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[发明专利]Sanger基因测序结果快速判读方法、系统及介质-CN202310477930.5在审
发明人：王金鹏;黄金明;鞠志花;王秀革;高亚平;刘文浩;杨春红;肖遥;张亚冉;魏晓超;姜强;张桂香;刘丑生;邱小田;李姣;李广栋 -专利权人：山东省农业科学院畜牧兽医研究所;全国畜牧总站
申请日： 2023-04-25 - 公布日： 2023-10-24 - 主分类号： G16B20/30 文献下载
摘要：本发明属于基因测序领域，提供了一种Sanger基因测序结果快速判读方法、系统及介质。其中，Sanger基因测序结果快速判读方法包括获取Sanger基因测序文件，基于所述测序文件提取每个测序位点的四个碱基的信号值，判断每个测序位点的纯合或杂合状态，生成主要序列和次要序列；获取配置文件信息，根据靶位点的锚定序列在主序列中定位靶位点的位置，进而确定出靶位点的纯合或杂合状态并提取出主要序列和次要序列中的靶位点碱基，得到靶位点的基因型；根据靶位点的基因型及靶位点的位置，输出基因型或氨基酸报告。
sanger 基因结果快速判读方法系统介质

[发明专利]一种鉴定牛TDP-43基因启动子活性区域的方法-CN202310912114.2在审
发明人：张亚冉;张清兰;王金鹏;鞠志花;肖遥;杨春红;王秀革;魏晓超;高亚平;姜强;刘文浩;黄金明 -专利权人：山东省农业科学院畜牧兽医研究所
申请日： 2023-07-24 - 公布日： 2023-10-13 - 主分类号： C12Q1/6897 文献下载
摘要：本发明涉及一种鉴定牛TDP‑43基因启动子活性区域的方法，包括以下步骤：(1)牛TDP‑43基因启动子的克隆；(2)牛TDP‑43启动子5’端系列缺失片段荧光素酶报告基因载体的构建及鉴定；(3)牛TDP‑43基因启动子系列缺失片段转录活性分析及核心启动子区确定；(4)牛TDP‑43核心启动子区转录因子结合位点预测及筛选。通过本发明，为进一步筛选调控牛TDP‑43基因表达的转录因子、研究调控TDP‑43基因转录的具体机制提供了一种便捷高效的方法。
一种鉴定 tdp 43 基因启动子活性区域方法

[发明专利]一种筛选牛体高变异相关分子标记的方法及其应用-CN202111249291.4有效
发明人：张亚冉;黄金明;王金鹏;姜强;刘文浩;鞠志花;王秀革;魏晓超;高亚平;杨春红;肖遥;张建;蔡玲;王玲玲;高运东 -专利权人：山东省农业科学院畜牧兽医研究所;山东奥克斯畜牧种业有限公司
申请日： 2021-10-26 - 公布日： 2023-09-22 - 主分类号： C12Q1/6888 文献下载
摘要：本发明属于动物分子育种技术领域，涉及一种筛选牛体高变异相关分子标记的方法及其应用，所述分子标记包括位于GALNT8基因上的单核苷酸多态位点，分别为：rs133878668A﹥C、rs135659917A﹥G、rs210135533G﹥A和rs110000229A﹥G。利用全基因组关联分析方法结合基因型效应、环境效应及基因型与环境互作效应分析，准确高效地筛选体高变异相关的重要新候选基因和分子标记，方法科学合理，依据候选基因和标记设计的检测方法，具有操作简单快捷、结果准确性高和成本低的特点。
一种筛选牛体高变异相关分子标记方法及其应用

[发明专利]一种基于上升流的海草种子规模化长期保存系统及方法-CN202310108591.3有效
发明人： 高亚平;蒋增杰;王军威;王玮欣;张义涛;王斌 -专利权人：中国水产科学研究院黄海水产研究所;荣成楮岛水产有限公司
申请日： 2023-02-10 - 公布日： 2023-09-19 - 主分类号： A01G33/00 文献下载
摘要：本发明提供了一种基于上升流的海草种子规模化长期保存系统，包括若干个种子悬浮装置、进气管路、进水管路和回水管路，种子悬浮装置包括有机玻璃桶、气盘支架和分离网，所述气盘支架设置于距离有机玻璃桶的桶底的一定高度处，所述分离网设置于有机玻璃桶内且位于气盘支架的上方，所述进气管路连通于有机玻璃桶的下方，进水管路通过进水口连通于有机玻璃桶的底部，所述回水管路通过回水口连通于有机玻璃桶的上方。基于同一个发明构思，本发明还提供了一种基于上升流的海草种子规模化长期保存方法。本发明提供的一种基于上升流的海草种子规模化长期保存系统，鳗草种子保存期达12个月以上；在12个月后，种子萌发率保持在保存前的82.5‑83.1％。
一种基于上升海草种子规模化长期保存系统方法

[发明专利]文库制备方法和测序方法-CN202310558308.7在审
发明人：弗拉基米尔·巴什基洛夫;萨利姆·巴尔迪;何筠;田晖;伊戈尔·伊万诺夫;田梓轩;高亚平 -专利权人：安序源生物科技（深圳）有限公司
申请日： 2023-05-17 - 公布日： 2023-09-12 - 主分类号： C12Q1/6806 文献下载
摘要：本申请公开了文库制备方法和测序方法。本申请的第一方面提供一种文库制备方法，该文库制备方法包括以下步骤：提供双链核酸分子，打断，得到片段化产物；片段化产物经末端修复后加接头处理，得到接头产物；接头产物在外切酶作用下消化，得到消化产物；消化产物经滚环扩增，得到文库；接头包括依次的第一序列、第二序列和第三序列，第一序列和第三序列至少部分反向互补，使接头形成茎环结构。本方案中将双链核酸分子制备成环形DNA，并通过滚换扩增得到多拷贝文库，实现单一样本的多次测序，提高测序的准确度。采用这一文库制备方法，由于特定的接头结构的选择，可以将打断后的长度控制在较长水平，减少拼接成本，节省内存和计算时间。
文库制备方法

[发明专利]一种筛选牛寒冷气候适应基因DNAJC18和功能性分子标记的方法及其应用-CN202211273521.5在审
发明人：黄宁;赵立虹;王金鹏;高亚平;肖遥;魏晓超;鞠志花;张亚冉;杨春红;刘文浩;黄金明 -专利权人：山东省农业科学院畜牧兽医研究所;山东省农业机械科学研究院
申请日： 2022-10-18 - 公布日： 2023-08-15 - 主分类号： C12Q1/6888 文献下载
摘要：本发明属于动物遗传育种技术领域，具体涉及一种筛选牛寒冷气候适应基因DNAJC18和功能性分子标记的方法及其应用。本发明选择分布于北方和南方的牛品种，利用牛高密度SNP芯片进行基因分型，整合FLK和hapFLK两种基因组选择信号分析方法，比较分析南北方牛之间和牛品种内的基因组选择信号，鉴定受到强烈选择的区域和正选择基因，筛选出适应寒冷环境的基因及其分子标记；并利用牛的重测序数据进一步挖掘潜在的功能标记，并建立相应检测技术。本发明为寒冷地区特色牛品种的培育等分子育种提供了科学依据和简单易行的检测技术；同时对于地方牛品种遗传资源的保护、评价和利用具有重要意义和价值。
一种筛选寒冷气候适应基因 dnajc18 功能分子标记方法及其应用

[发明专利]一种改进型水沙、水污分离装置-CN202310228187.X在审
发明人：宋剑鹏;高亚平;李慧芳 -专利权人：新疆兵团勘测设计院集团股份有限公司
申请日： 2023-03-10 - 公布日： 2023-07-18 - 主分类号： B01D36/04 文献下载
摘要：本发明公开了水沙、水污分离技术领域的一种改进型水沙、水污分离装置，包括沉淀池，所述沉淀池上设置有进水口一，所述沉淀池的底部设置有主排沙管，所述沉淀池的底部还设置有多个和主排沙管连通的气囊排沙管，所述沉淀池远离进水口一的一端设置有汇流池，所述沉淀池上设置有用于将沉淀池内水排进汇流池内的过滤管，所述沉淀池内靠近进水口一的一端设置有孔板稳流堰，本发明有利于沉淀的进行。
一种改进型分离装置

[实用新型]一种房屋维护用的墙面打磨装置-CN202320632726.1有效
发明人：项一鸣;高亚平 -专利权人：安徽中班工程设计集团有限公司
申请日： 2023-03-28 - 公布日： 2023-07-14 - 主分类号： B24B7/18 文献下载
摘要：本实用新型涉及建筑墙体改造技术领域，且公开了一种房屋维护用的墙面打磨装置，包括底座，所述底座上侧的左右两端均固定安装液压缸，所述液压缸伸缩端固定连接收集盒，所述收集盒下侧的中部固定连接支撑杆，所述收集盒上侧的左右两端均固定安装吸尘机，所述收集盒上侧的中部固定连接打磨组件；所述打磨组件包括立柱，所述立柱上侧的中部固定连接打磨台，所述打磨台表面的中部固定安装驱动电机。该房屋维护用的墙面打磨装置，通过打磨片对墙面打磨，打磨所产生的粉尘被吸尘机配合收集盒表面开设的收集孔吸入收集柜上侧集中处理，减少人力使用同时还能提高打磨效率减少环境的污染。
一种房屋维护墙面打磨装置

[发明专利]一种突变型DNA聚合酶及其制备方法与应用-CN202310363753.8在审
发明人：孙亚萍;何筠;付康;田晖;伊戈尔·伊万诺夫;高亚平 -专利权人：安序源生物科技（深圳）有限公司
申请日： 2023-04-03 - 公布日： 2023-06-27 - 主分类号： C12N9/12 文献下载
摘要：本发明涉及分子生物学技术领域，公开了一种突变型DNA聚合酶及其制备方法与应用，该突变型DNA聚合酶的氨基酸序列如SEQ ID NO.4所示，该氨基酸序列是在野生型FWT聚合酶的基础上突变得到，其突变位点包括：第80位的丙氨酸突变为精氨酸、第107位的天冬酰胺突变为天冬氨酸、第172位的谷氨酸突变为精氨酸、第325位的天冬酰胺突变为天冬氨酸、第423位的天冬氨酸突变为丙氨酸、第490位的丝氨酸突变为丙氨酸、第491位的苯丙氨酸突变为丙氨酸。该突变型DNA聚合酶在室温条件下具有相比于野生型更好的持续合成、链置换以及耐高盐能力，是滚环扩增和多重置换扩增的理想工具。
一种突变型 dna 聚合及其制备方法应用

[发明专利]单链环化文库及其构建方法和应用-CN202310159630.2在审
发明人：弗拉基米尔·巴什基洛夫;高亚平;萨利姆·巴尔迪;何筠;田晖;伊戈尔·伊万诺夫;王壹;田梓轩;夏礼兵 -专利权人：安序源生物科技（深圳）有限公司
申请日： 2023-02-16 - 公布日： 2023-06-23 - 主分类号： C12Q1/6806 文献下载
摘要：本发明属于基因测序领域，公开了单链环化文库及其构建方法和应用。构建方法：对目标DNA进行打断、末端修复和接头连接，得连接产物；对连接产物进行PCR扩增，得扩增产物；将扩增产物与辅助环化引物混合，加热使扩增产物与辅助环化引物连接，然后加入连接酶，孵育后得单链环化文库，其长度为500～2000bp。本发明还提出根据上述方法构建的单链环化文库；还提出一种长片段DNA的测序方法，以上述单链环化文库为对象进行测序。本发明的构建方法能够构建出长度为500～2000bp的单链环化文库，可用于长读长测序，且可以提高测序的准确度。
链环文库及其构建方法应用

[发明专利]一种SNP分子标记在鉴定高繁殖性能奶牛及辅助育种中的应用-CN202111080861.1有效
发明人：王金鹏;黄金明;鞠志花;杨春红;高运东;刘文浩;肖遥;张亚冉;魏晓超;高亚平;姜强;王秀革;王玲玲;赵秀新;张元沛;周萌 -专利权人：山东省农业科学院畜牧兽医研究所;山东奥克斯畜牧种业有限公司
申请日： 2021-09-15 - 公布日： 2023-06-13 - 主分类号： C12N15/11 文献下载
摘要：本发明涉及一种SNP分子标记在鉴定高繁殖性能奶牛及辅助育种中的应用，属于生物化学遗传育种技术领域，具体通过牛50K SNP芯片和全基因组关联分析的方法提供了SIGLEC12基因作为奶牛妊娠期标记基因的应用，并通过分子生物学相关技术提供了SIGLEC12基因第七外显子的一组单倍型的信息，可用于选择具有优势妊娠周期基因型的奶牛个体。养殖企业通过选择优势基因型个体留种，可以提高SIGLEC12基因妊娠周期优势基因型在奶牛群体中的频率，从而优化奶牛群体的妊娠周期，提高奶牛的繁殖效率，降低养殖成本，增加经济效益。本发明为加速奶牛的妊娠周期遗传改良提供了一种新的方法。
一种 snp 分子标记鉴定繁殖性能奶牛辅助育种中的应用

[发明专利]DNA聚合酶的前稳态酶促反应动力学参数的测定方法-CN201911038986.0有效
发明人： 高亚平;田晖;何筠;杨照亮;伊戈尔·伊万诺夫 -专利权人：深圳清华大学研究院;安序源生物科技（深圳）有限公司
申请日： 2019-10-29 - 公布日： 2023-06-13 - 主分类号： C12Q1/6818 文献下载
摘要：本发明涉及一种DNA聚合酶的前稳态酶促反应动力学参数的测定方法，该方法包括以下步骤：提供待补平模板和底物，待补平模板包括模板链和与部分模板链配对结合的引物链；将包括不同浓度的第二标记的核苷酸的底物分别与待补平模板和足量的DNA聚合酶混合，以进行延伸反应，并采用停流光谱法检测各延伸反应的荧光强度变化，得到多个荧光强度变化速度；及根据荧光强度变化速度及对应的第二标记的核苷酸的浓度，得到DNA聚合酶的动力学参数。上述方法测定DNA聚合酶的前稳态酶促反应动力学参数准确性更高。
dna 聚合稳态反应动力学参数测定方法

[发明专利]一种环状DNA的制备方法-CN201910968892.7有效
发明人： 高亚平;田晖;何筠;邓素华;伊戈尔·伊万诺夫 -专利权人：深圳清华大学研究院;安序源生物科技（深圳）有限公司
申请日： 2019-10-12 - 公布日： 2023-06-06 - 主分类号： C12Q1/6806 文献下载
摘要：本公开提供了一种环状DNA的制备方法，所述环状DNA的制备方法的具体步骤为：(1)首先合成需要成环的单链DNA分子，然后在合成的单链DNA分子的5’端做磷酸化修饰；(2)然后设计合成引导RNA分子，所述引导RNA分子的核苷酸序列与合成的单链DNA分子两端的核苷酸互补配对；(3)将合成的单链DNA分子和引导RNA分子进行退火，获得退火产物；(4)利用连接酶对得到的退火产物进行连接反应，得到连接反应产物；(5)利用核酸外切酶消化连接产物中未成环的线性核苷酸；(6)最后回收合成的单链环状DNA分子。所述制备方法简单易操作，且在方法中所使用的材料成本低，降低了制备环状DNA的成本。
一种环状 dna 制备方法

[发明专利]一种用于双壳贝类幼体延迟变态的装置及其使用方法-CN202210575558.7有效
发明人：杜美荣;蒋增杰;吴彪;姜娓娓;房景辉;高亚平;蔺凡;李瑞环 -专利权人：中国水产科学研究院黄海水产研究所
申请日： 2022-05-25 - 公布日： 2023-06-02 - 主分类号： A01K63/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种用于双壳贝类幼体延迟变态的装置及其使用方法，属于生物实验装置领域，所述装置包括幼虫培育池、温控池及温控系统、定时投喂模块、定时换水模块、涡旋延迟变态模块和排污模块，幼虫培育池为圆柱形桶身，涡旋延迟变态模块包括充气泵、充气管和调节阀门组成；涡旋延迟变态模块通过不间断充气在圆柱形桶内部形成沿圆柱形桶周向旋转的涡流；本发明装置能够延长幼虫匍匐期，延迟变态，延长获取幼虫实验材料的时间。温控精准，使用方便，提高幼虫成活率，培育的幼虫活跃度高，摄食状态良好，有利于下一步实验的开展；且本发明装置自动化程度高，降低人的参与度，减少工作量，节省人力，同时集成程度高，便于携带、运输。
一种用于贝类幼体延迟变态装置及其使用方法

[发明专利]双链环化文库及其构建方法和应用-CN202310173104.1在审
发明人：弗拉基米尔·巴什基洛夫;萨利姆·巴尔迪;田梓轩;何筠;田晖;伊戈尔·伊万诺夫;高亚平 -专利权人：安序源生物科技（深圳）有限公司
申请日： 2023-02-22 - 公布日： 2023-05-26 - 主分类号： C12Q1/6806 文献下载
摘要：本发明属于基因测序领域，公开了双链环化文库及其构建方法和应用。构建方法：对目标DNA进行打断、末端修复和接头连接，得连接产物；对连接产物进行PCR扩增，得扩增产物；使用尿嘧啶特异性切除试剂在扩增产物的尿嘧啶位置切割，得包含缺口的消化产物；将包含缺口的消化产物与连接酶混合，孵育后得双链环化文库，其长度为200～8000nt。本发明还提出根据所述构建方法构建的双链环化文库，以及一种长片段DNA的测序方法，该方法以上述双链环化文库为对象进行测序。本发明的构建方法能够构建出长度为200～8000nt的双链环化文库，可用于长读长测序，且可以提高测序的准确度。
链环文库及其构建方法应用

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