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[发明专利]基于残差注意力的多通路的蛋白质与蛋白质作用位点预测方法、设备和介质-CN202310097311.3在审
发明人：李敏;张富豪 -专利权人：中南大学
申请日： 2023-02-10 - 公布日： 2023-06-02 - 主分类号： G16B20/30 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于残差注意力的多通路的蛋白质与蛋白质作用位点预测方法、设备和介质，方法包括：基于蛋白质序列提取蛋白质的生物理化特性；使用两个不同的通路模块，分别根据生物理化特性预测蛋白质的相互作用位点；其中，两个通路模块均基于残差注意力从特征理化特性中提取隐特征向量，以及采用多层感知机根据隐特征向量预测相互作用位点，且第一通路模块使用稳定结构蛋白质样本训练得到，第二通路模块使用无序蛋白质样本训练得到；根据两个通路模块得到的相互作用位点预测结果，以及蛋白质无序倾向性，最终确定蛋白质的相互作用位点。本方法预测效果好、适用性强，且具有较强泛化能力。
基于注意力通路蛋白质作用预测方法设备介质

[发明专利]检测肝癌血清特征蛋白的质谱模型及其制备方法-CN200410103567.8无效
发明人：张建中;郑燕华;冯凯;邹德威 -专利权人：中国人民解放军第306医院
申请日： 2004-12-31 - 公布日： 2005-06-01 - 主分类号： G01N30/00 文献下载
摘要：本发明涉及检测肝癌血清特征蛋白的质谱模型及其制备方法，属于蛋白质指纹图谱检测技术领域。本发明从血清中筛选出6个上调蛋白和11个下调蛋白17个作为特征蛋白，选取所述17个蛋白中任意两个或两个以上的蛋白，以该蛋白的临界峰值建立两级或两级以上的分类树构成用于检测肝癌血清特征蛋白检测模型；本发明为进一步发现新的肝癌生物标记物提供了基础本发明对于肝癌的诊断优于目前所采用的任何单一诊断方法，为肝癌的早期发现、早期治疗提供有一种非侵入性技术，从而为降低肝癌的病死率、提高肝癌的治愈率，并进一步为高危人群筛查肝癌提供一种新方法。
检测肝癌血清特征蛋白模型及其制备方法

[发明专利]一种根据抗体物种分类预测蛋白质抗原空间表位的方法-CN201110412679.1有效
发明人：曹志伟;孙静 -专利权人：同济大学
申请日： 2011-12-12 - 公布日： 2012-06-27 - 主分类号： G06F19/18 文献下载
摘要：本发明涉及一种根据抗体物种分类预测蛋白质抗原空间表位的方法，包括：(1)数据收集：按照抗体物种来源信息(如，鼠源，人源等)分类收集抗原-抗体结构数据，得到分类数据集；收集蛋白相互作用结合位点的描述性特征；(2)模型建立：对于收集到的分类数据集，计算上述描述性特征，根据类间差异建立针对结合不同物种来源抗体的抗原空间表位预测模型；(3)表位预测：根据需结合的抗体物种来源选择抗原空间表位预测模型，对未知表位的抗原进行潜在空间表位预测本发明根据抗体物种分类预测蛋白质抗原空间表位，综合运用蛋白质中氨基酸理化性质和三维空间局部结构特征，设计巧妙，显著提高预测准确性，适于大规模推广应用。
一种根据抗体物种分类预测蛋白质抗原空间方法

[发明专利]一种含有羊奶蛋白和大豆蛋白的蛋白奶昔及其制备方法-CN202310867135.7在审
发明人：炼诒然;胡家齐;李佳楠;赵旭明 -专利权人：东北农业大学
申请日： 2023-07-14 - 公布日： 2023-10-17 - 主分类号： A23C9/152 文献下载
摘要：发明名称一种含羊奶蛋白和大豆蛋白的蛋白奶昔及其制备方法摘要本发明公开了一种含羊奶蛋白和大豆蛋白的蛋白奶昔，其特征在于：包括以下重量百分比原料：大豆蛋白粉30‑40％、羊奶粉15‑25％、藜麦5‑15％、从营养和组方角度考虑，把羊奶蛋白和大豆蛋白合理搭配，既能够有效提高蛋白质营养价值，又能够提高工艺的便利性和可行性，产品稳定性好，品质高，生产成本较低。
一种含有羊奶蛋白大豆蛋白奶昔及其制备方法

[发明专利]重组中温活性热稳定蛋白及其设计和生物合成方法-CN200780048162.0有效
发明人：迪维亚·卡普尔;桑吉夫·库马·钱德拉扬;舒伯尔·阿赫迈德;斯瓦蒂·夏尔马;马尼施·达塔;巴尔温德尔·辛格;卡蒂肯扬·苏布拉马尼亚恩;普马南达·古普塔萨玛 -专利权人：科学与工业研究委员会
申请日： 2007-11-06 - 公布日： 2009-10-28 - 主分类号： C07K14/435 文献下载
摘要：本发明涉及检验基于β折叠的蛋白结构的一部分或完整表面的可变性，特别集中于酶。所述改变是通过将一种蛋白的一部分或完整表面取代/移植到可叠合多肽主链的同源蛋白表面上，通过使用β折叠的结构特征仅改变参与底物/配体结合和催化作用的表面区域进行的。所述移植涉及将选择的构成一种酶/蛋白中待改变的表面区域的不连续残基组替换为位于另一种酶/蛋白中类似位置处的不连续残基组，这是以促进通过组合来自这两种酶/蛋白的残基形成的新蛋白的折叠和功能的方式进行的。本发明还涉及利用该表面改造方法来选择性组合来自不同生命领域的酶/蛋白特征，所述特征一般不通过天然进化组合，诸如构建这样的新蛋白，所述新蛋白保留在其上移植了嗜中温同系物的活性表面的嗜热性酶的大部分热稳定支架，以构建具有最佳功能pH和温度的中温活性功能特征的热稳定蛋白。
重组活性稳定蛋白及其设计生物合成方法

[发明专利]一种胃癌检测标记物组合及其应用-CN202111574029.7在审
发明人：余跃飞 -专利权人：海南松林生物科技有限责任公司
申请日： 2021-12-21 - 公布日： 2022-04-15 - 主分类号： C12Q1/37 文献下载
摘要：本发明对数据库中转甲状腺素蛋白、胃泌素17、胃蛋白酶原1和胃蛋白酶原II的检测样本数据进行分析，获得受试者工作特征曲线，计算所述受试者工作特征曲线下的面积，获得所述面积值，根据待检测样本对应受试者工作特征曲线下的面积值判断胃癌情况本发明结合甲状腺素蛋白、胃泌素17、胃蛋白酶原1和胃蛋白酶原II标记物对胃癌进行筛查，能更好的判断胃癌情况，显著提高胃癌筛查的准确率，具有灵敏度高准确性强的特点，其灵敏度可达80％以上，特异度高达90％
一种胃癌检测标记组合及其应用

[发明专利]特征尿蛋白对covid-19轻重级进行分型的非诊断方法及应用-CN202110441023.6有效
发明人：郭天南;丁璇;刘威;朱怡 -专利权人：西湖大学
申请日： 2021-04-23 - 公布日： 2021-12-17 - 主分类号： G01N30/88 文献下载
摘要：本发明提供一种特征尿蛋白对covid‑19轻重级进行分型的非诊断方法及应用，本申请人通过蛋白组学分析定义20种特征尿蛋白，基于获取受试者尿液中20种特征尿蛋白的相对表达量，将相对表达量输入到分型中即可获取预测值，预测值和受试者covid‑19分型结果相关联，该方案有利于临床诊治过程中进行更加针对性的治疗和用药，对于改善患者的预后具有重大意义,同时可以作为潜在的治疗靶点供后续研究。
特征蛋白 covid 19 轻重进行诊断方法应用

[发明专利]一种蛋白复合粉、代餐粉和它们的制作方法-CN201510020434.2在审
发明人：黄小林;杨贵云;王振华;胡勇;沈彬 -专利权人：湖州金诺康健康科技有限公司
申请日： 2015-01-15 - 公布日： 2016-10-05 - 主分类号： A23L1/20 文献下载
摘要：本发明公开了一种蛋白复合粉，其特征在于它由以下重量份的原料制成：速溶豆粉10‑50、大豆蛋白粉10‑50、大豆浓缩蛋白5‑20。本发明也公开了一种代餐粉，其特征在于它主要由以下重量份的原料制成：本发明所述的蛋白复合粉20‑80、膳食纤维素4‑30、粉末油脂5‑15。本发明将速溶豆粉、大豆蛋白粉、大豆浓缩蛋白按一定比例复配，在保证产品口感及高蛋白含量的基础上，降低了原料成本，适应了市场需求。本发明所制作的蛋白复合粉及代餐粉形成易分散体，保持了产品良好的分散性。
一种蛋白复合代餐粉它们制作方法

[发明专利]不使用模板从头设计蛋白质的方法-CN202111197820.0在审
发明人：刘海燕;陈泉;黄斌;许洋;胡秀红 -专利权人：中国科学技术大学
申请日： 2021-10-14 - 公布日： 2021-12-31 - 主分类号： G16B15/20 文献下载
摘要：本发明涉及一种对蛋白质的部分或全部进行从头设计的方法，所述方法包括：a.产生可设计性高的主链结构；b.氨基酸序列选择和主链修正迭代。该方法能够用预先指定的特征作为约束条件生成待设计蛋白的主链空间结构，进而确定待设计蛋白的氨基酸序列，使待设计蛋白具有预先指定的特征；该方法生成待设计蛋白主链空间结构时不需要用已知的具体蛋白质局部片段作为结构模板去拼接产生待设计蛋白结构，而是用计算机优化从大量天然蛋白结构学习得到的数学模型(统计能量函数模型)。
使用模板从头设计蛋白质方法

[发明专利]白细胞介素2的融合蛋白及其在IBD中的应用-CN202280003245.2在审
发明人：张小锐;张筠;赵婷婷;成健伟;马荣;孙艺萍;田新生;李自强 -专利权人：北京伟德杰生物科技有限公司
申请日： 2022-07-15 - 公布日： 2023-05-05 - 主分类号： C07K19/00 文献下载
摘要：公开了一种白细胞介素2的融合蛋白及其在治疗或预防炎症性肠病中的应用，其特征在于，所述融合蛋白包括：人白细胞介素2或其变体，以及人血清白蛋白或其变体。
白细胞融合蛋白及其 ibd 中的应用

[发明专利]一种基于集成学习的低密度脂蛋白的数据处理方法-CN202110256374.X在审
发明人：许川佩;穴皓月;唐鹏;张弦;陈涛;李翔;王月娥 -专利权人：桂林电子科技大学
申请日： 2021-03-09 - 公布日： 2021-06-22 - 主分类号： G16B15/20 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于集成学习的低密度脂蛋白的数据处理方法，通过对特定频率范围内的阻抗谱数据进行数据预处理得到含有多个特征变量的特征矩阵，采用集成学习中的随机森林算法融合CART回归树算法建立低密度脂蛋白预测模型，结合以胆固醇浓度为核心的生物电阻抗谱参数相关性较高的特征变量来进一步优化低密度脂蛋白预测模型，最终得到低密度脂蛋白的预测值，再通过方差、偏差以及模型的可解释度等回归模型的指标评价，解决了现有技术中的机器识别高血脂症预测模型精确度、泛化能力以及鲁棒性不高的技术问题。
一种基于集成学习密度脂蛋白数据处理方法

[发明专利]一种DNA结合蛋白接口几何结构特征的分析方法-CN201710471068.1在审
发明人：王伟;李克亮 -专利权人：河南师范大学
申请日： 2017-06-20 - 公布日： 2018-12-28 - 主分类号： G06F19/16 文献下载
摘要：本发明涉及一种DNA结合蛋白接口几何结构特征的分析方法，属于生物计算技术领域。本发明首先从蛋白‑DNA复合数据集中提取蛋白‑DNA结合位点信息；然后根据蛋白‑DNA结合位点信息确定蛋白‑DNA结合位点的残基形态指数特征和空间环境特征；最后将所确定的蛋白‑DNA结合位点的残基形态指数特征和空间环境特征作为特征向量，利用分类模型对获取的特征向量进行分类。本发明通过从残基形态结构和空间环境特征角度分析了双链DNA结合蛋白(简称：DSBs)和单链DNA结合蛋白(简称：SSBs)的结合特异性，有助于深入理解蛋白‑DNA的结合机制，而且本发明也能够应用于蛋白‑RNA、蛋白‑蛋白等领域研究。
蛋白空间环境特征残基几何结构特征特征向量位点信息形态指数位点单链DNA结合蛋白结合特异性分类模型复合数据角度分析结合蛋白领域研究生物计算形态结构双链DNA 分析分类应用

[发明专利]一种利用鸡卵清蛋白基因进行外源蛋白大量生产的方法-CN202210640037.5在审
发明人：陆阳清;谢龙;黄振文;兰美玉 -专利权人：广西大学
申请日： 2022-06-08 - 公布日： 2022-11-01 - 主分类号： C12N15/85 文献下载
摘要：本发明涉及基因工程技术领域，公开了一种利用鸡卵清蛋白基因进行外源蛋白大量生产的方法，通过对鸡内源性的卵清蛋白基因进行基因编辑，将外源基因通过任何具有链接效应的氨基酸片段的方式连接起来，使外源蛋白在鸡输卵管中与卵清蛋白一起表达与分泌，并整合到鸡蛋中，实现外源蛋白的大量生产；本发明具有生产量大、稳定高效的特征，并对非分泌性的外源蛋白也具有良好的适用性，为利用家禽批量生产外源重组蛋白提供了一个切实可行的方案。
一种利用鸡卵清蛋白基因进行大量生产方法

[发明专利]一种基于深度学习的蛋白质残基接触预测方法-CN202010709538.5在审
发明人：张贵军;熊章宗;卢升荣;陈芳;李亭 -专利权人：浙江工业大学
申请日： 2020-07-22 - 公布日： 2020-12-15 - 主分类号： G06Q10/04 文献下载
摘要：一种基于深度学习的蛋白质残基接触预测方法，包括以下步骤：首先从PDB库中下载蛋白质氨基酸的序列和结构信息，构建残基对接触矩阵；使用HHblits对UniClust30数据库进行搜索，生成多序列比对文件；其次，对每个蛋白质序列通过多序列比对提取序列特征；再次，将序列特征互信息与协方差合并为一个442维L*L大小的输入特征，构建全卷积残差网络，并在所述输入特征和标签接触矩阵上进行训练。本发明提供了一种预测效率与准确性较高的基于深度学习的蛋白质残基接触预测方法。
一种基于深度学习蛋白质残基接触预测方法

[发明专利]在转基因苜蓿植株中的蛋白生产-CN98812925.6无效
发明人： L·P·维兹纳;S·拉伯格;R·巴津;H·克豪迪;R·莱米乌克斯;G·阿拉德 -专利权人：加拿大农业及农业食品部;赫马-魁北克公司;加拿大血液服务公司;拉瓦尔大学
申请日： 1998-11-10 - 公布日： 2001-04-04 - 主分类号： C12N15/82 文献下载
摘要：本发明涉及特征鉴定适用于生产功能性转基因蛋白的宿主系统;所述功能性转基因蛋白用于需要政府管理批准的应用,诸如抗人IgG。众所周知;管理机构要求用于生产转基因蛋白的主细胞库和主细胞系是稳定和持久的,以确保足够的材料用于合适的特征鉴定、临床试验和潜在的销售。目前的植物生产系统需要建立用于此目的的种子库。然而;有许多缺点与用于生产持续可靠的转基因蛋白源的这种系统相关。本发明的一方面涉及特征鉴定适用于符合严格管理要求的转基因蛋白的植物生产系统。此外,所述转基因蛋白在体内以及在提取和纯化步骤期间是稳定的。纯化产生独特的H2L2形式,在标准化血清学试验中其反应性不可与杂交瘤衍生C5—1的反应性区分。结果表明,植物衍生的转基因蛋白诸如mAb可以与杂交瘤衍生的mAb一样有效地用作诊断试剂,并且证明转化的苜蓿系统生产大量蛋白(包括诸如mAb的多体蛋白)的有用性。
转基因苜蓿植株中的蛋白生产