[发明专利]一种用于肛肠疾病患病风险评估基因芯片、制备方法及其试剂盒

摘要

本发明涉及一种用于肛肠疾病患病风险评估基因芯片、制备方法及其试剂盒。他包括固相载体、固定在固相载体上的用于检测肛肠疾病易感基因多态性位点的特异性寡核苷酸探针，所述寡核苷酸探针的核苷酸序列如SEQIDNo.1-78所示。本发明还公开了该基因芯片的制作方法，以及包括该基因方法的试剂盒。其灵敏度高，特异性和可靠性高，可科学预测九种肛肠系统疾病的患病风险，为肛肠疾病的诊断治疗提供分析信息。根据检测分析得到的各肛肠系统疾病的患病风险可有针对性的调整生活饮食习惯，采取相应的其他措施从而预防疾病的发生，或者做到疾病早发现早治疗，提高国民素质，有效预防肛肠疾病的发生。

主权项

一种用于肛肠疾病患病风险评估基因芯片，其特征在于：包括固相载体、固定在固相载体上的用于检测肛肠疾病易感基因多态性位点的特异性寡核苷酸探针，所述检测肛肠疾病易感基因多态性位点如下：结直肠癌基因多态性位点(SNP)4个：rs4939827、rs6983267、rs3802842、rs961253先天性巨结肠症基因多态性位点(SNP)5个：rs137852525、rs104894388、rs1801710、rs193196427、rs193123285克罗恩氏病基因多态性位点(SNP)11个：rs2066844、rs10761659、rs2066845、rs2066847、rs11209026、rs2241880、rs7714584、rs3197999、rs11190140、rs17234657、rs1893217乳糖不耐受症基因多态性位点(SNP)3个：rs193268403、rs193267205、rs193116455溃疡性结肠炎基因多态性位点(SNP)4个：rs2395185、rs9858542、rs10883365、rs11209026、酒精脸红反应基因多态性位点(SNP)3个：rs193229433、rs193200096、rs193056481家族性结肠腺瘤性息肉病基因多态性位点(SNP)2个：rs121912665、rs113993961乳糜腹泻基因多态性位点(SNP)3个：rs2187668、rs6822844、rs6441961囊性纤维化基因多态性位点(SNP)4个：rs193230349、rs193273640、rs193221728、rs193219992；所述寡核苷酸探针的核苷酸序列如SEQ ID No.1‑78所示，具体列表如下：表1用于肛肠疾病患病风险评估基因芯片的寡核苷酸探针序列位点名称       探针序列(5’→3’)rs4939827      1W‑AAAAGAGGAAACAGGACCCCAGAG               1M‑CCAAAAGAGGAAATAGGACCCCAGrs6983267      2W‑AGCAGATGAAAGGCACTGAGAAAA               2M‑AGCAGATGAAAGTCACTGAGAAAArs3802842      3W‑AAAATCTATCCCAGAAATTCA               3M‑AGACCCATAGAAAATCTCTCCCArs961253       4W‑ACATCAAGTAAATTCAGA               4M‑ACATCAAGTACATTCAGArs137852525    5W‑GTTCAGTACCGCATGCAGTG               5M‑GTTCAGTACCGCGTGCAGTGrs104894388    6W‑TTCATACAGAAAGCCTCCGTG               6M‑TTCATACAGAAAGGCTCCGTGrs1801710      7W‑AGACCTTATGGCCCAAGAGTT               7M‑CCAAGGGTTCCAACGCCAG rs193196427    8W‑TTCTCATAGCCTACGGACTCGAAC               8M‑ATAGCCTATGGACTCGAACCGGrs193123285    9W‑ACCCTGTCTCGTGGACCGC               9M‑CCCTGTCTCGTGGACTGCCCGGrs2066844      10W‑CCGGAGCAGGGCCTTCTCAGAT               10M‑CCAGAGCAGGGCCTTCTCAGrs2066845      11W‑TGGTGCAACAGAGTGGGTGACGAG               11M‑TGGCGCAACAGAGTGGGTGACGAGrs10761659     12W‑AAACTATAACAGAAGGAAAACAGG               12M‑AAACTGTAACAGAAGGAAAACAGGrs2066847      13W‑CTCCTGCAGGCCCTTGAAA               13M‑CTCCTGCAGGCCCCTTGAAAGrs11209026     14W‑CAGATCATTCCAAACTGG               14M‑CAGATCATTCCGAACTGGrs2241880      15W‑ATGAGCATCCACATTGTCC               15M‑GATGAGTATCCACATTGTCCrs7714584      16W‑ACCTTTTAAATTTATTGCTCTGTC               16M‑ACCTTTTAAATTTGTTGCTCTGTCrs3197999      17W‑CGCAAGGTCCCGCTGGCCA               17M‑GAGTATGCGCAAGGTCCTGrs11190140     18W‑TTCAATAGGCGGAAAAGAAGGCT               18M‑TTCAATAGGTGGAAAAGAAGGCrs17234657     19W‑CCAGTCACGTTGTCAAATAGCTTC               19M‑TCCTCCCAGTCACGTTTTCAAATArs1893217      20W‑TCTTCTTCCTCTACCTCTGTCCCT               20M‑CTTCTTCCTCTACCTTTGTCCCTArs193268403    21W‑GAGCCACCATGCCCGGCCGG               21M‑GAGCCACCATGCCTGGCCGGrs193267205    22W‑CTTCAGTGATGGACGAGGAGGTGG               22M‑CAGTGATGGATGAGGAGGTGGACArs193116455    23W‑GTGTCTTTGCCCAAGTACTTCTG               23M‑GTGTCTTTGCCCAAGTATTTCTGrs2395185      24W‑GCCAAAAATTTGTCTTCCC               24M‑GCCAAAAATTTTTCTTCCCrs9858542      25W‑CAAACTGACAGAAGGTATGCACT                25M‑AAGCTGGCAAACTGACGGAAGGTArs10883365     26W‑CAGACGGTTTGAAGGTATTTGTGC               26M‑CAGACGGTTTGAAGGTGTTTGTGCrs11209026     27W‑AACAGATCATTCCAAACTGGGTAGG               27M‑AACAGATCATTCCGAACTGGGTAGGrs193229433    28W‑CACTCCCCATTCCTCCCACTACCA               28M‑CCCCATTCCTCCCCCTACCAGrs193200096    29W‑AGTGGCTGGCCCTGGTTCTG               29M‑AGTGGCTGGCCTTGGTTCTGrs193056481    30W‑GGTGCCAGCCTAATTTCTATTAA               30M‑GTGCCAGCCTCATTTCTATTAATTrs121912665    31W‑GGTCTGGCCCCTCCTCAGCAT               31M‑GGTCTGGTCCCTCCTCAGCATrs113993961    32W‑TGCTTTTAATACGGTAGAAATTGG               32M‑GCTTTTAATAGGGTAGAAATTGGCrs2187668      33W‑GGCAGCTGAGAGTAAATGAGGACC               33M‑GAGGCAGCTGAGAGTAAGTGAGGArs6822844      34W‑TCCATAGCAAAAAGAGAGGACT               34M‑TCTCCATAGCAAAAATAGAGGACrs6441961      35W‑GGCAGCCTTGATAACATCTCCA               35M‑GTAGCCTTGATAACATCTCCAGCArs193230349    36W‑GTAACTAACCCATTCTATTTT               36M‑GTAACTACCCCATTCTATTTTrs193273640    37W‑TAGTGTTGGTGGCAGGAAGTAGAA               37M‑TAGTGTTGGTGTCAGGAAGTAGAArs193221728    38W‑GTGTTCGACTGCATGGGGA               38M‑GTGTTCGACTGCATGGGTArs193219992    39W‑TTTGATAGAACTATACACGGAG               39M‑TTTGATAGAACTATACATGGAG。