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[发明专利]碱基序列重组系统及方法-CN201310369701.8在审
发明人：朴旻 -专利权人：三星SDS株式会社
申请日： 2013-08-22 - 公布日： 2014-05-14 - 主分类号： G06F19/18 文献下载
摘要：本发明公开一种碱基序列重组系统及方法。根据本发明的一个实施例的碱基序列重组系统包括：映射位置计算单元，从由短片段生成的多个种子序列中选择一个种子序列，并计算选择的种子序列在对象碱基序列中的映射位置；全局比对单元，从计算出的所述映射位置计算针对所述选择的种子序列的重复判断区域，并判断在计算出的所述重复判断区域中是否已执行全局比对，判断结果如果没有执行，则在计算出的所述映射位置上执行针对所述短片段的全局比对（Global Alignment）。
碱基序列重组系统方法

[发明专利]基于人工智能的多对多碱基判读-CN202180015480.7在审
发明人： A·杜塔;G·韦瑟尔;D·卡什夫哈吉吉;K·贾加纳坦;A·起亚 -专利权人：因美纳有限公司
申请日： 2021-02-19 - 公布日： 2022-09-30 - 主分类号： G16B30/00 文献下载
摘要：本发明所公开的技术涉及基于人工智能的碱基判读。本发明所公开的技术涉及访问针对测序运行的测序循环生成的每循环分析物通道集的进展；通过基于神经网络的碱基判读器(NNBC)针对测序运行的测序循环的窗口处理进展中的每循环分析物通道集的窗口，使得NNBC针对测序运行的测序循环的对象窗口处理进展中的每循环分析物通道集的对象窗口，并使用该NNBC从特定测序循环出现在不同的位置的多个窗口在测序循环的对象窗口中生成针对三个或更多个测序循环的临时碱基判读预测，以生成针对该特定测序循环的临时碱基判读预测；以及基于该多个碱基判读预测确定针对该特定测序循环的碱基判读
基于人工智能碱基判读

[发明专利]一种改进的ARMS引物结构(Super-ARMS)及其使用方法-CN201611159646.X有效
发明人：江风阁;林清华;陈婷;陈曦;阮力;宋庆涛 -专利权人：厦门艾德生物医药科技股份有限公司
申请日： 2016-12-15 - 公布日： 2019-08-23 - 主分类号： C12Q1/6858 文献下载
摘要：本发明公开了一种改进的ARMS引物结构(Super‑ARMS)及其使用方法，包括：正向特异引物，它包括如下三部分：1)第一序列，其长度为18‑40个碱基，其中3′末端第1位碱基为突变位置，3′末端第2‑4位有一错配碱基，其余碱基和待测序列互补；2)第二序列，其长度为6‑20个碱基，其和第一序列3′端序列互补；3)spacer,其连接第一序列的5′末端和第二序列的3′末端；反向通用引物，其长度为15‑40个碱基，和待测序列的另一条链互补；其中，所述的反向引物的Tm值比正向引物的第一序列的Tm值低3‑8℃。
碱基反向通用引物错配碱基反向引物特异引物突变位置序列互补正向引物位碱基条链正向改进

[发明专利]用于识别阳性重排的方法、计算设备和计算机存储介质-CN202210073465.4有效
发明人：王凯;陈惠 -专利权人：至本医疗科技（上海）有限公司;上海至本医学检验所有限公司
申请日： 2022-01-21 - 公布日： 2022-11-08 - 主分类号： G16B20/20 文献下载
摘要：该方法包括：获取关于待测样本的比对结果数据；提取支持多种重排的跨断点的多个支持读长；针对多种重排中的每种重排，记录支持读长的对应断点之前预定长度和对应断点之后的预定长度范围之内的每个基因组位置上关于多种碱基的碱基类型数据，以便生成关于支持读长的对应断点的第一碱基类型数据；以及生成关于参考基因组的对应断点的第二碱基类型数据；基于第一碱基类型数据和第二碱基类型数据，生成输入特征；以及经由重排预测模型生成关于阳性重排的预测结果
用于识别阳性重排方法计算设备计算机存储介质

[发明专利]基于细胞游离DNA的深度测序数据提取生物标记物的方法和装置-CN201711276870.1有效
发明人：万季;宋麒;潘有东;崔好;韩艳;高峰 -专利权人：北京新合睿恩生物医疗科技有限公司
申请日： 2017-12-06 - 公布日： 2022-08-05 - 主分类号： G16B20/20 文献下载
摘要：方法包括由处理器执行的如下步骤：获取不同类别的样本的细胞游离DNA的深度测序数据；计算每个样本数据在每个碱基位置的各变异的频率值；基于所计算的每个碱基位置的各变异的频率值，得到每个类别在所有碱基位置上的变异的频率分布
基于细胞游离 dna 深度序数提取生物标记方法装置

[发明专利]个体RHD基因合子型测定的PCR引物及试剂盒及测定方法-CN200810213676.3无效
发明人：邵超鹏 -专利权人：深圳市血液中心
申请日： 2004-03-25 - 公布日： 2010-06-23 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明的引物用于检测RHD基因的第一外显子，其上游引物的3’端位置是在相对RHD基因编码区第一个碱基位置的-554位碱基处，下游引物的3’端位置是在RHD基因第一内含子的第18位碱基处。
个体 rhd 基因合子测定 pcr 引物试剂盒方法

[发明专利]一种凡纳滨对虾的耐低温关联的SNP分子标记、检测引物及其应用-CN202010468453.2有效
发明人：黄文;王国霞;孙慧明;陈晓瑛;舒琥;郑春田 -专利权人：广东省农业科学院动物科学研究所
申请日： 2020-05-28 - 公布日： 2021-10-19 - 主分类号： C12Q1/6888 文献下载
摘要：所述的SNP分子标记的序列如SEQ ID NO.1所示，所述的凡纳滨对虾的SNP分子标记是：SEQ ID NO.1所示序列的第1,925碱基位置的G/C基因型或G/G基因型；或第3,414、3,475和3,537碱基完全连锁，其为A/A基因型或A/C基因型；或第3,776碱基位置的T/T基因型或T/G基因型；或第6,679碱基位置的A/C基因型或A/A基因型。
一种凡纳滨对虾低温关联 snp 分子标记检测引物及其应用

[发明专利]含有Cry3A基因转基因作物核酸扩增用引物序列-CN02125638.1无效
发明人：朱文斯;黄茜华;朱水芳 -专利权人：深圳市匹基生物工程股份有限公司;国家出入境检验检疫局动植物检疫实验所
申请日： 2002-07-26 - 公布日： 2004-01-28 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：所述的最优三对引物中的每对引物的延伸范围是指：由上游引物和下游引物组成的引物对，在该引物对的上游引物位置前延10个碱基，后延10个碱基。而引物对的下游引物位置前延10个碱基，后延10个碱基，在上述引物对的上下游延伸位置的区域范围内得到引物序列。
含有 cry3a 基因转基因作物核酸扩增引物序列

[发明专利]含有NptⅡ基因转基因作物核酸扩增用引物序列-CN02125639.X无效
发明人：朱文斯;黄茜华;朱水芳 -专利权人：深圳市匹基生物工程股份有限公司;国家出入境检验检疫局动植物检疫实验所
申请日： 2002-07-26 - 公布日： 2004-01-28 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：所述的两对最优引物中的每对引物的延伸区域范围是：由上游引物、下游引物组成的引物对，在该引物对的上游引物位置前延10个碱基，后延10个碱基，而引物对的下游引物位置前延10个碱基，后延10个碱基，在上述引物对的上下游延伸位置的区域范围内得到的引物序列
含有 npt 基因转基因作物核酸扩增引物序列

[发明专利]一种凡纳滨对虾生长性状关联的snp分子标记、检测引物及其应用-CN202210097538.3有效
发明人：黄敏伟;黄文;陈晓瑛;李朝政 -专利权人：广东省农业科学院动物科学研究所
申请日： 2022-01-27 - 公布日： 2022-05-13 - 主分类号： C12Q1/6888 文献下载
摘要：所述的SNP分子标记是SEQ ID NO.1所示序列的第6053碱基位置的A/A基因型或A/C基因型；或第6058碱基位置的C/C基因型或A/C基因型；或第6534碱基位置的T/T基因型或T/G基因型；或第6865碱基位置的A/T基因型或T/T基因型。
一种凡纳滨对虾生长性状关联 snp 分子标记检测引物及其应用

[发明专利]一种小型化碱基编辑器及其构建方法与应用-CN202211204191.4在审
发明人：程田林;张淑倩;邱佳怡 -专利权人：复旦大学
申请日： 2022-09-29 - 公布日： 2023-04-07 - 主分类号： C12N9/78 文献下载
摘要：本发明涉及基因编辑技术领域，涉及一种碱基编辑器及其构建方法与应用。本发明通过将脱氧腺苷脱氨酶及变体融合于Cas12f1为代表的突变型核酸酶的不同位点，得到的新融合蛋白能对位于前间隔序列不同位置的腺嘌呤实现有效且高精度的A‑G碱基突变。本发明的碱基编辑器体积更小，且活性窗口多样化，可实现更广范围、更精细且安全性更高的A‑G单碱基替换，能有效拓宽单碱基编辑工具的应用。
一种小型化碱基编辑器及其构建方法应用

[发明专利]一种应用于DNA测序的图像处理系统-CN201510872776.7有效
发明人：任鲁风;冯玉臣;张睿;陈哲;刘元杰;蔡亦梅;高静;范东雨;王绪敏;王者馥;殷金龙 -专利权人：北京中科紫鑫科技有限责任公司
申请日： 2015-12-02 - 公布日： 2017-06-23 - 主分类号： C12M1/34 文献下载
摘要：本发明涉及一种应用于DNA测序的图像处理系统，所述的图像处理及控制系统获取图谱信息，在对每个图谱Δt的采样时间间隔内分别获取m个图谱，m为偶数；对同一碱基的拍照图谱进行分组，然后通过冗余判定的方式进行判定，并与标准的碱基图谱信息进行比对，A，T，C，G四种碱基信息，确定图谱信息中包含的碱基类型。本发明中冗余判断的方式，能够有效判断图谱采集存在问题的准确位置，方便采取措施，且软件运行的成本较低，可根据准确性任意设置图谱采集频率，适合大规模应用；同时又避免单一的灰度值对碱基类型的误判。
一种应用于 dna 图像处理系统

[发明专利]一种基于纠错的基因组测序数据无损压缩方法及相关设备-CN202210744033.1在审
发明人：王荣杰;刘贤明;朱泽轩 -专利权人：鹏城实验室
申请日： 2022-06-28 - 公布日： 2022-09-27 - 主分类号： G06F16/13 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于纠错的基因组测序数据无损压缩方法及相关设备，所述方法包括：识别并纠正原始测序短片段中的测序碱基错误，并记录碱基错误信息，所述碱基错误信息包括测序错误的碱基位置及原碱基；将原始测序短片段归类到纠正后的索引区域文件中，并将测序错误纠正信息加入到索引区域文件中；对不同的索引区域文件内原始测序短片段中的碱基序列进行排序并进行压缩，得到基因组测序数据的压缩结果文件。本发明实现了高效的测序短片段测序错误的纠正，通过纠正碱基当中的测序错误，使得更多相似测序短片段被分配到同一桶中，进而提高了后续桶内测序短片段的压缩效率，通过记录纠正测序短片段中的桶索引序列，实现对基因组测序数据的无损压缩
一种基于纠错基因组序数无损压缩方法相关设备

[发明专利]一种自淬灭荧光的引物及其设计方法及应用-CN202210452429.9有效
发明人：周玲玲;麻昕雨;温清娜 -专利权人：广州博懿瑞生物科技有限公司
申请日： 2022-04-27 - 公布日： 2023-08-29 - 主分类号： C12Q1/6806 文献下载
摘要：所述引物的序列含有“TG”碱基、“GT”碱基、“CG”碱基或“GC”碱基，“TG”碱基、“GT”碱基、“CG”碱基或“GC”碱基的T碱基或C碱基标记有荧光染料；所述引物的序列不含有“TG”碱基、“GT”碱基、“CG”碱基或“GC”碱基的引物序列，引物的5’端额外设置有含“TG”碱基或“GT”碱基的接头序列，所述接头序列中“TG”碱基或“GT”碱基的T碱基标记有荧光染料，或者引物的5’端额外设置有含“CG”碱基或“GC”碱基的接头序列，所述接头序列中“CG”碱基或“GC”碱基的C碱基标记有荧光染料；所述引物可自淬灭；可满足多重检测的需求。
一种荧光引物及其设计方法应用

[发明专利]核酸分析装置、核酸分析方法以及机器学习方法-CN202080100282.6在审
发明人：横山彻 -专利权人：株式会社日立高新技术
申请日： 2020-05-12 - 公布日： 2022-12-23 - 主分类号： C12M1/00 文献下载
摘要：本发明的优选的一个方面提供一种核酸分析装置，其特征在于，具备：碱基预测部，用于将检测来自配置于基板的生物体关联物质的发光而得到的多个图像作为输入进行碱基预测；对位部，进行多个图像的向基准图像的对位；以及抽出部，从多个图像抽出亮点，碱基预测部将多个图像内的包括抽出的所述亮点的位置的周边像素的图像作为输入，抽出该图像的特征量，根据该特征量来预测碱基。
核酸分析装置方法以及机器学习方法