[发明专利]测序数据处理系统和SMN基因检测系统有效
申请号: | 201710505715.6 | 申请日: | 2017-06-28 |
公开(公告)号: | CN107267613B | 公开(公告)日: | 2020-10-27 |
发明(设计)人: | 李阳;刘阳;张洋;顾卓雅;吕佩涛 | 申请(专利权)人: | 安吉康尔(深圳)科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12Q1/6869;G16B20/30;G16B20/50;G16B20/20 |
代理公司: | 深圳中一联合知识产权代理有限公司 44414 | 代理人: | 张全文 |
地址: | 518000 广东省深圳市南山区粤海街道*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 本发明属于基因测序技术领域,具体涉及一种测序数据处理系统和SMN基因检测系统。该系统包括:数据获取单元:用于获得高通量测序的含有SMN基因的测序数据;序列比对单元:用于对参考基因组中SMN2基因的所有外显子注释,并将所述测序数据与注释后的所述参考基因组进行序列比对,获得所述测序数据中的匹配序列;信息确定单元:用于根据所述匹配序列和SMN基因中7号外显子的差异碱基位点,确定所述测序数据中SMN基因的变异信息。本发明不但能全面和精确检测到SMN1和SMN2序列,获得其它突变位点和拷贝数信息,提供更多的致病基因信息,还能与目前常用的检测流程直接整合,有效提高检测的易用性,降低检测的成本。 | ||
搜索关键词: | 序数 处理 系统 smn 基因 检测 | ||
【主权项】:
一种测序数据处理系统,其特征在于,包括:数据获取单元:用于获得高通量测序的含有SMN基因的测序数据;序列比对单元:用于对参考基因组中SMN2基因的所有外显子注释,并将所述测序数据与注释后的所述参考基因组进行序列比对,获得所述测序数据中的匹配序列;信息确定单元:用于根据所述匹配序列和SMN基因中7号外显子的差异碱基位点,确定所述测序数据中SMN基因的变异信息。
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