[发明专利]用于比对大分子中的结合位点容积的系统和方法无效
申请号: | 200810126151.6 | 申请日: | 2008-06-27 |
公开(公告)号: | CN101470776A | 公开(公告)日: | 2009-07-01 |
发明(设计)人: | 尼迪·阿洛拉;克里斯·威廉斯 | 申请(专利权)人: | 弗·哈夫曼-拉罗切有限公司;化学计算集团公司 |
主分类号: | G06F19/00 | 分类号: | G06F19/00 |
代理公司: | 北京安信方达知识产权代理有限公司 | 代理人: | 陶贻丰;郑 霞 |
地址: | 瑞士*** | 国省代码: | 瑞士;CH |
权利要求书: | 查看更多 | 说明书: | 查看更多 |
摘要: | 本发明提供了用于评价大分子的结合位点的系统、方法和设备,其中该结合位点被识别且该结合位点的结合位点容积图被构建。该结合位点容积图具有含多个区域的表面。将该表面的多个区域中的每个单独区域基于第一特征进行分类,该第一特征与该大分子的与该单独区域最接近的部分的第二特征互补,从而产生相互作用图。本发明还提供了比较大分子的方法、系统和设备,其中为每个所述大分子构建结合位点容积图。然后,构建包含每个所述结合位点容积图的容积组合的复合结合位点容积图。从该复合结合位点容积图可以构建相互作用图。 | ||
搜索关键词: | 用于 大分子 中的 结合 容积 系统 方法 | ||
【主权项】:
1. 评价大分子结合位点的方法,该方法包括:(A). 识别所述大分子的结合位点,其中该结合位点由多个残基排列形成,且其中该结合位点没有结合配体;(B). 确定所述结合位点的结合位点容积图,其中该结合位点容积图包含具有多个区域的表面;和(C). 将所述结合位点容积图的所述表面的多个区域的各个单独区域基于第一特征进行分类,该第一特征与该大分子的与该单独区域最接近的部分的第二特征互补,从而产生相互作用图。
下载完整专利技术内容需要扣除积分,VIP会员可以免费下载。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于弗·哈夫曼-拉罗切有限公司;化学计算集团公司,未经弗·哈夫曼-拉罗切有限公司;化学计算集团公司许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服】
本文链接:http://www.vipzhuanli.com/patent/200810126151.6/,转载请声明来源钻瓜专利网。
- 同类专利
- 专利分类
G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用