[发明专利]碱基序列重组系统及方法在审

专利信息
申请号: 201310369701.8 申请日: 2013-08-22
公开(公告)号: CN103793623A 公开(公告)日: 2014-05-14
发明(设计)人: 朴旻 申请(专利权)人: 三星SDS株式会社
主分类号: G06F19/18 分类号: G06F19/18
代理公司: 北京铭硕知识产权代理有限公司 11286 代理人: 金光军;郭鸿禧
地址: 韩国*** 国省代码: 韩国;KR
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摘要: 发明公开一种碱基序列重组系统及方法。根据本发明的一个实施例的碱基序列重组系统包括:映射位置计算单元,从由短片段生成的多个种子序列中选择一个种子序列,并计算选择的种子序列在对象碱基序列中的映射位置;全局比对单元,从计算出的所述映射位置计算针对所述选择的种子序列的重复判断区域,并判断在计算出的所述重复判断区域中是否已执行全局比对,判断结果如果没有执行,则在计算出的所述映射位置上执行针对所述短片段的全局比对(Global Alignment)。
搜索关键词: 碱基 序列 重组 系统 方法
【主权项】:
一种碱基序列重组系统,包括:映射位置计算单元,从由短片段生成的多个种子序列中选择一个种子序列,并计算选择的种子序列在对象碱基序列中的映射位置;全局比对单元,从计算出的所述映射位置计算对应于所述选择的种子序列的重复判断区域,并判断在计算出的所述重复判断区域中是否已执行全局比对,判断结果如果没有执行所述全局比对,则在计算出的所述映射位置上执行针对所述短片段的全局比对。
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