[发明专利]一种循环迭代优化生成序列突变适应度的方法及相关装置在审
申请号: | 202211228697.9 | 申请日: | 2022-10-09 |
公开(公告)号: | CN115620831A | 公开(公告)日: | 2023-01-17 |
发明(设计)人: | 刘时秀;张慧锋;罗贤涛;潘俊锋;刘建 | 申请(专利权)人: | 深圳瑞德林生物技术有限公司 |
主分类号: | G16C20/50 | 分类号: | G16C20/50;G16C20/30;G16B40/30;G06N3/04;G06N3/08 |
代理公司: | 深圳市深佳知识产权代理事务所(普通合伙) 44285 | 代理人: | 石翰林 |
地址: | 518000 广东省深圳市南山区粤海街*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 本申请涉及蛋白质工程领域,公开了一种循环迭代优化生成序列突变适应度的方法及相关装置,包括:获取目标蛋白质序列的同源家族序列数据,对该数据进行预处理,产生第一训练集;构建生成对抗网络模型,利用第一训练集对该模型进行预训练;获取蛋白质突变数据集,采用不同的编码方式对该数据集中氨基酸序列进行编码,得到第二训练集和测试集;利用第二训练集和测试集对多个回归模型分别进行训练和测试,并计算每种编码方式对应的回归模型的测试集相关度并排序,根据排序结果确定用于优化蛋白质序列突变适应度的预测器;将预测器引入生成对抗网络模型中,循环迭代更新模型参数,以最大化生成序列的突变适应度。这样可以直接产生突变适应度高的序列。 | ||
搜索关键词: | 一种 循环 优化 生成 序列 突变 适应 方法 相关 装置 | ||
【主权项】:
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