[发明专利]一种高通量提取园艺植物叶片基因组DNA的方法有效

专利信息
申请号: 201610116145.7 申请日: 2016-03-02
公开(公告)号: CN105524918B 公开(公告)日: 2018-06-15
发明(设计)人: 汤浩茹;江雷雨;陈清;王小蓉;陈品文;罗娅;张勇;孙勃;刘泽静;王玲;张云婷;冯琛 申请(专利权)人: 四川农业大学
主分类号: C12N15/10 分类号: C12N15/10
代理公司: 成都正华专利代理事务所(普通合伙) 51229 代理人: 李蕊
地址: 611130 四*** 国省代码: 四川;51
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摘要: 发明涉及植物分子生物学领域,具体提供一种高通量提取园艺植物叶片基因组DNA的方法。该方法简单快捷,无需液氮研磨,制备通量高,耗费时间短,DNA得率和纯度比较高;并且,本发明在裂解液中用高浓度的氯化锂替代了氯化钠,使得到的DNA基本不含RNA污染。本发明得到的DNA可用于园艺植物群体遗传学、系统进化、分子标记、和常规PCR等实验,适用于普通生物实验室研究,具有巨大的应用前景。 1
搜索关键词: 园艺植物 叶片基因组 高通量 氯化钠 植物分子生物学 群体遗传学 分子标记 液氮研磨 常规PCR 裂解液 氯化锂 得率 可用 通量 制备 进化 替代 污染 应用 研究
【主权项】:
1.一种高通量提取园艺植物叶片基因组DNA的方法,其特征是,包括以下步骤:

(1)取10‑30mg植物叶片置于1.5ml离心管中,再加入200‑300ul研磨液,10‑15mg石英砂和维生素C的混合物,用电动研磨仪研磨至匀浆状,补加1ml所述研磨液,涡旋混匀;

(2)在8000rpm,室温离心1分钟,去除离心所得上清液,向沉淀中加入500‑700ul 65℃预热的裂解液和10ul 2‑巯基乙醇,涡旋混匀,60‑65℃保温10‑15分钟;

(3)待步骤(2)中的混合液冷却至室温后,加入与步骤(2)中的裂解液等体积的氯仿,剧烈震荡30s,室温下,放置2分钟;再于13000rpm,室温下,离心5‑10分钟;

(4)取300‑400ul上清,转入另一离心管中,加入1/4所述上清体积的5M氯化钠,颠倒混匀,再加入2倍混合液体积的无水乙醇,颠倒混匀,室温放置10‑15分钟;再于13000rpm,室温下,离心5‑10分钟,弃上清,得沉淀;

(5)向步骤(4)中得到的沉淀加入400ulTE,用移液器吹打,溶解,再加入1/10所述TE体积的3M醋酸钠,pH5.2,颠倒混匀,再加入2倍混合液体积的无水乙醇,颠倒混匀,室温放置10‑15分钟;再于13000rpm,室温下,离心5‑10分钟,弃上清,得沉淀。

(6)将步骤(5)所得沉淀用70‑75%乙醇洗涤后,室温下风干6‑10分钟,加入50ul TE溶液,得到基因组DNA;

所述研磨液的配方组成为:

200mM三羟甲基氨基甲烷·盐酸、50mM乙二胺四乙酸二钠、0.2M的氯化钠和0.2g/L交联聚乙烯吡咯烷酮,pH8.0;

所述裂解液的配方组成为:体积比为1:1的A液和B液;

所述A液的配方为:0.4g/L的十六烷基三甲基溴化铵、200mM的三羟甲基氨基甲烷·盐酸、50mM的乙二胺四乙酸二钠和0.4g/L的聚乙烯吡咯烷酮,平均分子量10000,pH8.0;

所述B液的配方为:8M氯化锂;

所述TE配方为:

10mM三羟甲基氨基甲烷·盐酸和1mM乙二胺四乙酸二钠。

2.根据权利要求1所述的高通量提取园艺植物叶片基因组DNA的方法,所述步骤(1)、(2)和(3)替代为:

(1)取10‑30mg植物叶片置于1.5ml离心管中,再加入200‑300ul裂解液,10‑15mg石英砂和维生素C的混合物,用电动研磨仪研磨至匀浆状,补加300‑400ul裂解液和10ul 2‑巯基乙醇,涡旋混匀,60‑65℃保温10‑15分钟;

(2)待步骤(1)中的混合液冷却至室温后,加入与步骤(2)中的第一次和第二次加入的裂解液体积之和等体积的氯仿,剧烈震荡30s,室温下,放置2分钟;再于13000rpm,室温下,离心5‑10分钟。

3.根据权利要求1所述的高通量提取园艺植物叶片基因组DNA的方法,所述步骤(5)、(6)替代为:

(5)将步骤(4)所得沉淀用70‑75%乙醇洗涤后,室温下风干6‑10分钟,加入50ul TE溶液,得到基因组DNA。

4.根据权利要求1所述的高通量提取园艺植物叶片基因组DNA的方法,其特征是,步骤(1)中,所述石英砂和维生素C的质量比为1:1.

5.根据权利要求1所述的高通量提取园艺植物叶片基因组DNA的方法,其特征是,所述电动研磨仪由小型电钻和设置于所述电钻上的金属研磨棒组成。

6.根据权利要求1所述的高通量提取园艺植物叶片基因组DNA的方法,其特征是,所述植物叶片为植物新鲜叶片或室温干燥保存的叶片;所述植物为草莓、桃、梨、柑橘、李子、甘蓝或南瓜。

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