[发明专利]联合检测SNV、CNV和FUSION变异的方法和装置有效
申请号: | 202110508556.1 | 申请日: | 2021-05-11 |
公开(公告)号: | CN112980961B | 公开(公告)日: | 2021-08-27 |
发明(设计)人: | 韩志军;王磊;王杰;王雨倩;庞莹;杨继伟;王修涵;谢正华 | 申请(专利权)人: | 上海思路迪医学检验所有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;G16B20/20 |
代理公司: | 中国专利代理(香港)有限公司 72001 | 代理人: | 黄登高;初明明 |
地址: | 200120 上海市浦*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | 本公开内容涉及联合检测SNV、CNV和FUSION变异的方法和装置。更具体而言,所述装置包括:测序数据读入模块;SNV检测模块;CNV检测模块;FUSION变异检测模块;和结果输出模块,其中CNV检测模块包括以下模块:BAF计算模块;BAF矫正模块;BAF分离鉴定模块;测序深度计算模块;logR矫正模块;logR背景噪音计算模块;和CNV判定模块。所述方法和装置基于BAF+logR信息,高灵敏度高特异性检测ctDNA占比极低的样本中的SNV、CNV及FUSION变异,尤其是低拷贝数扩增的CNV变异。 | ||
搜索关键词: | 联合 检测 snv cnv fusion 变异 方法 装置 | ||
【主权项】:
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