[发明专利]位置相关变体识别计算流水线

摘要

本公开提供了一种利用计算机辅助实现的分析多个核酸序列片段中变体的方法。该方法使用的计算流水线包括使用位置相关参数的模块。该方法包括在处理器上执行下列步骤：接收多个核酸序列片段，这些核酸序列片段至少包括一个第一核酸序列片段和一个第二核酸序列片段；分别将第一核酸序列片段和第二核酸序列片段比对到基因组中的第一位置和第二位置；基于第一位置和第二位置，分别向该位置相关参数赋予第一数值和第二数值；将第一核酸序列片段和第二核酸序列片段输送通过使用位置相关参数的模块，分别使用第一数值和使用第二数值；并且产生变体识别。

主权项

一种使用计算流水线分析多个核酸序列片段中的变体的计算机辅助实现方法，其中所述计算流水线包括取决于位置相关参数的模块，其特征在于，所述方法包括在处理器上执行如下步骤：接收多个核酸序列片段，其至少包含第一核酸序列片段和第二核酸序列片段；将所述第一核酸序列片段和所述第二核酸序列片段分别比对到基因组中的第一位置与第二位置，其中所述第一位置不同于所述第二位置；基于基因组中的所述第一位置和所述第二位置，分别给所述位置相关参数赋予第一数值和第二数值；将所述第一核酸序列片段和所述第二核酸序列片段通过所述模块，分别使用所述第一数值和所述第二数值的；生成变体识别。