[发明专利]基于叶绿体基因组序列开发的苦蘵cpSSR标记引物及其应用

摘要

本发明公开了基于叶绿体基因组序列开发的苦蘵cpSSR标记引物及其应用。该引物对SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.60是基于苦蘵叶绿体基因组序列开发获得的，在叶绿体基因组测序的基础上，对大量序列信息进行分析，进而开展cpSSR位点筛选和cpSSR标记引物设计。本专利克服了传统SSR标记开发效率低、周期长、费用高的问题，同时填补了苦蘵目前cpSSR标记信息的空白。通过cpSSR引物的筛选与遗传多样性分析，评价了cpSSR标记引物的多态性和适用性。本专利提供的cpSSR多态性标记引物为苦蘵的遗传多样性评价、种质鉴定、重要性状基因定位及分子标记辅助育种等研究奠定了基础。

主权项

1.基于叶绿体基因组序列开发的苦蘵cpSSR标记引物，其特征在于由30对多态性引物构成，其引物核苷酸序列信息如下：cpSSR2正向引物如SEQ ID NO.1所示；cpSSR2反向引物如SEQ ID NO.2所示；cpSSR4正向引物如SEQ ID NO.3所示；cpSSR4反向引物如SEQ ID NO.4所示；cpSSR17正向引物如SEQ ID NO.5所示；cpSSR17反向引物如SEQ ID NO.6所示；cpSSR18正向引物如SEQ ID NO.7所示；cpSSR18反向引物如SEQ ID NO.8所示；cpSSR19正向引物如SEQ ID NO.9所示；cpSSR19反向引物如SEQ ID NO.10所示；cpSSR21正向引物如SEQ ID NO.11所示；cpSSR21反向引物如SEQ ID NO.12所示；cpSSR23正向引物如SEQ ID NO.13所示；cpSSR23反向引物如SEQ ID NO.14所示；cpSSR24正向引物如SEQ ID NO.15所示；cpSSR24反向引物如SEQ ID NO.16所示；cpSSR25正向引物如SEQ ID NO.17所示；cpSSR25反向引物如SEQ ID NO.18所示；cpSSR26正向引物如SEQ ID NO.19所示；cpSSR26反向引物如SEQ ID NO.20所示；cpSSR29正向引物如SEQ ID NO.21所示；cpSSR29反向引物如SEQ ID NO.22所示；cpSSR30正向引物如SEQ ID NO.23所示；cpSSR30反向引物如SEQ ID NO.24所示；cpSSR31正向引物如SEQ ID NO.25所示；cpSSR31反向引物如SEQ ID NO.26所示；cpSSR34正向引物如SEQ ID NO.27所示；cpSSR34反向引物如SEQ ID NO.28所示；cpSSR35正向引物如SEQ ID NO.29所示；cpSSR35反向引物如SEQ ID NO.30所示；cpSSR36正向引物如SEQ ID NO.31所示；cpSSR36反向引物如SEQ ID NO.32所示；cpSSR37正向引物如SEQ ID NO.33所示；cpSSR37反向引物如SEQ ID NO.34所示；cpSSR38正向引物如SEQ ID NO.35所示；cpSSR38反向引物如SEQ ID NO.36所示；cpSSR39正向引物如SEQ ID NO.37所示；cpSSR39反向引物如SEQ ID NO.38所示；cpSSR41正向引物如SEQ ID NO.39所示；cpSSR41反向引物如SEQ ID NO.40所示；cpSSR42正向引物如SEQ ID NO.41所示；cpSSR42反向引物如SEQ ID NO.42所示；cpSSR44正向引物如SEQ ID NO.43所示；cpSSR44反向引物如SEQ ID NO.44所示；cpSSR45正向引物如SEQ ID NO.45所示；cpSSR45反向引物如SEQ ID NO.46所示；cpSSR46正向引物如SEQ ID NO.47所示；cpSSR46反向引物如SEQ ID NO.48所示；cpSSR47正向引物如SEQ ID NO.49所示；cpSSR47反向引物如SEQ ID NO.50所示；cpSSR48正向引物如SEQ ID NO.51所示；cpSSR48反向引物如SEQ ID NO.52所示；cpSSR49正向引物如SEQ ID NO.53所示；cpSSR49反向引物如SEQ ID NO.54所示；cpSSR50正向引物如SEQ ID NO.55所示；cpSSR50反向引物如SEQ ID NO.56所示；cpSSR51正向引物如SEQ ID NO.57所示；cpSSR51反向引物如SEQ ID NO.58所示；cpSSR53正向引物如SEQ ID NO.59所示；cpSSR53反向引物如SEQ ID NO.60所示。