于通量基因组亲本作物基因型鉴定

[发明专利]一种基于区块链的数字资产合成方法及装置-CN202210762540.8在审
发明人：李辉忠;白兴强;陈宇杰;莫楠;石翔;张开翔;范瑞彬 -专利权人：深圳前海微众银行股份有限公司
申请日： 2022-06-29 - 公布日： 2022-09-13 - 主分类号： G06F16/27 文献下载
摘要：本发明实施例提供了一种基于区块链的数字资产合成方法及装置，该方法包括任一区块链节点在检测到数字资产合成交易时，对k个待合成的数字资产具有的基因序列进行异或运算，生成初始子代基因序列，在确定区块链上存在初始子代基因序列时，基于未被使用的随机基因序列，对初始子代基因序列进行第i次基因替换，生成属于第i次基因替换的有序子代候选集，若确定j个候选基因序列均存在于区块链中，则对初始子代基因序列进行第i+1次基因替换，直至对初始子代基因序列进行第n‑1次基因替换后为止，从而确定新数字资产具有的基因序列。如此，该方案可以有效地确保在不同区块链节点上针对生成的新数字资产具有的基因序列的执行结果是一致的。
一种基于区块数字资产合成方法装置

[发明专利]同时合并基因分型的方法-CN201780029265.6有效
发明人： J.P.格尔克;H.R.斯诺格伦埃里克森;F.特赫诺 -专利权人：先锋国际良种公司
申请日： 2017-05-03 - 公布日： 2022-01-04 - 主分类号： A01H1/04 文献下载
摘要：提供的是从合并样品确定子代植物基因型的方法。所述方法包括在两个或更多个子代植物中对标记等位基因进行基因分型，每个子代植物来源于具有已知的基因型的亲本的不同亲本杂交。所述方法利用计算机模拟反卷积实施隐马尔科夫建模，以从所述合并样品产生的遗传信号确定至少一个子代植物中的一个或多个标记基因座的每个可能基因型的概率。本发明方法提供在子代植物基因分型方面增加的效率。
同时合并基因方法

[发明专利]一种网络结构搜索方法及装置-CN202110157050.0在审
发明人：骆剑平;石睿 -专利权人：深圳大学
申请日： 2021-02-04 - 公布日： 2021-06-04 - 主分类号： G06N3/04 文献下载
摘要：所述方法包括：采用基因融合规则，将待预测子代的基因和种群中已有个体的基因分别进行融合，得到待预测基因融合结果；确定所述待预测基因融合结果的个体性能关系；其中，所述待预测基因融合结果的个体性能关系用于表示所述待预测基因融合结果中所述待预测子代的个体性能与所述已有个体的个体性能之间的优劣关系；根据各所述待预测基因融合结果的个体性能关系，确定所述待预测子代的适应度值；根据所述待预测子代的适应度值，从所述待预测子代中选择最优子代。
一种网络结构搜索方法装置

[发明专利]一种识别猕猴桃杂交亲本对子代基因组贡献比例的方法-CN201611013760.1有效
发明人：刘义飞;李大卫;张琼;黄宏文 -专利权人：中国科学院华南植物园
申请日： 2016-11-17 - 公布日： 2019-08-23 - 主分类号： C12Q1/6895 文献下载
摘要：本发明公开一种识别猕猴桃杂交亲本对子代基因组贡献比例的方法。它包括：对杂交双亲和子代及远缘外类群进行基因组低深度测序；测序数据的参考基因组比对和单碱基变异信息获取；基于单碱基变异的基因组窗口划分和对数可能性估计；分窗口最大可能基因树构建和置信区间估计；杂交双亲在基因树水平与子代遗传关系统计及基因组贡献比例预测本发明利用整基因组变异信息解析杂交亲本与杂交子代的进化遗传关系，使得对杂交子代特征性状的预测具有较高的准确性；同时使用该方法可以在杂交子代形成的童期对其可能存在的表型特征变异的幅度和方向进行预测，可以极大的促进杂交株系的早期筛选
基因组杂交杂交子代亲本单碱基变异子代遗传关系基因树猕猴桃预测基因组变异可能性估计表型特征测序数据人力物力特征性状信息获取信息解析杂交株系置信区间最大可能比对测序构建远缘进化筛选参考统计

[发明专利]一种脱靶位点的检测方法、装置及终端设备-CN201711168540.0有效
发明人：贺建奎;陈凯婧;陈杨冉 -专利权人：南方科技大学
申请日： 2017-11-21 - 公布日： 2021-09-10 - 主分类号： G16B30/10 文献下载
摘要：本发明适用于基因组学技术领域，提供了一种脱靶位点的检测方法、装置及终端设备，包括：选取基因样本，所述基因样本包括子代基因样本和所述子代基因样本的亲本基因样本；通过全基因组测序分别对所述子代基因样本和所述亲本基因样本进行处理，并根据指定的比对规则将测序后的所述子代基因样本和所述亲本基因样本进行比对；将所述比对的结果进行格式转换，生成指定格式的比对结果文件；通过综合基因组学查看器IGV显示所述指定格式的比对结果文件，以便用户确认脱靶数目和脱靶位点
一种脱靶检测方法装置终端设备

[发明专利]一种不依赖先证者或参照者的单基因病的单体型构建方法-CN202110878286.3在审
发明人：费嘉;乔国枝;孙蕾;肖丹;张倩 -专利权人：北京嘉宝仁和医疗科技有限公司
申请日： 2021-08-02 - 公布日： 2021-09-03 - 主分类号： G16B20/20 文献下载
摘要：本发明提供了一种不依赖先证者或参照者的单基因病的单体型构建方法，包括：单基因病目标区域扩增并获取基因测序数据；筛选母亲测序数据和父亲测序数据中判断子代胚胎中2条DNA链来源的SNP位点集合N1和SNP位点集合N2；提取各子代胚胎测序数据中的SNP位点集合N1‑1、SNP位点集合N2‑1；依据SNP位点杂合碱基的分布规律，判断各子代胚胎中母亲DNA链来源和父亲DNA链来源并构建子代胚胎单体型；在子代胚胎中寻找含致病突变的胚胎作为“先证者”，依据孟德尔遗传规律并结合子代胚胎单体型，判断各子代胚胎是否携带致病基因链。本发明的单体型构建方法不依赖先证者或参照者，即可准确判断子代胚胎是否携带致病基因。
一种不依赖先证者参照基因体型构建方法

[发明专利]一种基因组胞嘧啶位点表观基因型分型方法-CN201710064216.8有效
发明人：张德强 -专利权人：北京林业大学
申请日： 2017-02-04 - 公布日： 2019-01-29 - 主分类号： G16B30/10 文献下载
摘要：本发明提供了一种基因组胞嘧啶位点表观基因型分型方法，包括以下步骤：1)对待测样品父母本和子代样本进行重亚硫酸盐全基因组甲基化测序，获得父母本和子代样本基因组序列；2)将父母本和子代样本基因组序列与参考基因组比对获得比对结果，确定待测胞嘧啶位点；3)将比对结果进行染色体坐标排序、reads去重复处理，再通过GATK2‑V3.2对已知胞嘧啶位点上下游5～10bp的序列进行Call SNPs，从而区分子代等位基因序列；4)将已获得的被区分过子代等位基因序列与父母本基因组序列比对，完成胞嘧啶表观基因型分型。本发明首次完成了基因组胞嘧啶位点表观基因型分型，技术成熟，成本低，易于操作与推广应用。
一种基因组胞嘧啶表观基因型方法

[发明专利]一种预测地中海贫血病表型的方法及终端设备-CN202010015324.8在审
发明人：何恩明;笑天;康康;李腾;唐森威;郑强;陈钢 -专利权人：深圳市早知道科技有限公司
申请日： 2020-01-07 - 公布日： 2020-05-22 - 主分类号： G16B20/20 文献下载
摘要：本发明实施例公开了一种预测地中海贫血病表型的方法及终端设备，用于通过生物信息学的原理，可以提供一种方式，根据父母基因型预测子代地中海贫血表型，为产前遗传咨询提供工具支持。本发明实施例方法包括：获取父亲和母亲的地中海贫血病基因型；根据所述父亲和母亲的地中海贫血病基因型，使用孟德尔遗传规律，计算得到子代的每种基因型组合和对应的概率；根据所述子代的每种基因型组合和对应的概率，确定所述子代的每种基因型组合的表型预测；输出所述子代的每种基因型组合和对应的概率以及表型预测。
一种预测地中海贫血病表型方法终端设备

[发明专利]一种子代均自交亲和的枸杞育种方法-CN202110671539.X在审
发明人：秦垦;高燕;戴国礼;李彦龙;焦恩宁;黄婷;张波;何盺孺;周旋;段淋渊;石志刚;赵建华;闫亚美;何军;李晓莺;米佳;万如;巫鹏举;安巍;曹有龙;张曦燕;王翠平;赵启凤;王玉静 -专利权人：宁夏农林科学院枸杞科学研究所
申请日： 2021-06-17 - 公布日： 2021-09-24 - 主分类号： A01H1/02 文献下载
摘要：本发明公开了一种子代均自交亲和的枸杞育种方法，属于枸杞育种技术领域，包括以下步骤：(1)纯合自交S2基因子代的创制：使用含有自交亲和S2单基因的种质作为亲本进行组配；用引物1对子代实生苗进行检测，筛选出的阳性株为子代I；用引物2对子代I进行检测，剔除该步骤阳性株后，得纯合自交S2基因子代，即子代均自交亲和的枸杞种苗。本发明方法通过创制可以与任意基因类型的种质杂交均可自交亲和的核心种质，创制了一种杂交子代无需分子检测判定均自交亲和的育种方法。
一种子代亲和枸杞育种方法

[发明专利]一种RdRp可调控表达和活体观测的小鼠模型的构建方法-CN201010209986.5有效
发明人：尹文;孙梦宁;赵亚;吕欣;雷迎峰;杨敬;康健;马玉;兰海云;姚敏 -专利权人：中国人民解放军第四军医大学
申请日： 2010-06-28 - 公布日： 2010-11-10 - 主分类号： A01K67/027 文献下载
摘要：本发明公开了一种RdRp可调控表达和活体观测的小鼠模型的构建方法，分别以基因组重组了RdRp可调控表达载体的转基因小鼠和Cre/Lap双转基因小鼠为亲本进行杂交，选择繁殖能力强的亲本的子代，且通过PCR扩增鉴定基因组包含Cre、Lap和RdRp基因的个体，作为Cre/Lap/RdRp三转基因小鼠的F1代子代；分别以F1代子代和正常的小鼠为亲本进行杂交，筛选繁殖能力强，并且基因组包含Cre、Lap和RdRp基因的子代个体，继续与正常小鼠交配，繁殖扩群，直至得到Cre/Lap/RdRp稳定遗传的模型小鼠。
一种 rdrp 调控表达活体观测小鼠模型构建方法

[发明专利]扁蓿豆SSR标记的检测引物组、试剂盒及其应用和扁蓿豆自交亲和基因型的筛选方法-CN201810519657.7有效
发明人：李俊;黄帆;李鸿雁;李志勇;刘磊;师文贵 -专利权人：中国农业科学院草原研究所
申请日： 2018-05-25 - 公布日： 2021-09-14 - 主分类号： C12Q1/6895 文献下载
摘要：本发明提供了一种扁蓿豆SSR标记的检测引物组、试剂盒及其应用和扁蓿豆自交亲和基因型的筛选方法，涉及生物技术领域，该扁蓿豆的SSR标记检测引物组和包含该引物组的试剂盒，能够特异性的扩增扁蓿豆的SSR标记，使用该引物组分别扩增母本和该母本子代的SSR标记可以比较子代与母本的SSR标记的异同，从而判断该子代为杂交子代或者自交子代。在使用上述引物组筛选扁蓿豆亲和基因型的方法中，通过比较母本与子代基因型得到母本的自交率，可发掘自交亲和基因型的母本，缓解了现有技术中存在的缺乏一种准确快速筛选扁蓿豆自交亲和基因型的方法的技术问题。
扁蓿豆 ssr 标记检测引物试剂盒及其应用亲和基因型筛选方法

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