本发明属于生物药物技术领域,具体涉及一种抗H5亚型禽流感纳米抗体蛋白及其编码基因与应用。所述的抗H5亚型禽流感病毒纳米抗体蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示。该纳米抗体蛋白特异性针对甲型H5亚型禽流感病毒可以解决现有H5亚型禽流感诊断试剂研发过程中抗体亲和力低、生产过程中纯度低、检测过程中灵敏度低的问题。本发明进一步将抗H5亚型禽流感病毒纳米抗体蛋白在大肠杆菌体内和麦芽糖结合蛋白标签融合表达,可实现快速检测抗原,并应用于甲型H5亚型禽流感快速检测试剂盒的开发,且该融合蛋白可用于防治甲型H5亚型禽流感产品的开发