[发明专利]用于叶籽银杏MSAP分析的DNA提取方法无效
申请号: | 201310334067.4 | 申请日: | 2013-08-02 |
公开(公告)号: | CN103421765A | 公开(公告)日: | 2013-12-04 |
发明(设计)人: | 邢世岩;王聪聪;付兆军 | 申请(专利权)人: | 山东农业大学 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10;C12Q1/68 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 271018 *** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | 本发明公开了一种用于叶籽银杏MSAP分析的DNA提取的方法。本发明通过嫁接复壮的叶籽银杏嫩叶为材料,采用改良CTAB法进行全基因组DNA的提取,通过提高β-巯基乙醇和PVP的浓度,去除杂质并防止褐化,加入氯仿异戊醇,二次抽提,有效去除蛋白质的含量。获得了高质量和高浓度的叶籽银杏基因组DNA,用MSAP技术进行分析,显示出了DNA甲基化的多态性。此方法不仅成本低,而且可以获得高浓度的基因组DNA,为叶籽银杏表观遗传学研究奠定了基础。 | ||
搜索关键词: | 用于 银杏 msap 分析 dna 提取 方法 | ||
【主权项】:
一种用于叶籽银杏MSAP分析的DNA提取方法,其特征在于该方法包括下述步骤:(1)研钵、研锤、药匙、2ml及1.5ml离心管等高压灭菌,液氮准备,2%CTAB、TE等试剂的配制,CTAB在65℃水浴锅中预热10min以上;(2)称新鲜嫩叶.015g‑0.20g,迅速倒入预冷的研钵中,倒入液氮迅速研磨,多次研磨至粉末状,立即转入装有700μL预热CTAB的2mL离心管中,加入35μLβ‑巯基乙醇和20%PVP140μL,充分混匀;(3)65℃温浴30min以上,中间颠倒离心管摇动3‑5次,取出后冷却至室温;(4)加入等体积的氯仿异戊醇24:1V/V,轻轻颠倒混匀,室温12000rpm离心10min;(5)吸取上清转入2mL的离心管中,加入2倍体积的无水乙醇,然后加入20μL3mol.L‑1NaAc,一般离心管内会有棉团状DNA出现,‑20℃冰箱中放置30min以上;(6)3000rpm离心6min,弃上清,用70%乙醇洗涤2次,放置30min左右自然风干;(7)加600μL TE充分溶解DNA;(8)加入等体积的酚:氯仿:异戊醇25:24:1V/V,颠倒混匀,12000rpm离心10min;(9)吸取上清,加入等体积的氯仿:异戊醇,轻轻颠倒混匀,12000rpm离心10min;(10)吸取上清转入2mL的离心管中,然后加入30μL3mol/L NaAc,一般离心管内会有棉团状DNA出现,‑20℃冰箱中放置30min以上;(11)3000rpm离心6min,弃上清,用70%乙醇洗涤2次,再用无水乙醇洗涤1次,自然风干;(12)加60μL TE充分溶解DNA;(13)待溶解后,加入4μL5mg/mL RNA酶,37℃水浴30min,冷却至室温,分装后4℃保存备用,‑20℃长期保存。
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