[发明专利]一种水稻全基因组SNP芯片及其应用有效
| 申请号： | 201210055775.X | 申请日： | 2012-03-05 |
| 公开（公告）号： | CN102747138A | 公开（公告）日： | 2012-10-24 |
| 发明（设计）人： | 周发松;谢为博;喻辉辉;李菁;张启发 | 申请（专利权）人： | 中国种子集团有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/68 | 分类号： | C12Q1/68;C40B40/06 |
| 代理公司： | 武汉宇晨专利事务所 42001 | 代理人： | 王敏锋 |
| 地址： | 100045 北京市西*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种水稻全基因组SNP芯片及其应用，步骤：（1）芯片上第一类探针的获得：通过测序获得亲本的基因组序列，结合公共数据库中的其他水稻品种重测序数据，以日本晴基因组为参考序列，使用MAQ软件将所有测序数据进行匹配、分析，最后从中筛选出SNP标记；（2）芯片上第二类探针的获得：从公共数据库获得水稻功能基因，寻找反映基因功能的序列差异，据此设计出SNP/INDEL探针；(3)利用Infinium芯片制造技术制作SNP芯片。(4)测试芯片的准确性和应用效率。本芯片可应用于水稻种质资源分子标记指纹分析、种子真实性检测、杂交后代基因分型，以及其他相关研究中。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 水稻 基因组 snp 芯片 及其 应用 | ||
【主权项】：
一种水稻全基因组SNP芯片，其特征在于：所说的SNP芯片是指根据SEQ No.001~SEQ ID No.5636所示序列利用Infinium专利设计制造技术制作的芯片。
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