[发明专利]一种序列比对的方法、系统、设备及可读存储介质在审
申请号: | 202010176199.9 | 申请日: | 2020-03-13 |
公开(公告)号: | CN111402959A | 公开(公告)日: | 2020-07-10 |
发明(设计)人: | 赵健;史宏志;崔星辰 | 申请(专利权)人: | 苏州浪潮智能科技有限公司 |
主分类号: | G16B30/10 | 分类号: | G16B30/10 |
代理公司: | 北京集佳知识产权代理有限公司 11227 | 代理人: | 王晓坤 |
地址: | 215100 江苏省苏州市吴*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | 本申请公开了一种序列比对的方法,包括:获取索引表及初始种子;根据索引表确定初始种子在参考序列上的出现次数,并判断出现次数是否超过设定阈值;若是,则根据初始种子生成新种子;若否,则将初始种子作为待比对种子,并利用待比对种子进行序列比对。本申请通过索引表确定初始种子在参考序列上的出现次数来选定待比对种子,将出现次数超过阈值的初始种子排除,直到初始种子的出现次数小于或等于阈值位置,使得在参考序列上进行局部比对时尽可能减少了参考序列上需要比对的位置,实现了对冗余数据项的过滤,进而提高了序列比对的处理效率和比对精度。本申请同时还提供了一种序列比对的系统、设备及可读存储介质,具有上述有益效果。 | ||
搜索关键词: | 一种 序列 方法 系统 设备 可读 存储 介质 | ||
【主权项】:
暂无信息
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